205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2406 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_2406  cytidyltransferase-related domain protein  100 
 
 
153 aa  306  5e-83  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.508544  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0715  cytidyltransferase-related domain protein  67.38 
 
 
142 aa  192  1e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2116  cytidyltransferase-related domain protein  66.43 
 
 
143 aa  185  2e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0621  cytidyltransferase-related domain protein  67.39 
 
 
148 aa  183  9e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1909  cytidyltransferase-related domain protein  58.99 
 
 
143 aa  164  5.9999999999999996e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0344857  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0791  cytidyltransferase-like protein  51.77 
 
 
143 aa  139  9.999999999999999e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2296  cytidyltransferase-like protein  52.11 
 
 
149 aa  139  9.999999999999999e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0310  cytidyltransferase-related domain protein  50.33 
 
 
153 aa  136  1e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.531506  normal  0.452914 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2084  glycerol-3-phosphate cytidyltransferase  47.89 
 
 
139 aa  135  2e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0657652  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0427  cytidyltransferase-related protein  45.83 
 
 
143 aa  134  5e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0209  cytidyltransferase-like protein  52.11 
 
 
148 aa  129  1.0000000000000001e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2404  cytidyltransferase-related  49.64 
 
 
156 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0408  hypothetical protein  45.39 
 
 
140 aa  124  3e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0199555  hitchhiker  0.00270844 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0747  cytidyltransferase-related domain protein  42.66 
 
 
149 aa  105  3e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00798293  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1930  cytidyltransferase-related domain protein  34.29 
 
 
226 aa  87.4  7e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.791436  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1304  cytidyltransferase-like protein  37.59 
 
 
156 aa  87  8e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.494614  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1298  cytidyltransferase-like protein  36.67 
 
 
206 aa  82.4  0.000000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000283099 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1245  cytidyltransferase-like protein  35.33 
 
 
241 aa  80.5  0.000000000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0187562  hitchhiker  0.00542026 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1712  cytidyltransferase-like protein  42.86 
 
 
150 aa  75.5  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.432331  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1736  cytidyltransferase-like protein  36.97 
 
 
216 aa  75.9  0.0000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.355762  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0750  cytidyltransferase-like protein  46.15 
 
 
150 aa  74.7  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0190  cytidyltransferase-like protein  46.15 
 
 
150 aa  75.1  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.847612  normal  0.946455 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0688  cytidyltransferase-like protein  34.78 
 
 
225 aa  74.3  0.0000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2337  cytidyltransferase-like protein  32.85 
 
 
238 aa  70.9  0.000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.022864 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0687  cytidyltransferase-like protein  29.93 
 
 
226 aa  69.3  0.00000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.285167 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1979  cytidyltransferase-like protein  33.33 
 
 
226 aa  67.4  0.00000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.278192  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2107  cytidyltransferase-like protein  31.65 
 
 
223 aa  63.9  0.0000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0113  cytidyltransferase-like protein  32.63 
 
 
139 aa  57.4  0.00000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1685  cytidyltransferase-like protein  33.79 
 
 
169 aa  57.4  0.00000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0246  cytidyltransferase-like protein  45.05 
 
 
151 aa  56.2  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0368  rfaE bifunctional protein  30.99 
 
 
162 aa  54.7  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0342  rfaE bifunctional protein  32.41 
 
 
172 aa  54.3  0.0000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.699797 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0664  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  38 
 
 
132 aa  53.5  0.0000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0679  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  38 
 
 
132 aa  53.5  0.0000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1736  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  42.02 
 
 
473 aa  52.4  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0140952  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0505  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  36.36 
 
 
480 aa  52.4  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0580  D-beta-D-heptose 1-phosphate adenylyltransferase / D-alpha,beta-D-heptose 7-phosphate 1-kinase  36.96 
 
 
477 aa  52.4  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000000433477  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1579  rfaE bifunctional protein  34.38 
 
 
158 aa  52.4  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0662  rfaE bifunctional protein  35.29 
 
 
485 aa  52  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.148803 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0922  D-beta-D-heptose 1-phosphate adenylyltransferase / D-alpha,beta-D-heptose 7-phosphate 1-kinase  30.56 
 
 
490 aa  51.6  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.053941  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2610  cytidyltransferase-related  37 
 
 
163 aa  51.2  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.248173  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0268  rfaE bifunctional protein  34.26 
 
 
167 aa  51.2  0.000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0537  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  35.34 
 
 
474 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.673885 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0017  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  32.39 
 
 
476 aa  51.2  0.000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0616  rfaE bifunctional protein  26.97 
 
 
163 aa  51.2  0.000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.584874  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1486  cytidyltransferase-related domain protein  28.87 
 
