More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3755 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_3755  FolC bifunctional protein  100 
 
 
461 aa  891    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0263882  normal  0.48991 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2475  folylpolyglutamate synthetase  40.59 
 
 
424 aa  240  4e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3348  FolC bifunctional protein  40.55 
 
 
424 aa  224  3e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3277  FolC bifunctional protein  38.62 
 
 
424 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2209  FolC bifunctional protein  33.33 
 
 
429 aa  219  8.999999999999998e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.791737  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0897  FolC bifunctional protein  40 
 
 
424 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.54283e-31 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1671  FolC bifunctional protein  37.38 
 
 
431 aa  216  5.9999999999999996e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.239696  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0467  FolC bifunctional protein  38.23 
 
 
434 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000374021  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4360  FolC bifunctional protein  35.91 
 
 
459 aa  214  2.9999999999999995e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0351  FolC bifunctional protein  40 
 
 
414 aa  211  3e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.651098 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1456  FolC bifunctional protein  42.89 
 
 
461 aa  210  4e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.363059  normal  0.651546 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0738  folylpolyglutamate synthetase; dihydrofolate synthetase  39.03 
 
 
422 aa  207  4e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00754435  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01530  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  36.59 
 
 
466 aa  205  1e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0193239 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0218  folylpolyglutamate synthase  35.65 
 
 
543 aa  204  2e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.296373  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0533  FolC bifunctional protein  37.02 
 
 
440 aa  204  3e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.861672 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1160  FolC bifunctional protein  36.93 
 
 
425 aa  204  3e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0333  FolC bifunctional protein  42.36 
 
 
414 aa  203  4e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0256813  normal  0.0230172 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0059  FolC bifunctional protein  36.51 
 
 
421 aa  203  6e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.873383  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1447  FolC bifunctional protein  32.18 
 
 
424 aa  201  1.9999999999999998e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1487  FolC bifunctional protein  37.33 
 
 
448 aa  199  9e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00152366  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4359  FolC bifunctional protein  36.3 
 
 
427 aa  198  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.601802  normal  0.624925 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09160  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  37.67 
 
 
464 aa  197  3e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.2219 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0119  FolC bifunctional protein  34.95 
 
 
447 aa  197  3e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.205687 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2305  FolC bifunctional protein  35.25 
 
 
430 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.639794  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1384  FolC bifunctional protein  30.75 
 
 
428 aa  196  6e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0464  bifunctional protein FolC  34.52 
 
 
485 aa  196  7e-49  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1618  FolC bifunctional protein  34.56 
 
 
421 aa  196  7e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0841806  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1911  folylpolyglutamate synthetase  39.69 
 
 
422 aa  196  9e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.553938 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1648  hypothetical protein  32.49 
 
 
416 aa  196  9e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1653  dihydrofolate synthase  35.1 
 
 
421 aa  196  9e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0133997  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2368  folC bifunctional protein  41.88 
 
 
381 aa  194  2e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.183429  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2780  FolC bifunctional protein  38.8 
 
 
437 aa  195  2e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.38262  normal  0.709673 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2983  FolC bifunctional protein  37.26 
 
 
421 aa  194  3e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00108921  normal  0.642049 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2510  FolC bifunctional protein  43.6 
 
 
403 aa  194  4e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000623947 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2149  FolC bifunctional protein  38.15 
 
 
421 aa  194  4e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.341709  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0295  FolC bifunctional protein  39.19 
 
 
426 aa  193  5e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1472  FolC bifunctional protein  44.47 
 
 
425 aa  193  6e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0335611  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3067  FolC bifunctional protein  34.6 
 
 
431 aa  193  7e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1236  FolC bifunctional protein  39.54 
 
 
428 aa  193  7e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3345  FolC bifunctional protein  36.05 
 
 
429 aa  192  1e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.63219  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2174  FolC bifunctional protein  31.03 
 
 
441 aa  192  1e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1480  FolC bifunctional protein  36.02 
 
 
432 aa  192  1e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.293616  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2552  FolC bifunctional protein  34.02 
 
 
431 aa  191  2e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0970266  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0544  FolC bifunctional protein  33.33 
 
 
425 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1885  FolC bifunctional protein  30.96 
 
 
441 aa  190  4e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1997  FolC bifunctional protein  36.67 
 
 
436 aa  189  7e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.708043 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1568  FolC bifunctional protein  29.25 
 
 
432 aa  189  7e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0880  FolC bifunctional protein  33.26 
 
 
431 aa  189  7e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1159  FolC bifunctional protein  38.55 
 
