More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3179 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_0366  adenylosuccinate synthetase  82.83 
 
 
430 aa  735    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3179  adenylosuccinate synthetase  100 
 
 
431 aa  871    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0875  adenylosuccinate synthetase  83.29 
 
 
430 aa  734    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0603  adenylosuccinate synthetase  77.73 
 
 
430 aa  694    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1969  adenylosuccinate synthetase  87.87 
 
 
437 aa  787    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.769944  normal  0.0974254 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2010  adenylosuccinate synthetase  83.06 
 
 
430 aa  736    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.34638  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2742  adenylosuccinate synthetase  90.95 
 
 
431 aa  797    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0436902 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5638  adenylosuccinate synthase  70.77 
 
 
430 aa  628  1e-179  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.171619  normal  0.25149 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6845  adenylosuccinate synthase  71.69 
 
 
430 aa  624  1e-178  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1683  adenylosuccinate synthetase  70.07 
 
 
429 aa  618  1e-176  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.469628  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1627  adenylosuccinate synthetase  70.07 
 
 
533 aa  620  1e-176  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7581  adenylosuccinate synthetase  71 
 
 
430 aa  620  1e-176  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2683  adenylosuccinate synthetase  70.77 
 
 
429 aa  619  1e-176  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4682  adenylosuccinate synthetase  71.23 
 
 
429 aa  618  1e-176  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1231  adenylosuccinate synthetase  70.53 
 
 
429 aa  618  1e-176  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2144  adenylosuccinate synthase  67.98 
 
 
430 aa  615  1e-175  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1007  Adenylosuccinate synthase  69.14 
 
 
431 aa  614  1e-175  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0196756 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0037  adenylosuccinate synthetase  69 
 
 
448 aa  612  9.999999999999999e-175  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.505248  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3089  adenylosuccinate synthetase  68.75 
 
 
432 aa  608  1e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.126084  normal  0.070043 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3346  adenylosuccinate synthetase  69.21 
 
 
432 aa  610  1e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.474516  hitchhiker  0.00582802 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2616  adenylosuccinate synthetase  68.98 
 
 
432 aa  605  9.999999999999999e-173  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.199466  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0262  adenylosuccinate synthase  68.45 
 
 
431 aa  606  9.999999999999999e-173  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0940  Adenylosuccinate synthase  68.21 
 
 
430 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1106  adenylosuccinate synthetase  68.45 
 
 
429 aa  601  1.0000000000000001e-171  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0999  adenylosuccinate synthase  68.21 
 
 
448 aa  601  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.595096  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0510  adenylosuccinate synthetase  68.91 
 
 
429 aa  603  1.0000000000000001e-171  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.37093  normal  0.446838 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3159  adenylosuccinate synthetase  67.82 
 
 
432 aa  603  1.0000000000000001e-171  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0558  adenylosuccinate synthetase  68.07 
 
 
429 aa  601  1.0000000000000001e-171  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00595695 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0962  Adenylosuccinate synthase  67.98 
 
 
430 aa  599  1e-170  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.470264  normal  0.45689 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2965  adenylosuccinate synthetase  66.67 
 
 
430 aa  598  1e-170  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.125391  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1123  adenylosuccinate synthetase  67.13 
 
 
457 aa  600  1e-170  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.565795  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3894  adenylosuccinate synthetase  66.2 
 
 
430 aa  594  1e-169  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.108834  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3544  adenylosuccinate synthetase  68.29 
 
 
432 aa  597  1e-169  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1330  adenylosuccinate synthetase  66.43 
 
 
430 aa  593  1e-168  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.396862  normal  0.220841 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4086  adenylosuccinate synthetase  65.97 
 
 
430 aa  592  1e-168  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0852587 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1850  adenylosuccinate synthetase  65.97 
 
 
430 aa  592  1e-168  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4774  adenylosuccinate synthetase  66.2 
 
 
430 aa  590  1e-167  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.114501  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0658  adenylosuccinate synthetase  67.37 
 
 
428 aa  584  1.0000000000000001e-165  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.163412  normal  0.505489 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0285  adenylosuccinate synthetase  63.81 
 
 
429 aa  572  1.0000000000000001e-162  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2784  adenylosuccinate synthetase  63.11 
 
 
429 aa  546  1e-154  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.436445  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0475  adenylosuccinate synthetase  62.88 
 
 
429 aa  539  9.999999999999999e-153  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.636476  hitchhiker  0.00197029 
 
 
-
 
NC_002978  WD0337  adenylosuccinate synthetase  55.04 
 
 
425 aa  498  1e-139  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.112659  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0564  adenylosuccinate synthetase  49.3 
 
 
431 aa  467  9.999999999999999e-131  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0607  adenylosuccinate synthetase  54.67 
 
 
432 aa  466  9.999999999999999e-131  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.272974 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0461  adenylosuccinate synthetase  50.93 
 
 
430 aa  467  9.999999999999999e-131  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1523  adenylosuccinate synthetase  53.95 
 
 
442 aa  466  9.999999999999999e-131  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000140547  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3379  adenylosuccinate synthetase  54.17 
 
 
436 aa  462  1e-129  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2974  adenylosuccinate synthetase  53.7 
 
 
435 aa  460  9.999999999999999e-129  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.823957 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2007  adenylosuccinate synthetase  53.74 
 
