75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0671 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0671  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  100 
 
 		 127 aa  262  1e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.551037 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2805  nitrogenase molybdenum-iron cofactor biosynthesis protein NifX  85.04 
 
 		 129 aa  229  1e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0634  nitrogen fixation protein NifX  71.65 
 
 		 128 aa  203  7e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1202  nitrogen fixation protein NifX  71.65 
 
 		 128 aa  199  9.999999999999999e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.120985  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2140  nitrogen fixation protein NifX  69.6 
 
 		 129 aa  193  5.000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0156404 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3490  nitrogen fixation protein NifX  71.2 
 
 		 132 aa  192  2e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2078  nitrogen fixation protein NifX  68 
 
 		 129 aa  188  2e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3026  nitrogen fixation protein NifX  61.02 
 
 		 137 aa  161  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4458  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  53.54 
 
 		 135 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2101  nitrogen fixation protein NifX  50.42 
 
 		 119 aa  133  9e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1233  nitrogen fixation protein NifX  49.61 
 
 		 138 aa  131  3.9999999999999996e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000802968 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1515  nitrogen fixation protein NifX  49.61 
 
 		 138 aa  131  3.9999999999999996e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.19909  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0093  nitrogen fixation protein NifX  46.88 
 
 		 131 aa  130  5e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.071454  normal  0.884171 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1078  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  48.03 
 
 		 132 aa  128  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5920  nitrogenase molybdenum-iron protein nifX  48.09 
 
 		 131 aa  126  8.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.936872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2323  nitrogen fixation protein NifX  46.09 
 
 		 136 aa  126  1.0000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0653956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0974  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  46.46 
 
 		 155 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.649686  normal  0.349862 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1351  nitrogen fixation protein NifX  46.56 
 
 		 143 aa  125  3e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5096  nitrogen fixation protein NifX  45.67 
 
 		 132 aa  124  3e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1472  nitrogen fixation-related protein (NifX)  44.53 
 
 		 137 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.437364  decreased coverage  0.0000979183 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3627  nitrogen fixation protein NifX  45.31 
 
 		 133 aa  124  5e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.184482 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4483  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  44.63 
 
 		 144 aa  123  8.000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.746591  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0235  nitrogenase molybdenum-iron protein NifX  44.27 
 
 		 141 aa  122  2e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00441901  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3207  nitrogen fixation protein NifX  54.62 
 
 		 127 aa  119  9e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6876  nitrogen fixation protein NifX  45.76 
 
 		 148 aa  118  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.268079 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0478  nitrogen fixation protein NifX  45.86 
 
 		 134 aa  117  6e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7731  nitrogen fixation protein NifX  40.62 
 
 		 138 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3934  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  48.76 
 
 		 137 aa  114  6.9999999999999995e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0518816 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2284  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  41.27 
 
 		 162 aa  113  7.999999999999999e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1565  nitrogen fixation protein NifX  37.59 
 
 		 164 aa  112  2.0000000000000002e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4140  nitrogen fixation protein NifX  43.61 
 
 		 139 aa  111  4.0000000000000004e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.480569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4798  nitrogen fixation protein NifX  41.86 
 
 		 138 aa  106  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2114  nitrogen fixation protein NifX  41.98 
 
 		 136 aa  102  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0083007 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1251  nitrogen fixation protein NifX  36 
 
 		 157 aa  100  7e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2188  nitrogen fixation protein NifX  33.83 
 
 		 144 aa  100  9e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.141271 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0536  putative nitrogenase molybdenum-iron protein NifX  33.08 
 
 		 158 aa  98.2  3e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.697848  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6221  nitrogen fixation protein NifX  33.87 
 
 		 165 aa  98.6  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.550036  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1348  nitrogen fixation protein NifX  42.98 
 
 		 139 aa  97.8  4e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.802033  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3539  nitrogen fixation protein NifX  35.34 
 
 		 158 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.89885  decreased coverage  0.00377232 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4252  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  37.69 
 
 		 134 aa  94.4  5e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1818  nitrogen fixation protein NifX  37.98 
 
 		 135 aa  94  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1790  nitrogen fixation protein NifX  37.98 
 
 		 135 aa  94  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3991  nitrogen fixation protein NifX  34.96 
 
 		 163 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.370272  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4052  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  39.02 
 
 		 133 aa  91.7  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.147779  normal  0.370681 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1410  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  39.83 
 
 		 243 aa  91.3  4e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0617008 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01420  Nitrogenase iron molybdenum cofactor biosynthesis protein  39.83 
 
 		 242 aa  90.1  9e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01480  Nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifX  35.83 
 
 		 158 aa  89.7  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0460  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  32.92 
 
 		 168 aa  89.4  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0648445 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1054  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  41.32 
 
 		 123 aa  89.4  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50910  Nitrogen fixation-related protein, gamma subunit  36.44 
 
 		 243 aa  88.6  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0585445  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1058  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  33.6 
 
 		 128 aa  85.5  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1198  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  39.34 
 
 		 227 aa  84  7e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.127129  hitchhiker  0.000500892 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0270  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  33.88 
 
 		 247 aa  81.6  0.000000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0265  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  30.71 
 
 		 161 aa  75.1  0.0000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0495  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  35.54 
 
 		 220 aa  74.3  0.0000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1193  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  30.77 
 
 		 146 aa  72  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000688158 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1506  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  29.66 
 
 		 159 aa  71.6  0.000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1455  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  29.92 
 
 		 247 aa  71.2  0.000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02570  nitrogen fixation-related protein, vnfY  26.57 
 
 		 161 aa  68.6  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0717484  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0499  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  29.17 
 
 		 155 aa  59.3  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0111  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  27.05 
 
 		 520 aa  50.8  0.000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.987458 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2272  hypothetical protein  29.41 
 
 		 154 aa  50.4  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.64496  normal  0.15097 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0631  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  31.86 
 
 		 110 aa  49.7  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30958  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48700  Metallocluster binding protein of the NafY/NifY/NifX/VnfX family  29.67 
 
 		 120 aa  50.1  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5904  nitrogenase FeMo cofactor biosynthesis protein NifB  30.34 
 
 		 520 aa  47  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0204  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  29.67 
 
 		 522 aa  45.8  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.037885  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3646  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  29.21 
 
 		 519 aa  45.1  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.304877 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0058  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  31.94 
 
 		 106 aa  44.3  0.0006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0199747  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1567  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis  31.33 
 
 		 111 aa  43.5  0.0009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2599  Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  28.57 
 
 		 127 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0187403  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1036  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  35.23 
 
 		 123 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2103  putative nitrogen fixation protein  27.03 
 
 		 115 aa  42.7  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1796  dinitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein  32.89 
 
 		 106 aa  40.8  0.007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.893199  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1206  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  31.58 
 
 		 464 aa  40.4  0.008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.65726  normal  0.0423889 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02740  nitrogenase biosynthetic protein vnfX  20.69 
 
 		 182 aa  40.4  0.009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>