More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2538 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_2538  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  100 
 
 		 241 aa  495  1e-139  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1926  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  58.08 
 
 		 245 aa  246  2e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.661137  normal  0.820944 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2473  HAD family hydrolase  40 
 
 		 230 aa  137  2e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0237734  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3250  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.95 
 
 		 223 aa  121  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.313411 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5789  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  35.91 
 
 		 248 aa  116  3.9999999999999997e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.805096 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2561  HAD family hydrolase  36.62 
 
 		 214 aa  112  5e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.467395  normal  0.978444 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1543  HAD family hydrolase  38.2 
 
 		 218 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.290377 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0902  hydrolase, haloacid dehalogenase-like hydrolase  36.98 
 
 		 214 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5021  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.39 
 
 		 223 aa  108  6e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.886555  normal  0.11436 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0271  hypothetical protein  31.63 
 
 		 229 aa  107  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.586518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2303  HAD family hydrolase  35.71 
 
 		 230 aa  107  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.432343  normal  0.0684019 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0109  HAD family hydrolase  34.07 
 
 		 223 aa  106  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00453013 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1725  HAD family hydrolase  32.78 
 
 		 228 aa  103  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0089  hypothetical protein  32.78 
 
 		 228 aa  102  6e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.16166  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2743  HAD family hydrolase  32.77 
 
 		 227 aa  102  6e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.994994  normal  0.0511558 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2542  HAD family hydrolase  34.62 
 
 		 214 aa  101  9e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.214098 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6015  HAD family hydrolase  32.78 
 
 		 228 aa  101  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3004  HAD family hydrolase  36.41 
 
 		 214 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.293742 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0636  HAD family hydrolase  31.17 
 
 		 252 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1679  HAD family hydrolase  33.33 
 
 		 228 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.329871  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0130  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.61 
 
 		 232 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0122  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.61 
 
 		 229 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0082  HAD family hydrolase  35.83 
 
 		 232 aa  99  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0196618  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0336  HAD-superfamily hydrolase  35.83 
 
 		 232 aa  99  6e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.438572  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2468  HAD-superfamily hydrolase  35.83 
 
 		 232 aa  99  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.273983  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0634  HAD-superfamily hydrolase  35.83 
 
 		 232 aa  99  6e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.535941  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3367  isochorismate synthase  30.34 
 
 		 208 aa  97.4  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0514575 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5978  HAD family hydrolase  32.45 
 
 		 230 aa  96.7  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.367832 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0412  HAD family hydrolase  31.72 
 
 		 230 aa  96.7  3e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.983661  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0142  HAD family hydrolase  30.81 
 
 		 235 aa  95.5  7e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0442  HAD family hydrolase  29.25 
 
 		 218 aa  95.5  7e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3616  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.7 
 
 		 228 aa  95.5  7e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1038  HAD-superfamily hydrolase  35.96 
 
 		 232 aa  95.1  8e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0879  HAD family hydrolase  35.96 
 
 		 232 aa  95.1  8e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3293  HAD family hydrolase  33.33 
 
 		 245 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.567903  normal  0.782847 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3783  HAD family hydrolase  33.52 
 
 		 242 aa  94  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0711244  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4509  HAD family hydrolase  32.26 
 
 		 225 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07310  putative hydrolase  34.78 
 
 		 224 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.642028  normal  0.985429 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3493  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.88 
 
 		 228 aa  93.2  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.292984 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0589  HAD family hydrolase  32.45 
 
 		 217 aa  93.2  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0467  HAD family hydrolase  31.87 
 
 		 219 aa  93.6  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.577769 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1631  HAD family hydrolase  33.72 
 
 		 230 aa  93.2  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.318646  normal  0.223643 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0045  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  32.04 
 
 		 232 aa  93.2  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.605496  normal  0.617373 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0698  HAD-superfamily hydrolase  35.59 
 
 		 232 aa  92.4  5e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4133  6-phosphogluconate phosphatase  29.91 
 
 		 221 aa  92.8  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0258255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4240  6-phosphogluconate phosphatase  29.91 
 
 		 221 aa  92.4  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0636361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2076  HAD family hydrolase  31.11 
 
