More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2088 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1443  6-oxocyclohex-1-ene-1-carbonyl-CoA hydrolase  87.6 
 
 		 379 aa  709    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.238985  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2088  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 		 381 aa  795    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000000279295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3305  enoyl-CoA hydratase/isomerase  87.94 
 
 		 374 aa  691    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2811  6-oxocyclohex-1-ene-1-carbonyl-CoA hydrolase  88.95 
 
 		 381 aa  717    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2953  6-oxocyclohex-1-ene-1-carbonyl-CoA hydrolase  77.45 
 
 		 377 aa  613  9.999999999999999e-175  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.345678  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2930  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.86 
 
 		 264 aa  132  9e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0879  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.71 
 
 		 279 aa  124  3e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0912  naphthoate synthase  40.8 
 
 		 260 aa  120  3e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.092423  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4299  1,4-dihydroxy-2-naphthoate synthase  37.44 
 
 		 265 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1210  naphthoate synthase  38.27 
 
 		 271 aa  115  1.0000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.663428  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0110  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.2 
 
 		 263 aa  113  6e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.549312  normal  0.683018 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0786  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.87 
 
 		 260 aa  111  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.994732  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3916  1,4-dihydroxy-2-naphthoate synthase  37.36 
 
 		 260 aa  109  9.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1033  naphthoate synthase  36.78 
 
 		 260 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2567  naphthoate synthase  38.8 
 
 		 279 aa  107  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.522143  normal  0.0403307 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0632  naphthoate synthase  37.16 
 
 		 272 aa  107  2e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.556463  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6107  1,4-dihydroxy-2-naphthoate synthase  36.92 
 
 		 267 aa  108  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1127  naphthoate synthase  37.16 
 
 		 273 aa  107  3e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0434523  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1104  naphthoate synthase  37.16 
 
 		 273 aa  107  3e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2124  naphthoate synthase  36.78 
 
 		 260 aa  107  4e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000363984  normal  0.0450036 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0720  2-ketocyclohexanecarboxyl-CoA hydrolase  36.21 
 
 		 260 aa  107  5e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0562  naphthoate synthase  34.1 
 
 		 278 aa  105  9e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.348185  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2417  naphthoate synthase  34.02 
 
 		 285 aa  105  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.085961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1162  naphthoate synthase  36.76 
 
 		 275 aa  105  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000676396 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1186  2-ketocyclohexanecarboxyl-CoA hydrolase  37.36 
 
 		 262 aa  105  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02189  naphthoate synthase  34.68 
 
 		 285 aa  104  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1395  naphthoate synthase  34.68 
 
 		 285 aa  104  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4105  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.9 
 
 		 260 aa  104  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.920357 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1299  dihydroxynaphthoic acid synthase  33.5 
 
 		 270 aa  104  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.549258  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2641  naphthoate synthase  35.26 
 
 		 285 aa  105  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0549991  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1542  naphthoate synthase  35.63 
 
 		 260 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.04426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2408  naphthoate synthase  34.68 
 
 		 285 aa  104  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.146223  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3404  naphthoate synthase  35.26 
 
 		 285 aa  105  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.298382  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1386  naphthoate synthase  34.68 
 
 		 285 aa  104  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02148  hypothetical protein  34.68 
 
 		 285 aa  104  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2558  naphthoate synthase  34.68 
 
 		 285 aa  104  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.20576  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3201  naphthoate synthase  32.65 
 
 		 285 aa  104  3e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.354537  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1113  naphthoate synthase  32.65 
 
 		 285 aa  104  3e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.04669  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3281  naphthoate synthase  34.1 
 
 		 285 aa  103  3e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2812  naphthoate synthase  35.2 
 
 		 285 aa  104  3e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.921733 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1409  naphthoate synthase  36.81 
 
 		 279 aa  103  4e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004030  naphthoate synthase  34.1 
 
 		 288 aa  103  5e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6839  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.67 
 
 		 258 aa  103  5e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1047  naphthoate synthase  33.15 
 
 		 285 aa  103  6e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0636454  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1429  naphthoate synthase  33.89 
 
 		 267 aa  103  6e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.640248  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6400  naphthoate synthase  33.89 
 
 		 267 aa  103  6e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.64049  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3012  naphthoate synthase  33.52 
 
 		 285 aa  102  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2492  naphthoate synthase  34.68 
 
 		 285 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0682871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2547  naphthoate synthase  34.68 
 
