14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1515 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_1515  hypothetical protein  100 
 
 
586 aa  1196    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000161589  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2792  hypothetical protein  28.42 
 
 
938 aa  66.2  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2775  hypothetical protein  26.22 
 
 
1201 aa  60.1  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2850  hypothetical protein  33.91 
 
 
665 aa  51.2  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28530  hypothetical protein  33.85 
 
 
364 aa  49.7  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0528408  normal  0.0603049 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02537  pectate lyase (Eurofung)  30.56 
 
 
410 aa  47.8  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2218  periplasmic copper-binding  27.31 
 
 
483 aa  47.4  0.0007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02460  hypothetical protein  42.11 
 
 
795 aa  46.6  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2350  hypothetical protein  35.87 
 
 
473 aa  46.2  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1081  hypothetical protein  28.26 
 
 
853 aa  45.1  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0099  hypothetical protein  39.78 
 
 
520 aa  45.1  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2544  hypothetical protein  30.16 
 
 
465 aa  45.1  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.103402  normal  0.0339199 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3659  Poly(beta-D-mannuronate) lyase  34.21 
 
 
754 aa  44.3  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1075  periplasmic copper-binding  26.22 
 
 
442 aa  44.3  0.006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>