49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_07870 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_07870  hypothetical protein  100 
 
 
173 aa  347  3e-95  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.288834 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1921  protein of unknown function DUF501  77.36 
 
 
183 aa  251  4.0000000000000004e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2680  protein of unknown function DUF501  72.99 
 
 
173 aa  244  6e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0911  protein of unknown function DUF501  68 
 
 
187 aa  242  1.9999999999999999e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1020  protein of unknown function DUF501  75.16 
 
 
211 aa  236  1e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0462853 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1222  protein of unknown function DUF501  65.84 
 
 
223 aa  208  4e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000463664 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07060  hypothetical protein  63.8 
 
 
179 aa  203  8e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1149  hypothetical protein  62.8 
 
 
233 aa  203  1e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.220769  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0835  hypothetical protein  61.4 
 
 
185 aa  199  1.9999999999999998e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.311533 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0892  hypothetical protein  61.4 
 
 
185 aa  198  3.9999999999999996e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.1319  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0673  protein of unknown function DUF501  62.11 
 
 
165 aa  193  1e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13470  hypothetical protein  60 
 
 
189 aa  192  2e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0490421  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1075  protein of unknown function DUF501  65.29 
 
 
182 aa  187  4e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.786986  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5821  hypothetical protein  59.24 
 
 
168 aa  186  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0154  protein of unknown function DUF501  60.76 
 
 
187 aa  183  9e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11043  hypothetical protein  59.15 
 
 
163 aa  182  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05000  exopolyphosphatase  61.08 
 
 
532 aa  183  1.0000000000000001e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.442897  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1956  hypothetical protein  61.59 
 
 
164 aa  180  7e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0133453  normal  0.340354 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4769  hypothetical protein  60.81 
 
 
163 aa  177  4e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4617  hypothetical protein  62.25 
 
 
166 aa  177  5.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.478193  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4324  hypothetical protein  62.25 
 
 
166 aa  177  5.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.956577  normal  0.562122 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4238  hypothetical protein  62.25 
 
 
166 aa  177  5.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.701665  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0930  hypothetical protein  55.35 
 
 
168 aa  174  6e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3921  hypothetical protein  60.51 
 
 
210 aa  172  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0720099  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1907  hypothetical protein  61.9 
 
 
209 aa  172  1.9999999999999998e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.939613 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0667  Ppx/GppA phosphatase family protein  54.78 
 
 
568 aa  171  3.9999999999999995e-42  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0430  hypothetical protein  56.02 
 
 
188 aa  169  2e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.70163  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0773  hypothetical protein  53.99 
 
 
188 aa  167  7e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.818853  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0809  hypothetical protein  63.57 
 
 
178 aa  167  9e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.194337 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3130  hypothetical protein  54.88 
 
 
171 aa  167  9e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0372081  normal  0.0207844 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32230  hypothetical protein  60.39 
 
 
168 aa  163  1.0000000000000001e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0073  protein of unknown function DUF501  53.29 
 
 
195 aa  162  3e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.223965  normal  0.218022 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8579  hypothetical protein  51.81 
 
 
213 aa  159  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.455721  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1572  protein of unknown function DUF501  59.46 
 
 
171 aa  157  6e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1038  protein of unknown function DUF501  55.63 
 
 
182 aa  156  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3163  protein of unknown function DUF501  57.34 
 
 
176 aa  152  2.9999999999999998e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0922  protein of unknown function DUF501  54.97 
 
 
193 aa  151  4e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.141888  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1656  hypothetical protein  32.7 
 
 
170 aa  94  1e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3040  hypothetical protein  35.8 
 
 
173 aa  88.2  5e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.503627  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3951  hypothetical protein  30.25 
 
 
171 aa  85.5  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.757382  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1853  hypothetical protein  32.48 
 
 
177 aa  84.3  7e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.922543  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00530  hypothetical protein  30.38 
 
 
179 aa  80.9  0.000000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000246936  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1666  hypothetical protein  31.68 
 
 
170 aa  80.1  0.00000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0186  hypothetical protein  30.61 
 
 
175 aa  78.6  0.00000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1739  hypothetical protein  29.81 
 
 
170 aa  76.3  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0915  hypothetical protein  33.99 
 
 
145 aa  58.9  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000324593  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_35406  predicted protein  23 
 
 
294 aa  53.9  0.0000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.528252  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35692  predicted protein  30.51 
 
 
326 aa  47.8  0.00009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.933776  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1562  protein of unknown function DUF501  34.72 
 
 
152 aa  47  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>