49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_32230 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_32230  hypothetical protein  100 
 
 		 168 aa  344  3e-94  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0673  protein of unknown function DUF501  76.43 
 
 		 165 aa  247  4e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11043  hypothetical protein  69.86 
 
 		 163 aa  209  2e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4769  hypothetical protein  68.24 
 
 		 163 aa  205  2e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1956  hypothetical protein  67.81 
 
 		 164 aa  205  2e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0133453  normal  0.340354 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4238  hypothetical protein  67.81 
 
 		 166 aa  203  8e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.701665  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4324  hypothetical protein  67.81 
 
 		 166 aa  203  8e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.956577  normal  0.562122 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4617  hypothetical protein  67.81 
 
 		 166 aa  203  8e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.478193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0892  hypothetical protein  63.8 
 
 		 185 aa  197  5e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.1319  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5821  hypothetical protein  60.25 
 
 		 168 aa  194  3e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0835  hypothetical protein  61.35 
 
 		 185 aa  192  2e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.311533 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0154  protein of unknown function DUF501  62.82 
 
 		 187 aa  189  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1921  protein of unknown function DUF501  59.52 
 
 		 183 aa  188  2.9999999999999997e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0922  protein of unknown function DUF501  64.38 
 
 		 193 aa  182  2.0000000000000003e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.141888  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3921  hypothetical protein  63.33 
 
 		 210 aa  180  8.000000000000001e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0720099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07870  hypothetical protein  60.39 
 
 		 173 aa  179  2e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.288834 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07060  hypothetical protein  59.01 
 
 		 179 aa  178  2e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1572  protein of unknown function DUF501  64.67 
 
 		 171 aa  177  5.999999999999999e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1907  hypothetical protein  62.42 
 
 		 209 aa  176  1e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.939613 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0809  hypothetical protein  62.16 
 
 		 178 aa  176  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.194337 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3130  hypothetical protein  59.76 
 
 		 171 aa  174  4e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0372081  normal  0.0207844 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0430  hypothetical protein  59.76 
 
 		 188 aa  174  4e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.70163  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0911  protein of unknown function DUF501  59.33 
 
 		 187 aa  174  5e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1222  protein of unknown function DUF501  57.23 
 
 		 223 aa  171  5e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000463664 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1020  protein of unknown function DUF501  58.13 
 
 		 211 aa  170  7.999999999999999e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0462853 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0073  protein of unknown function DUF501  58.18 
 
 		 195 aa  168  3e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.223965  normal  0.218022 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8579  hypothetical protein  52.51 
 
 		 213 aa  166  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.455721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2680  protein of unknown function DUF501  61.49 
 
 		 173 aa  163  1.0000000000000001e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3163  protein of unknown function DUF501  58.04 
 
 		 176 aa  162  2.0000000000000002e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1149  hypothetical protein  53.46 
 
 		 233 aa  161  5.0000000000000005e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.220769  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1075  protein of unknown function DUF501  58.86 
 
 		 182 aa  160  6e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.786986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0930  hypothetical protein  55.19 
 
 		 168 aa  160  7e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1038  protein of unknown function DUF501  55.95 
 
 		 182 aa  160  9e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13470  hypothetical protein  55.48 
 
 		 189 aa  155  3e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0490421  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0667  Ppx/GppA phosphatase family protein  49.07 
 
 		 568 aa  146  1.0000000000000001e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05000  exopolyphosphatase  51.25 
 
 		 532 aa  139  1.9999999999999998e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.442897  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0773  hypothetical protein  45.96 
 
 		 188 aa  133  9.999999999999999e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.818853  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1656  hypothetical protein  35.63 
 
 		 170 aa  106  1e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1666  hypothetical protein  37.09 
 
 		 170 aa  105  4e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1739  hypothetical protein  35.06 
 
 		 170 aa  101  4e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0186  hypothetical protein  36.91 
 
 		 175 aa  99.8  1e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00530  hypothetical protein  34.68 
 
 		 179 aa  94.7  5e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000246936  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3040  hypothetical protein  35.57 
 
 		 173 aa  93.6  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.503627  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1853  hypothetical protein  34.84 
 
 		 177 aa  90.5  9e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.922543  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3951  hypothetical protein  30.07 
 
 		 171 aa  86.7  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.757382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0915  hypothetical protein  38.03 
 
 		 145 aa  73.9  0.0000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000324593  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_35406  predicted protein  24.3 
 
 		 294 aa  56.6  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.528252  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35692  predicted protein  31.36 
 
 		 326 aa  54.7  0.0000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.933776  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1562  protein of unknown function DUF501  33.56 
 
 		 152 aa  48.1  0.00005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>