More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0667 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0667  Ppx/GppA phosphatase family protein  100 
 
 		 568 aa  1168    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0772  exopolyphosphatase  68.98 
 
 		 333 aa  468  9.999999999999999e-131  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05000  exopolyphosphatase  43.35 
 
 		 532 aa  372  1e-102  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.442897  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07880  Ppx/GppA phosphatase  50.47 
 
 		 353 aa  283  6.000000000000001e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.605483  normal  0.219584 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0773  hypothetical protein  73.41 
 
 		 188 aa  274  3e-72  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.818853  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1920  Ppx/GppA phosphatase  51.54 
 
 		 328 aa  271  2e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0912  Ppx/GppA phosphatase  48.15 
 
 		 330 aa  265  2e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.694762  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3129  Ppx/GppA phosphatase  46.65 
 
 		 311 aa  262  1e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.184838  normal  0.0109976 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0923  Ppx/GppA phosphatase  47.11 
 
 		 323 aa  258  2e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120517  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1022  Ppx/GppA phosphatase  49.39 
 
 		 319 aa  258  2e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.45924  normal  0.0505831 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1150  Ppx/GppA phosphatase  49.23 
 
 		 315 aa  258  2e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.198384  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2679  Ppx/GppA phosphatase  47.06 
 
 		 327 aa  258  3e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0431  Ppx/GppA phosphatase  47.43 
 
 		 331 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0724245  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3162  Ppx/GppA phosphatase  47.55 
 
 		 318 aa  254  4.0000000000000004e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1223  Ppx/GppA phosphatase  47.08 
 
 		 315 aa  251  2e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000529735 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4237  Ppx/GppA phosphatase  45.87 
 
 		 309 aa  249  8e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.726443  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4323  Ppx/GppA phosphatase  45.87 
 
 		 309 aa  249  8e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.820035 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4616  Ppx/GppA phosphatase  45.87 
 
 		 309 aa  249  8e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.67706  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0074  Ppx/GppA phosphatase  44.11 
 
 		 326 aa  249  1e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.10959  normal  0.235514 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1906  Ppx/GppA phosphatase  46.73 
 
 		 312 aa  246  6e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8578  Ppx/GppA phosphatase  44.01 
 
 		 319 aa  245  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.297052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07070  Ppx/GppA phosphatase  44.67 
 
 		 328 aa  244  1.9999999999999999e-63  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4768  Ppx/GppA phosphatase  47.24 
 
 		 315 aa  242  1e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.934265 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1076  Ppx/GppA phosphatase  46.15 
 
 		 313 aa  242  2e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.277102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1573  Ppx/GppA phosphatase  45.68 
 
 		 326 aa  241  2.9999999999999997e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11044  hypothetical protein  44.51 
 
 		 319 aa  239  1e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5822  Ppx/GppA phosphatase  44.31 
 
 		 321 aa  238  2e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13480  Ppx/GppA phosphatase  50.51 
 
 		 317 aa  238  2e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0206727  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0153  Ppx/GppA phosphatase  46.3 
 
 		 318 aa  238  3e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1039  Ppx/GppA phosphatase  44.27 
 
 		 308 aa  237  5.0000000000000005e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0675  Ppx/GppA phosphatase  46.13 
 
 		 320 aa  235  2.0000000000000002e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0894  Ppx/GppA phosphatase  43.43 
 
 		 314 aa  235  2.0000000000000002e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0829909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1957  Ppx/GppA phosphatase  44.98 
 
 		 318 aa  228  2e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0674716  normal  0.243105 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0810  Ppx/GppA phosphatase  43.33 
 
 		 318 aa  224  4e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.208973 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32210  Ppx/GppA phosphatase  44 
 
 		 318 aa  223  4.9999999999999996e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.188843 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0837  Ppx/GppA phosphatase  43.29 
 
 		 313 aa  222  9.999999999999999e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.328098  normal  0.389531 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3920  Ppx/GppA phosphatase  42.65 
 
 		 353 aa  221  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.376929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0931  Ppx/GppA phosphatase  43.12 
 
 		 308 aa  215  9.999999999999999e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4425  Ppx/GppA phosphatase  41.57 
 
 		 322 aa  196  1e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.800099 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1921  protein of unknown function DUF501  56.33 
 
 		 183 aa  178  3e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0911  protein of unknown function DUF501  54.14 
 
 		 187 aa  172  2e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07870  hypothetical protein  54.78 
 
 		 173 aa  171  3e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.288834 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1020  protein of unknown function DUF501  53.09 
 
 		 211 aa  165  2.0000000000000002e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0462853 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2180  Ppx/GppA phosphatase  35.71 
 
 		 317 aa  159  2e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5209  Ppx/GppA phosphatase  36.34 
 
 		 310 aa  155  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2680  protein of unknown function DUF501  50 
 
 		 173 aa  153  7e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0697  Ppx/GppA phosphatase  31.53 
 