 
170 aa  51.2  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.895055  normal  0.966364 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2791  cytidyltransferase-related domain protein  37 
 
 
163 aa  51.2  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0300  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  37 
 
 
132 aa  50.8  0.000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.582622  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2613  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  35.19 
 
 
502 aa  51.2  0.000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0100846  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2085  ADP-heptose synthase  29.86 
 
 
490 aa  50.4  0.000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2696  cytidyltransferase-related domain protein  37.11 
 
 
163 aa  50.4  0.000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0199265  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1062  cytidyltransferase-like protein  31.39 
 
 
508 aa  50.4  0.000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1075  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  31.97 
 
 
167 aa  50.4  0.000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00521191  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4983  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  36.7 
 
 
473 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0477  D,D-heptose 1-phosphate adenosyltransferase/7-phosphate kinase  29.5 
 
 
457 aa  49.7  0.00001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4934  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  36 
 
 
473 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4983  lipopolysaccharide biosynthesis protein RfaE  34.48 
 
 
474 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0532  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  36 
 
 
473 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0351851 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16500  RfaeE domain II  32.98 
 
 
158 aa  49.7  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000908825  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0484  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  35.78 
 
 
474 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.198605  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1901  bifunctional ADP-heptose synthase  32.39 
 
 
179 aa  49.3  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0730146  normal  0.846811 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3788  bifunctional ADP-heptose synthase  33.01 
 
 
223 aa  48.9  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1413  bifunctional protein HldE  33.33 
 
 
458 aa  48.9  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0346  rfaE bifunctional protein  33.33 
 
 
185 aa  48.9  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0300  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  37.68 
 
 
128 aa  49.7  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4806  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  36 
 
 
473 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4205  glycerol-3-phosphate cytidyltransferase  31.91 
 
 
131 aa  48.5  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.680646  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1282  putative ADP-heptose synthase  30.71 
 
 
490 aa  48.5  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0301  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  27.94 
 
 
185 aa  48.5  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.675292  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4715  rfaE bifunctional protein  34.51 
 
 
166 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.328325 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1884  bifunctional ADP-heptose synthase  30.43 
 
 
173 aa  48.1  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3034  rfaE bifunctional protein  30 
 
 
161 aa  48.1  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000105513  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44680  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  35.34 
 
 
474 aa  48.1  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.290309  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0646  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  39.18 
 
 
482 aa  48.5  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2577  cytidyltransferase-like protein  37.76 
 
 
160 aa  48.1  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.526786  normal  0.149536 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11230  cytidyltransferase-related enzyme  35.05 
 
 
484 aa  47.8  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.448325  normal  0.110426 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0769  D-beta-D-heptose 1-phosphate adenylyltransferase / D-alpha,beta-D-heptose 7-phosphate 1-kinase  36.08 
 
 
488 aa  47.8  0.00006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00625792 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3773  rfaE bifunctional protein  37.37 
 
 
482 aa  47.8  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.889229  normal  0.588929 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3211  rfaE bifunctional protein  34.78 
 
 
490 aa  47.8  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.342523  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4960  cytidyltransferase-related domain protein  28.97 
 
 
163 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.586788 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3975  rfaE bifunctional protein  36.96 
 
 
562 aa  47.4  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2602  rfaE bifunctional protein  33.63 
 
 
170 aa  47.4  0.00007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4443  cytidyltransferase-related domain protein  33.33 
 
 
494 aa  47.4  0.00008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02922  fused heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  37.25 
 
 
477 aa  47  0.00009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0648  rfaE bifunctional protein  37.25 
 
 
477 aa  47  0.00009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3229  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  37.25 
 
 
477 aa  47  0.00009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3515  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  37.25 
 
 
477 aa  47  0.00009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3344  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  37.25 
 
 
477 aa  47  0.00009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.078646  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4289  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  30.56 
 
 
476 aa  47  0.00009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0864  rfaE bifunctional protein  34.04 
 
 
487 aa  47  0.00009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.848286  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3483  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  37.25 
 
 
477 aa  47  0.00009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0647  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  37.25 
 
 
477 aa  47  0.00009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02872  hypothetical protein  37.25 
 
 
477 aa  47  0.00009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4363  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  37.25 
 
 
477 aa  47  0.00009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.165395  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0245  cytidyltransferase-like protein  33.68 
 
 
512 aa  47  0.00009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3395  rfaE bifunctional protein  34.04 
 
 
487 aa  47  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3200  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  31.94 
 
 
476 aa  46.6  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.923411  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66060  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  34.48 
 
 
474 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0596  rfaE bifunctional protein  34.38 
 
 
151 aa  46.6  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5731  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  34.48 
 
 
474 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>