48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0922 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_0922  protein of unknown function DUF501  100 
 
 
193 aa  383  1e-105  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.141888  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0809  hypothetical protein  66.48 
 
 
178 aa  219  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.194337 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0892  hypothetical protein  65.66 
 
 
185 aa  212  1.9999999999999998e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.1319  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0835  hypothetical protein  63.86 
 
 
185 aa  207  8e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.311533 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0673  protein of unknown function DUF501  63.87 
 
 
165 aa  204  8e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3921  hypothetical protein  63.75 
 
 
210 aa  201  4e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0720099  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0154  protein of unknown function DUF501  63.23 
 
 
187 aa  201  5e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1907  hypothetical protein  56.84 
 
 
209 aa  198  5e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.939613 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5821  hypothetical protein  59.26 
 
 
168 aa  196  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0073  protein of unknown function DUF501  58.58 
 
 
195 aa  189  2e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.223965  normal  0.218022 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0430  hypothetical protein  60.12 
 
 
188 aa  189  2e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.70163  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3130  hypothetical protein  59.51 
 
 
171 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0372081  normal  0.0207844 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11043  hypothetical protein  67.86 
 
 
163 aa  189  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0930  hypothetical protein  58.86 
 
 
168 aa  187  8e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4769  hypothetical protein  62.16 
 
 
163 aa  186  2e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8579  hypothetical protein  57.83 
 
 
213 aa  183  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.455721  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32230  hypothetical protein  64.38 
 
 
168 aa  183  2.0000000000000003e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1038  protein of unknown function DUF501  58.24 
 
 
182 aa  181  4.0000000000000006e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1956  hypothetical protein  63.57 
 
 
164 aa  181  6e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0133453  normal  0.340354 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07060  hypothetical protein  60 
 
 
179 aa  181  7e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4617  hypothetical protein  64.29 
 
 
166 aa  180  9.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.478193  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4324  hypothetical protein  64.29 
 
 
166 aa  180  9.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.956577  normal  0.562122 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4238  hypothetical protein  64.29 
 
 
166 aa  180  9.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.701665  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0911  protein of unknown function DUF501  59.21 
 
 
187 aa  179  2.9999999999999997e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1921  protein of unknown function DUF501  57.32 
 
 
183 aa  174  9e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07870  hypothetical protein  54.97 
 
 
173 aa  170  1e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.288834 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1572  protein of unknown function DUF501  64.58 
 
 
171 aa  166  1e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1222  protein of unknown function DUF501  52.5 
 
 
223 aa  166  2e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000463664 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1020  protein of unknown function DUF501  60.69 
 
 
211 aa  164  5e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0462853 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3163  protein of unknown function DUF501  65.91 
 
 
176 aa  164  5e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1149  hypothetical protein  49.45 
 
 
233 aa  164  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.220769  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2680  protein of unknown function DUF501  54.78 
 
 
173 aa  158  5e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13470  hypothetical protein  54.11 
 
 
189 aa  147  1.0000000000000001e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0490421  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05000  exopolyphosphatase  51.53 
 
 
532 aa  145  4.0000000000000006e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.442897  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0667  Ppx/GppA phosphatase family protein  46.39 
 
 
568 aa  144  8.000000000000001e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1075  protein of unknown function DUF501  55.56 
 
 
182 aa  143  1e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.786986  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0773  hypothetical protein  45.35 
 
 
188 aa  137  7.999999999999999e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.818853  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0186  hypothetical protein  34.39 
 
 
175 aa  91.7  6e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1666  hypothetical protein  36.55 
 
 
170 aa  90.5  1e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1656  hypothetical protein  34.44 
 
 
170 aa  88.6  6e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1739  hypothetical protein  37.67 
 
 
170 aa  87.8  8e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1853  hypothetical protein  32.1 
 
 
177 aa  87  2e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.922543  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00530  hypothetical protein  32.34 
 
 
179 aa  82.8  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000246936  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3951  hypothetical protein  32.08 
 
 
171 aa  82  0.000000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.757382  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3040  hypothetical protein  35.48 
 
 
173 aa  80.5  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.503627  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0915  hypothetical protein  36.18 
 
 
145 aa  67  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000324593  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35692  predicted protein  32.81 
 
 
326 aa  49.3  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.933776  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_35406  predicted protein  27.5 
 
 
294 aa  43.9  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.528252  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>