More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0296 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_0296  glutaredoxin GrxC  100 
 
 
86 aa  180  7e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2903  glutaredoxin GrxC  62.35 
 
 
85 aa  122  1e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.844851  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1737  glutaredoxin 3  64.71 
 
 
85 aa  118  3e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3507  glutaredoxin-3  61.9 
 
 
85 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.838286 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2855  glutaredoxin 3  64.29 
 
 
85 aa  114  6e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.995757  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1194  glutaredoxin  64.29 
 
 
85 aa  114  6e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2632  glutaredoxin 3  63.1 
 
 
85 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2263  glutaredoxin 3  56.47 
 
 
85 aa  106  9.000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0554842  normal  0.925585 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3005  glutaredoxin 3  58.33 
 
 
93 aa  106  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3531  glutaredoxin 3  57.65 
 
 
85 aa  105  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.182347  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0940  glutaredoxin 3  55.29 
 
 
84 aa  104  3e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.602401 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3822  glutaredoxin 3  56.47 
 
 
85 aa  104  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3284  glutaredoxin  61.25 
 
 
88 aa  104  5e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3475  glutaredoxin 3  56.47 
 
 
85 aa  102  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.786248 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0325  glutaredoxin 3  55.42 
 
 
87 aa  102  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.193454 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3277  glutaredoxin 3  56.47 
 
 
85 aa  102  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3601  glutaredoxin 3  56.47 
 
 
85 aa  102  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.186342  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5356  glutaredoxin 3  53.49 
 
 
92 aa  101  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.460524  normal  0.957848 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0368  glutaredoxin 3  57.14 
 
 
85 aa  100  8e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5953  glutaredoxin 3  50.59 
 
 
85 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0694003  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0716  glutaredoxin 3  57.14 
 
 
83 aa  99  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5216  glutaredoxin 3  52.38 
 
 
85 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.112627  normal  0.0289282 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1402  glutaredoxin 3  50.6 
 
 
85 aa  98.6  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0738  glutaredoxin GrxC  55.29 
 
 
88 aa  98.2  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.218135  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3613  glutaredoxin 3  55.29 
 
 
85 aa  98.2  3e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.842003  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3969  glutaredoxin 3  54.12 
 
 
84 aa  97.8  4e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2586  glutaredoxin 3  55.42 
 
 
88 aa  97.4  5e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.630404 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0044  glutaredoxin 3  54.22 
 
 
89 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.31587  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0826  glutaredoxin 3  49.4 
 
 
96 aa  95.9  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1651  glutaredoxin 3  52.94 
 
 
84 aa  95.5  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.948811 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00542  glutaredoxin 3 GrxC  56.63 
 
 
86 aa  95.5  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0306  glutaredoxin GrxC  52.33 
 
 
85 aa  94.4  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1946  glutaredoxin 3  52.38 
 
 
84 aa  94.4  5e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3089  glutaredoxin 3  50 
 
 
84 aa  94.4  5e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.393298  normal  0.343511 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0536  glutaredoxin 3  48.84 
 
 
87 aa  94.4  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0558  glutaredoxin 3  52.94 
 
 
88 aa  94.4  5e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0977481  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4179  putative glutaredoxin 3  48.84 
 
 
87 aa  94.4  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2958  glutaredoxin  50.59 
 
 
84 aa  94  6e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0186705 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2133  glutaredoxin family protein  56.47 
 
 
87 aa  93.6  9e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2400  glutaredoxin, GrxC  50.57 
 
 
87 aa  93.2  9e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1835  glutaredoxin GrxC  50.6 
 
 
86 aa  92.8  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7595  glutaredoxin 3  51.76 
 
 
90 aa  93.2  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0365143 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2714  glutaredoxin 3  50.59 
 
 
84 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2122  glutaredoxin GrxC  52.94 
 
 
85 aa  92  2e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3239  glutaredoxin 3  50.59 
 
 
84 aa  92  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.165531  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0268  glutaredoxin 3  49.38 
 
 
82 aa  92.4  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3901  glutaredoxin 3  53.01 
 
 
83 aa  91.3  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.174559 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2323  glutaredoxin GrxC  53.01 
 
 
87 aa  91.3  4e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2509  glutaredoxin 3  50.59 
 
 
85 aa  91.3  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.281464  normal  0.240151 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0355  glutaredoxin 3 (GRX3) protein  47.67 
 
