59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0386 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0386  Rieske (2Fe-2S) domain protein  100 
 
 
171 aa  340  7e-93  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.166623  normal  0.344702 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3084  Rieske (2Fe-2S) domain protein  49.12 
 
 
138 aa  102  3e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.325284  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2795  Rieske iron sulfur-like protein  39.04 
 
 
170 aa  89.4  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1360  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  38.76 
 
 
151 aa  86.3  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0559  Rieske (2Fe-2S) domain protein  39.85 
 
 
156 aa  84.3  6e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01838  rieske  34.82 
 
 
113 aa  64.7  0.0000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.318103  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3380  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  44.74 
 
 
111 aa  57  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2495  Rieske (2Fe-2S) domain protein  41.25 
 
 
151 aa  57.4  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.746892 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0896  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  41.67 
 
 
163 aa  55.8  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.530558  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5218  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  44.74 
 
 
111 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.434864  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2750  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  35.16 
 
 
154 aa  55.1  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1935  hypothetical protein  35.06 
 
 
120 aa  55.1  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.455363  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4083  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  44.74 
 
 
111 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.171695  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3141  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.71 
 
 
120 aa  55.1  0.0000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3198  ferredoxin, 2Fe-2S  43.08 
 
 
112 aa  54.7  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0027175  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3434  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  44.74 
 
 
111 aa  54.3  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5626  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40.78 
 
 
111 aa  53.5  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.164476 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6068  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40.7 
 
 
111 aa  53.9  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0959217  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1238  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.33 
 
 
109 aa  53.5  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.724379  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0103  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.45 
 
 
153 aa  53.1  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1174  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.26 
 
 
142 aa  52.8  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1340  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.63 
 
 
116 aa  53.1  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000041033 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3193  Rieske (2Fe-2S) domain protein  43.04 
 
 
111 aa  52.4  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.242192  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0036  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  45.83 
 
 
111 aa  52.4  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4253  hypothetical protein  34.41 
 
 
144 aa  52  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.825501  normal  0.678624 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0350  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.68 
 
 
217 aa  52  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5489  ferredoxin subunits of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase  37.21 
 
 
119 aa  51.6  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.121832  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3905  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  40.51 
 
 
114 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.391138  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3370  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  30.38 
 
 
104 aa  50.4  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0252226 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0659  hypothetical protein  40.26 
 
 
136 aa  50.4  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4829  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.96 
 
 
119 aa  50.4  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.642068 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1488  PfkB  36.25 
 
 
401 aa  50.1  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2437  Rieske (2Fe-2S) region  29.66 
 
 
127 aa  49.7  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.55603  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5912  hypothetical protein  37.66 
 
 
155 aa  48.9  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2735  Rieske (2Fe-2S) protein  42.42 
 
 
111 aa  48.5  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0390389  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4688  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.52 
 
 
105 aa  47.8  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0626972  hitchhiker  0.0000000488951 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3574  Rieske (2Fe-2S) region  35.71 
 
 
117 aa  47.4  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.556915  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2392  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.62 
 
 
124 aa  46.6  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.348824  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2272  Rieske (2Fe-2S) region  31.63 
 
 
134 aa  46.2  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308557  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0744  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.53 
 
 
105 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.347579  hitchhiker  0.000000000639734 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0029  Ketohexokinase  34.34 
 
 
420 aa  45.8  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.892362  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0676  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.81 
 
 
123 aa  45.8  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0973  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30 
 
 
130 aa  45.4  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0515815 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5685  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.13 
 
 
353 aa  45.1  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0319041  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0908  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.35 
 
 
130 aa  45.4  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.313285  normal  0.0276254 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0992  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.21 
 
 
105 aa  45.1  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0130458  hitchhiker  0.00000000116756 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2167  hypothetical protein  35.44 
 
 
149 aa  45.1  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4690  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.76 
 
 
114 aa  44.7  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000178918 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0589  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.18 
 
 
126 aa  44.7  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.03606 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2008  Rieske (2Fe-2S) region  28.16 
 
 
119 aa  44.3  0.0008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4554  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.76 
 
 
105 aa  44.3  0.0009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000741211 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0114  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.59 
 
 
108 aa  44.3  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.225812  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1251  nitrogen-fixing NifU domain protein  28.81 
 
 
289 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2849  Rieske (2Fe-2S) protein  34.18 
 
 
118 aa  43.9  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5427  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  32.91 
 
 
107 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1282  nitrogen-fixing NifU domain protein  27.97 
 
 
289 aa  42.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0910712 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62360  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  32.91 
 
 
115 aa  42  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1561  hypothetical protein  37.04 
 
 
116 aa  41.6  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.150485  normal  0.132727 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1421  Rieske (2Fe-2S) region  31.82 
 
 
122 aa  40.8  0.01  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.606028 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>