 		 301 aa  153  8.999999999999999e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000153349  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1222  protein of unknown function DUF501  46.91 
 
 		 223 aa  151  3e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000463664 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5821  hypothetical protein  48.48 
 
 		 168 aa  149  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13470  hypothetical protein  48.52 
 
 		 189 aa  149  2.0000000000000003e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0490421  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1149  hypothetical protein  46.3 
 
 		 233 aa  149  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.220769  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07060  hypothetical protein  49.35 
 
 		 179 aa  149  2.0000000000000003e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19640  exopolyphosphatase  35.06 
 
 		 310 aa  146  8.000000000000001e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0466903 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00540  Exopolyphosphatase  32.81 
 
 		 305 aa  146  9e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000336687  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1075  protein of unknown function DUF501  51.81 
 
 		 182 aa  145  1e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.786986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0575  Ppx/GppA phosphatase  34.82 
 
 		 327 aa  145  2e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.881206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2422  Ppx/GppA phosphatase  35.71 
 
 		 311 aa  145  2e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0132  Ppx/GppA phosphatase  33.45 
 
 		 311 aa  144  3e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0673  protein of unknown function DUF501  49.06 
 
 		 165 aa  144  4e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1907  hypothetical protein  40.85 
 
 		 209 aa  144  6e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.939613 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0430  hypothetical protein  47.47 
 
 		 188 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.70163  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0930  hypothetical protein  48.05 
 
 		 168 aa  142  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2586  Ppx/GppA phosphatase  32.77 
 
 		 311 aa  140  7e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.495242  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2062  exopolyphosphatase, putative  33.9 
 
 		 312 aa  139  1e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32230  hypothetical protein  49.07 
 
 		 168 aa  138  2e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0238  Ppx/GppA phosphatase  30.87 
 
 		 300 aa  136  9.999999999999999e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.218725  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0809  hypothetical protein  48.98 
 
 		 178 aa  135  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.194337 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2019  exopolyphosphatase, putative  34.33 
 
 		 312 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11043  hypothetical protein  47.71 
 
 		 163 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0090  Ppx/GppA phosphatase  33.02 
 
 		 288 aa  135  1.9999999999999998e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2326  Ppx/GppA phosphatase  35.47 
 
 		 304 aa  133  1.0000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.964063  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0073  protein of unknown function DUF501  44.75 
 
 		 195 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.223965  normal  0.218022 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0473  Ppx/GppA phosphatase  33.85 
 
 		 435 aa  132  2.0000000000000002e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2448  Ppx/GppA phosphatase  32.31 
 
 		 311 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0892  hypothetical protein  46.63 
 
 		 185 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.1319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0835  hypothetical protein  46.01 
 
 		 185 aa  131  4.0000000000000003e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.311533 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2821  Ppx/GppA phosphatase  33.11 
 
 		 312 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0702  Ppx/GppA phosphatase  34.15 
 
 		 307 aa  130  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.176002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0922  protein of unknown function DUF501  46.39 
 
 		 193 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.141888  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1956  hypothetical protein  47.89 
 
 		 164 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0133453  normal  0.340354 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2210  Ppx/GppA phosphatase  32.45 
 
 		 375 aa  129  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0781544  normal  0.173268 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3921  hypothetical protein  48.32 
 
 		 210 aa  129  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0720099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0154  protein of unknown function DUF501  44.1 
 
 		 187 aa  129  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1038  protein of unknown function DUF501  46.36 
 
 		 182 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0329  Ppx/GppA phosphatase  31.88 
 
 		 303 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0427  Ppx/GppA phosphatase  32.2 
 
 		 520 aa  128  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4769  hypothetical protein  44.03 
 
 		 163 aa  128  3e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2570  Ppx/GppA phosphatase  30.17 
 
 		 513 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0472  Ppx/GppA phosphatase  32.2 
 
 		 433 aa  127  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.210353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0810  Ppx/GppA phosphatase  27.9 
 
 		 305 aa  127  6e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.11092  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4238  hypothetical protein  47.18 
 
 		 166 aa  126  9e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.701665  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4617  hypothetical protein  47.18 
 
 		 166 aa  126  9e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.478193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4324  hypothetical protein  47.18 
 
 		 166 aa  126  9e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.956577  normal  0.562122 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3130  hypothetical protein  44.81 
 
 		 171 aa  124  5e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0372081  normal  0.0207844 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0888  exopolyphosphatase  30.7 
 
 		 603 aa  124  6e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.00574973  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1851  Ppx/GppA phosphatase  31.56 
 
 		 311 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.210768  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0226  Ppx/GppA phosphatase  33.45 
 
 		 326 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000460775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8579  hypothetical protein  39.55 
 
 		 213 aa  122  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.455721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0123  Ppx/GppA phosphatase  30.15 
 
 		 296 aa  120  7.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1166  Ppx/GppA phosphatase  30.83 
 
 		 446 aa  120  7.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>