24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0656 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0656  hypothetical protein  100 
 
 		 462 aa  929    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000988469  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0110  hypothetical protein  50 
 
 		 454 aa  442  1e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3403  hypothetical protein  45.93 
 
 		 460 aa  378  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0717001  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3254  LamB porin family protein, putative  44.79 
 
 		 472 aa  344  2e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000126624  decreased coverage  1.37943e-21 
 
 
 
NC_002939  GSU3304  LamB porin family protein, putative  44.91 
 
 		 457 aa  317  2e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00991387  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0570  hypothetical protein  42.23 
 
 		 433 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.74433e-18 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0557  hypothetical protein  43.54 
 
 		 452 aa  289  6e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000338101  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1933  hypothetical protein  38.86 
 
 		 434 aa  241  1e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000351856  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0521  LamB porin family protein, putative  36.11 
 
 		 464 aa  241  2e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000174972  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2284  hypothetical protein  39.47 
 
 		 447 aa  239  5.999999999999999e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000344842 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2187  hypothetical protein  33.2 
 
 		 502 aa  238  2e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.080107  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3257  LamB porin family protein, putative  32.16 
 
 		 493 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000051646  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1309  hypothetical protein  30.91 
 
 		 381 aa  159  9e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1745  hypothetical protein  29.76 
 
 		 534 aa  73.2  0.000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000216111  unclonable  0.0000185199 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1010  hypothetical protein  27.55 
 
 		 447 aa  56.2  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.395908  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0652  hypothetical protein  30.22 
 
 		 448 aa  55.8  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.758355  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1310  hypothetical protein  46.15 
 
 		 376 aa  53.5  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2271  hypothetical protein  27.67 
 
 		 473 aa  52  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.62038e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2562  hypothetical protein  27.92 
 
 		 474 aa  51.6  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00382555 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1011  hypothetical protein  25.42 
 
 		 448 aa  50.1  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000669415  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1856  hypothetical protein  26.83 
 
 		 543 aa  50.1  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2846  hypothetical protein  22.83 
 
 		 464 aa  47  0.0007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0011  hypothetical protein  34.41 
 
 		 435 aa  45.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000177215  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1248  hypothetical protein  27.75 
 
 		 542 aa  43.5  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0419522  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>