14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2750 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_2750  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  100 
 
 
154 aa  313  6e-85  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0896  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  56.36 
 
 
163 aa  165  2e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.530558  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1360  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  34.81 
 
 
151 aa  80.9  0.000000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2795  Rieske iron sulfur-like protein  32.94 
 
 
170 aa  74.7  0.0000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3084  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.12 
 
 
138 aa  72.4  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.325284  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0559  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.71 
 
 
156 aa  56.6  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3011  hypothetical protein  75 
 
 
116 aa  56.2  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3462  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.97 
 
 
116 aa  51.2  0.000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01838  rieske  33.33 
 
 
113 aa  48.1  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.318103  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3193  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.11 
 
 
111 aa  44.7  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.242192  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2495  Rieske (2Fe-2S) domain protein  26 
 
 
151 aa  43.1  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.746892 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0386  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.94 
 
 
171 aa  43.5  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.166623  normal  0.344702 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1340  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.27 
 
 
116 aa  41.2  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000041033 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6884  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.84 
 
 
151 aa  41.2  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.83573  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>