 
448 aa  189  7e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728641  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2492  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  35.24 
 
 
431 aa  189  9e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1427  FolC bifunctional protein  35.68 
 
 
432 aa  188  1e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.361934  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1883  FolC bifunctional protein  30.47 
 
 
407 aa  189  1e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1166  FolC bifunctional protein  32.27 
 
 
428 aa  188  2e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2835  FolC bifunctional protein  34.7 
 
 
423 aa  187  2e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.353544  hitchhiker  0.00994834 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2741  FolC bifunctional protein  34.7 
 
 
423 aa  188  2e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.778738  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1166  FolC bifunctional protein  38.08 
 
 
452 aa  188  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.343564  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12370  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  37.42 
 
 
470 aa  188  2e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.867028  normal  0.34816 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1618  FolC bifunctional protein  34.7 
 
 
423 aa  188  2e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.029027  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07720  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  41.85 
 
 
427 aa  187  3e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.278263 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1258  FolC bifunctional protein  44.09 
 
 
408 aa  187  4e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2758  FolC bifunctional protein  34.47 
 
 
423 aa  187  4e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.273906  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3764  FolC bifunctional protein  36.43 
 
 
435 aa  187  5e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1510  FolC bifunctional protein  28.31 
 
 
413 aa  186  7e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1492  FolC bifunctional protein  36.16 
 
 
432 aa  186  9e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.744207  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0944  FolC bifunctional protein  41.74 
 
 
412 aa  186  1.0000000000000001e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2605  FolC bifunctional protein  44.61 
 
 
408 aa  186  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0759  FolC bifunctional protein  31.82 
 
 
437 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1531  FolC bifunctional protein  37.14 
 
 
435 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.468548  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0782  FolC bifunctional protein  31.82 
 
 
435 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2329  FolC bifunctional protein  36.38 
 
 
426 aa  184  2.0000000000000003e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1963  FolC bifunctional protein  38.67 
 
 
432 aa  184  2.0000000000000003e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3470  FolC bifunctional protein  39.11 
 
 
460 aa  183  6e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00143451  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1264  FolC bifunctional protein  36.14 
 
 
437 aa  183  7e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1404  FolC bifunctional protein  34.35 
 
 
438 aa  182  1e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.327079 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2308  FolC bifunctional protein  37.53 
 
 
442 aa  182  1e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.000000091683  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0344  FolC bifunctional protein  28.6 
 
 
435 aa  181  2e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0325  dihydropteroate synthase  38.48 
 
 
878 aa  181  2e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.899871  normal  0.0161218 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2054  FolC bifunctional protein  37.33 
 
 
508 aa  182  2e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.832058  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7286  FolC bifunctional protein  38.15 
 
 
440 aa  181  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0401599  normal  0.82683 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2440  FolC bifunctional protein  36.87 
 
 
423 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.715138  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2698  FolC bifunctional protein  44.85 
 
 
408 aa  181  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.713349  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1041  FolC bifunctional protein  31.14 
 
 
451 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3683  folylpolyglutamate synthetase  32.87 
 
 
416 aa  180  4.999999999999999e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0325  FolC bifunctional protein  30.15 
 
 
438 aa  179  5.999999999999999e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1739  FolC bifunctional protein  36.08 
 
 
444 aa  179  1e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.281034  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0683  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  39.52 
 
 
437 aa  179  1e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.944672  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0918  FolC bifunctional protein  36.3 
 
 
404 aa  178  1e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0715  folylpolyglutamate synthase  33.1 
 
 
442 aa  178  2e-43  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0809  FolC bifunctional protein  38.85 
 
 
423 aa  178  2e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0844236 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2572  FolC bifunctional protein  29.64 
 
 
431 aa  178  2e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3059  FolC bifunctional protein  39.73 
 
 
437 aa  177  3e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.310579  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1717  FolC bifunctional protein  39.52 
 
 
437 aa  177  3e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2553  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  36.94 
 
 
422 aa  177  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0765  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  39.57 
 
 
447 aa  177  4e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2716  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  36.94 
 
 
422 aa  177  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3497  FolC bifunctional protein  40.38 
 
 
526 aa  177  4e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09900  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  35.71 
 
 
462 aa  177  4e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.175662  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2441  FolC bifunctional protein  39.52 
 
 
437 aa  177  4e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.189653  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1862  FolC bifunctional protein  39.57 
 
 
461 aa  177  4e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.59484  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0533  FolC bifunctional protein  39.57 
 
 
461 aa  177  4e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>