48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0930 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_0930  hypothetical protein  100 
 
 
168 aa  343  6e-94  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5821  hypothetical protein  66.46 
 
 
168 aa  224  3e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0835  hypothetical protein  67.95 
 
 
185 aa  217  7.999999999999999e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.311533 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0892  hypothetical protein  67.95 
 
 
185 aa  216  2e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.1319  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0154  protein of unknown function DUF501  68.39 
 
 
187 aa  211  4.9999999999999996e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07060  hypothetical protein  65.36 
 
 
179 aa  205  2e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3130  hypothetical protein  64.24 
 
 
171 aa  200  6e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0372081  normal  0.0207844 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0430  hypothetical protein  59.04 
 
 
188 aa  190  6e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.70163  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8579  hypothetical protein  57.93 
 
 
213 aa  187  5e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.455721  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1921  protein of unknown function DUF501  59.87 
 
 
183 aa  187  5e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1020  protein of unknown function DUF501  62.75 
 
 
211 aa  186  1e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0462853 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2680  protein of unknown function DUF501  58.02 
 
 
173 aa  183  1.0000000000000001e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0809  hypothetical protein  64.63 
 
 
178 aa  180  8.000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.194337 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0673  protein of unknown function DUF501  55.56 
 
 
165 aa  180  8.000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3921  hypothetical protein  59.49 
 
 
210 aa  177  8e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0720099  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1907  hypothetical protein  57.05 
 
 
209 aa  176  1e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.939613 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1038  protein of unknown function DUF501  62.5 
 
 
182 aa  176  2e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0073  protein of unknown function DUF501  56.6 
 
 
195 aa  176  2e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.223965  normal  0.218022 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1149  hypothetical protein  55.35 
 
 
233 aa  174  5e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.220769  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07870  hypothetical protein  55.35 
 
 
173 aa  174  5e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.288834 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1222  protein of unknown function DUF501  54.49 
 
 
223 aa  173  9.999999999999999e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000463664 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0922  protein of unknown function DUF501  58.86 
 
 
193 aa  171  2.9999999999999996e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.141888  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4769  hypothetical protein  56.67 
 
 
163 aa  172  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0911  protein of unknown function DUF501  53.5 
 
 
187 aa  170  9e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1956  hypothetical protein  55.33 
 
 
164 aa  168  3e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0133453  normal  0.340354 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4238  hypothetical protein  55.03 
 
 
166 aa  164  5e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.701665  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4324  hypothetical protein  55.03 
 
 
166 aa  164  5e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.956577  normal  0.562122 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4617  hypothetical protein  55.03 
 
 
166 aa  164  5e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.478193  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13470  hypothetical protein  56.03 
 
 
189 aa  162  2.0000000000000002e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0490421  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05000  exopolyphosphatase  55.15 
 
 
532 aa  162  2.0000000000000002e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.442897  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11043  hypothetical protein  55.33 
 
 
163 aa  162  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1075  protein of unknown function DUF501  62.33 
 
 
182 aa  159  2e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.786986  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1572  protein of unknown function DUF501  57.14 
 
 
171 aa  145  3e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32230  hypothetical protein  55.19 
 
 
168 aa  145  4.0000000000000006e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0773  hypothetical protein  49.69 
 
 
188 aa  142  2e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.818853  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0667  Ppx/GppA phosphatase family protein  48.05 
 
 
568 aa  142  2e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3163  protein of unknown function DUF501  51.8 
 
 
176 aa  135  2e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1666  hypothetical protein  37.66 
 
 
170 aa  99  3e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1739  hypothetical protein  36.36 
 
 
170 aa  97.1  1e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1656  hypothetical protein  34.39 
 
 
170 aa  95.9  3e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00530  hypothetical protein  29.27 
 
 
179 aa  80.5  0.000000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000246936  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0186  hypothetical protein  29.41 
 
 
175 aa  77  0.0000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1853  hypothetical protein  30.72 
 
 
177 aa  76.6  0.0000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.922543  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3040  hypothetical protein  29.63 
 
 
173 aa  74.3  0.0000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.503627  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3951  hypothetical protein  28.03 
 
 
171 aa  73.6  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.757382  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0915  hypothetical protein  34.48 
 
 
145 aa  63.2  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000324593  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35692  predicted protein  30.25 
 
 
326 aa  50.1  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.933776  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_35406  predicted protein  30 
 
 
294 aa  47  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.528252  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>