 
431 aa  458  9.999999999999999e-129  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00017376  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1978  adenylosuccinate synthetase  53.85 
 
 
432 aa  455  1e-127  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6526  adenylosuccinate synthetase  54.55 
 
 
432 aa  456  1e-127  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.768523 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6675  adenylosuccinate synthase  54.78 
 
 
432 aa  457  1e-127  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.250077 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5832  adenylosuccinate synthase  54.78 
 
 
432 aa  456  1e-127  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6199  adenylosuccinate synthase  54.78 
 
 
453 aa  456  1e-127  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0247215 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5753  adenylosuccinate synthase  54.08 
 
 
429 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.590489 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0578  adenylosuccinate synthetase  54.91 
 
 
432 aa  452  1.0000000000000001e-126  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000001206 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0518  adenylosuccinate synthetase  52.33 
 
 
430 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.289891  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5997  adenylosuccinate synthase  54.31 
 
 
429 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.140056  normal  0.195081 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3308  adenylosuccinate synthetase  51.39 
 
 
433 aa  449  1e-125  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00120298  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5667  adenylosuccinate synthetase  54.65 
 
 
430 aa  449  1e-125  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2180  adenylosuccinate synthetase  53.02 
 
 
432 aa  449  1e-125  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000134883  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0641  adenylosuccinate synthetase  54.88 
 
 
431 aa  450  1e-125  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00143682 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02633  adenylosuccinate synthetase  52.21 
 
 
430 aa  449  1e-125  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0662  adenylosuccinate synthetase  51.4 
 
 
431 aa  449  1e-125  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.681047  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5326  adenylosuccinate synthase  55.24 
 
 
432 aa  451  1e-125  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0668634 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65230  adenylosuccinate synthetase  54.65 
 
 
430 aa  449  1e-125  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0330  adenylosuccinate synthetase  53.61 
 
 
431 aa  447  1.0000000000000001e-124  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4937  adenylosuccinate synthetase  53.97 
 
 
430 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00585  adenylosuccinate synthetase  53.85 
 
 
432 aa  446  1.0000000000000001e-124  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0726  adenylosuccinate synthetase  54.19 
 
 
431 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0654832  hitchhiker  0.0000471969 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0577  adenylosuccinate synthetase  53.97 
 
 
430 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3251  adenylosuccinate synthetase  51.04 
 
 
430 aa  445  1.0000000000000001e-124  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.220385  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4680  adenylosuccinate synthetase  53.85 
 
 
430 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3649  adenylosuccinate synthetase  54.19 
 
 
431 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000709559  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0441  adenylosuccinate synthetase  52.66 
 
 
435 aa  445  1.0000000000000001e-124  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.83493  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1434  adenylosuccinate synthetase  52 
 
 
459 aa  446  1.0000000000000001e-124  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.104272  normal  0.451204 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0705  adenylosuccinate synthetase  54.42 
 
 
431 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00343177  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0695  adenylosuccinate synthetase  52.91 
 
 
431 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000192259  hitchhiker  0.0000489804 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3266  adenylosuccinate synthetase  52.91 
 
 
431 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000110825  hitchhiker  0.0000153755 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0681  adenylosuccinate synthetase  52.91 
 
 
431 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00011524  hitchhiker  0.00031126 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3357  adenylosuccinate synthetase  53.15 
 
 
431 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0113184  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0735  adenylosuccinate synthetase  54.19 
 
 
431 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000671232  hitchhiker  0.000922598 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0747  adenylosuccinate synthetase  54.19 
 
 
431 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000703533  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4889  adenylosuccinate synthetase  53.38 
 
 
430 aa  443  1e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0250802  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1784  adenylosuccinate synthetase  53.15 
 
 
430 aa  442  1e-123  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4941  adenylosuccinate synthetase  53.38 
 
 
430 aa  443  1e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00348011 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3937  adenylosuccinate synthetase  52.68 
 
 
431 aa  443  1e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4765  adenylosuccinate synthetase  53.38 
 
 
430 aa  443  1e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0497  adenylosuccinate synthetase  51.52 
 
 
432 aa  443  1e-123  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0903  Adenylosuccinate synthase  52.82 
 
 
430 aa  442  1e-123  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.546302  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1939  adenylosuccinate synthetase  52.46 
 
 
431 aa  442  1e-123  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2661  adenylosuccinate synthetase  52.8 
 
 
431 aa  443  1e-123  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1583  adenylosuccinate synthetase  51.61 
 
 
440 aa  442  1e-123  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.147694  unclonable  0.000000227018 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0509  adenylosuccinate synthetase  52.91 
 
 
431 aa  444  1e-123  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00567032  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0436  adenylosuccinate synthetase  52.21 
 
 
432 aa  443  1e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000472279 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3069  adenylosuccinate synthetase  52.68 
 
 
431 aa  443  1e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00455582  normal  0.136181 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0215  adenylosuccinate synthetase  54.42 
 
 
432 aa  444  1e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3592  adenylosuccinate synthetase  52.79 
 
 
431 aa  444  1e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000897035  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07600  Adenylosuccinate synthetase  52.79 
 
 
430 aa  443  1e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1719  adenylosuccinate synthetase  52.91 
 
 
430 aa  440  9.999999999999999e-123  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>