 
85 aa  91.3  5e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.119855 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4139  glutaredoxin 3  51.81 
 
 
82 aa  90.9  5e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.451689  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2076  glutaredoxin 3  46.91 
 
 
101 aa  90.9  5e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0071  glutaredoxin 3  51.81 
 
 
82 aa  90.9  5e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4027  glutaredoxin 3  53.01 
 
 
83 aa  90.9  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3982  glutaredoxin 3  53.01 
 
 
83 aa  90.9  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.592495  normal  0.830419 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3920  glutaredoxin 3  53.01 
 
 
83 aa  90.9  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0077  glutaredoxin 3  51.81 
 
 
82 aa  90.9  5e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4088  glutaredoxin 3  53.01 
 
 
83 aa  90.9  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4244  glutaredoxin 3  52.94 
 
 
86 aa  90.5  6e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.119016 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02490  glutaredoxin 3  49.38 
 
 
102 aa  90.9  6e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0519  glutaredoxin GrxC  47.06 
 
 
113 aa  90.5  7e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.223671 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2772  glutaredoxin 3  48.84 
 
 
86 aa  90.1  9e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2866  glutaredoxin 3  48.84 
 
 
86 aa  89.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.725322 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3300  glutaredoxin 3  49.4 
 
 
85 aa  89.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0602  glutaredoxin 3  51.81 
 
 
91 aa  90.1  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0496  glutaredoxin  52.38 
 
 
84 aa  89.4  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.460095  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2241  glutaredoxin GrxC  48.84 
 
 
86 aa  89.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.747131  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1029  glutaredoxin 3  52.94 
 
 
88 aa  89.4  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2855  glutaredoxin 3  48.84 
 
 
86 aa  89.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0808  glutaredoxin 3  45.98 
 
 
87 aa  90.1  1e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.166784  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03468  glutaredoxin 3  50.6 
 
 
83 aa  89  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0095  glutaredoxin 3  50.6 
 
 
83 aa  89  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04690  Dithiol-glutaredoxin protein  52.38 
 
 
84 aa  89  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.981866  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0499  glutaredoxin 3  47.67 
 
 
86 aa  89  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4983  glutaredoxin 3  50.6 
 
 
83 aa  89  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3206  glutaredoxin 3  47.67 
 
 
86 aa  89  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0480  glutaredoxin 3  47.67 
 
 
86 aa  89  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3822  glutaredoxin 3  50.6 
 
 
83 aa  89  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2840  glutaredoxin 3  47.67 
 
 
86 aa  89  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0179  glutaredoxin 3  47.67 
 
 
86 aa  89  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0335  glutaredoxin GrxC  51.76 
 
 
84 aa  89  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.157321  normal  0.584711 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0098  glutaredoxin 3  50.6 
 
 
83 aa  89  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0025  glutaredoxin GrxC  48.24 
 
 
91 aa  88.6  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3541  glutaredoxin 3  47.06 
 
 
110 aa  89  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00379467 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3947  glutaredoxin 3  50.6 
 
 
83 aa  89  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.824691 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2348  glutaredoxin 3  47.67 
 
 
115 aa  89  2e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000217379  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2363  glutaredoxin 3  47.06 
 
 
94 aa  88.6  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1413  glutaredoxin 3  47.67 
 
 
86 aa  89  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1905  glutaredoxin 3  50 
 
 
86 aa  89.4  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0252  glutaredoxin GrxC  48.84 
 
 
85 aa  89  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1996  glutaredoxin 3  47.06 
 
 
94 aa  88.6  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.629253  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4114  glutaredoxin 3  50.6 
 
 
83 aa  89  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0211  glutaredoxin 3  48.84 
 
 
85 aa  89.4  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.154177 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4038  glutaredoxin 3  50.6 
 
 
83 aa  89  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03419  hypothetical protein  50.6 
 
 
83 aa  89  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0230  glutaredoxin 3  48.84 
 
 
85 aa  89.4  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.53184  hitchhiker  0.00238728 
 
 
-
 
NC_004310  BR1876  glutaredoxin 3  53.01 
 
 
88 aa  88.2  3e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1807  glutaredoxin 3  53.01 
 
 
88 aa  88.2  3e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.433283  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0125  glutaredoxin 3  49.4 
 
 
82 aa  88.6  3e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1703  glutaredoxin 3  45.88 
 
 
85 aa  87.8  4e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>