 		 285 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0659643  normal  0.90285 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2535  naphthoate synthase  34.68 
 
 		 285 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2443  naphthoate synthase  34.68 
 
 		 285 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00319008  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2651  naphthoate synthase  34.68 
 
 		 285 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0194594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1616  naphthoate synthase  33.51 
 
 		 274 aa  101  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.796217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1231  naphthoate synthase  34.67 
 
 		 271 aa  101  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1591  naphthoate synthase  34.1 
 
 		 285 aa  102  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1484  naphthoate synthase  34.1 
 
 		 285 aa  102  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1783  naphthoate synthase  34.1 
 
 		 285 aa  102  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.485587 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2433  naphthoate synthase  35.75 
 
 		 273 aa  100  3e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0254  naphthoate synthase  34.92 
 
 		 272 aa  100  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000397858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4695  naphthoate synthase  34.92 
 
 		 272 aa  100  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0328  naphthoate synthase  34.57 
 
 		 273 aa  100  4e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0113118 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01431  naphthoate synthase  33.72 
 
 		 292 aa  100  4e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1101  naphthoate synthase  34.08 
 
 		 288 aa  100  4e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.648754  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1707  naphthoate synthase  36.02 
 
 		 276 aa  100  4e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1770  naphthoate synthase  34.46 
 
 		 263 aa  100  4e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.613192  normal  0.139098 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4984  naphthoate synthase  34.39 
 
 		 272 aa  99.8  7e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.269846  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3569  naphthoate synthase  35.23 
 
 		 273 aa  99.8  7e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.310251  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5013  naphthoate synthase  34.39 
 
 		 272 aa  99.4  8e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4748  naphthoate synthase  34.39 
 
 		 272 aa  99.8  8e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4586  naphthoate synthase  34.39 
 
 		 272 aa  99.8  8e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4608  naphthoate synthase  34.39 
 
 		 272 aa  99.8  8e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5109  naphthoate synthase  34.39 
 
 		 272 aa  99.8  8e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4966  naphthoate synthase  34.39 
 
 		 272 aa  99.8  8e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4995  naphthoate synthase  34.39 
 
 		 272 aa  99.4  8e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1559  naphthoate synthase  33.53 
 
 		 296 aa  99.4  9e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3491  naphthoate synthase  33.86 
 
 		 272 aa  99.4  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1719  naphthoate synthase  35.36 
 
 		 273 aa  99  1e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2797  naphthoate synthase  35.39 
 
 		 272 aa  99.4  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2050  naphthoate synthase  35.75 
 
 		 273 aa  98.6  1e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0570  naphthoate synthase  34.83 
 
 		 272 aa  99  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2091  naphthoate synthase  35.52 
 
 		 273 aa  98.2  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1880  naphthoate synthase  34.64 
 
 		 273 aa  96.3  8e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2077  naphthoate synthase  34.64 
 
 		 273 aa  95.5  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.310676 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1216  naphthoate synthase  34.07 
 
 		 274 aa  95.9  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0182076  hitchhiker  0.000174974 
 
 
-
 
NC_002950  PG1523  naphthoate synthase  34.62 
 
 		 272 aa  94.4  3e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000128514 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.95 
 
 		 260 aa  94  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04140  1,4-Dihydroxy-2-naphthoate synthase  34.95 
 
 		 279 aa  94  4e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.940341  normal  0.842204 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40076  predicted protein  33.17 
 
 		 337 aa  93.6  5e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2972  naphthoate synthase  34.44 
 
 		 279 aa  92.8  8e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8753  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.68 
 
 		 273 aa  92.4  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0594436 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5746  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 		 256 aa  92  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.426367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4267  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.95 
 
 		 258 aa  91.7  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.728636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1921  naphthoate synthase  33.52 
 
 		 272 aa  91.7  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0350  naphthoate synthase  31.61 
 
 		 280 aa  92  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1129  naphthoate synthase  31.84 
 
 		 283 aa  91.7  2e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33170  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  31.67 
 
 		 251 aa  92  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.119109  normal  0.701419 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2206  enoyl-CoA hydratase  32 
 
 		 263 aa  91.3  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.196867 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1753  naphthoate synthase  34.48 
 
 		 274 aa  90.9  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0472  naphthoate synthase  32.78 
 
 		 279 aa  90.9  4e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14020  1,4-Dihydroxy-2-naphthoate synthase  32.78 
 
 		 279 aa  90.9  4e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>