 		 244 aa  92.4  6e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.140944  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2687  HAD family hydrolase  31.11 
 
 		 244 aa  92.4  6e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0959  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3 family protein  32.6 
 
 		 216 aa  92  7e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0734377  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2716  HAD family hydrolase  31.11 
 
 		 228 aa  92  7e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4727  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.13 
 
 		 230 aa  92  7e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3323  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.59 
 
 		 228 aa  92  8e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.866957  normal  0.157588 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3773  HAD family hydrolase  33.02 
 
 		 220 aa  91.7  8e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5532  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.81 
 
 		 214 aa  91.7  9e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5146  6-phosphogluconate phosphatase  28.84 
 
 		 221 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.107109 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0642  HAD family hydrolase  31.22 
 
 		 255 aa  91.3  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.911495  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4183  6-phosphogluconate phosphatase  29.91 
 
 		 221 aa  91.3  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.201399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4184  HAD family hydrolase  28.89 
 
 		 212 aa  91.3  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4061  6-phosphogluconate phosphatase  29.91 
 
 		 221 aa  91.3  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0665  haloacid dehalogenase, IA family protein  33.7 
 
 		 231 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.233376  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0243  HAD family hydrolase  31.46 
 
 		 217 aa  90.5  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2352  HAD family hydrolase  33.15 
 
 		 222 aa  90.1  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00492029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0545  HAD-superfamily hydrolase  28.29 
 
 		 246 aa  89.4  4e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0453  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.58 
 
 		 219 aa  89.4  5e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0539  HAD family hydrolase  34.76 
 
 		 231 aa  89.4  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.598939  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0637  HAD family hydrolase  31.69 
 
 		 230 aa  89.4  5e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.808868  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0085  HAD family hydrolase  33.89 
 
 		 228 aa  89  6e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4082  6-phosphogluconate phosphatase  28.84 
 
 		 221 aa  88.6  8e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.580327 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4120  HAD family hydrolase  30.05 
 
 		 237 aa  88.2  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0610  HAD family hydrolase  31.91 
 
 		 260 aa  87.4  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0418  HAD family hydrolase  27.93 
 
 		 228 aa  87.4  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.513093 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4142  6-phosphogluconate phosphatase  28.57 
 
 		 221 aa  87.4  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4494  HAD family hydrolase  32.52 
 
 		 217 aa  87.4  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.901613 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4077  6-phosphogluconate phosphatase  29.58 
 
 		 221 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0996  HAD family hydrolase  33.33 
 
 		 219 aa  87  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0106068 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3573  hypothetical protein  28.96 
 
 		 224 aa  87.4  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.141866  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03599  predicted hydrolase  27.1 
 
 		 221 aa  86.7  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4252  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.1 
 
 		 221 aa  86.7  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3929  6-phosphogluconate phosphatase  27.1 
 
 		 221 aa  86.7  3e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03543  hypothetical protein  27.1 
 
 		 221 aa  86.7  3e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4279  6-phosphogluconate phosphatase  27.1 
 
 		 221 aa  86.7  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4224  6-phosphogluconate phosphatase  27.1 
 
 		 221 aa  86.7  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0268  HAD family hydrolase  29.3 
 
 		 225 aa  86.3  4e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1080  hypothetical protein  32.24 
 
 		 229 aa  85.9  5e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0875  HAD family hydrolase  36.84 
 
 		 232 aa  85.9  5e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1899  HAD family hydrolase  24.66 
 
 		 233 aa  85.9  5e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.629061  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4162  6-phosphogluconate phosphatase  30.99 
 
 		 222 aa  85.9  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.463446  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5788  HAD family hydrolase  32.53 
 
 		 227 aa  85.5  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.438539 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0780  HAD family hydrolase  30.32 
 
 		 227 aa  85.5  6e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3772  2-deoxyglucose-6-phosphatase  30.18 
 
 		 218 aa  85.5  6e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2605  HAD family hydrolase  30.85 
 
 		 240 aa  85.5  6e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2741  HAD family hydrolase  30.85 
 
 		 240 aa  85.1  8e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2485  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.59 
 
 		 238 aa  85.1  9e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0603  HAD family hydrolase  31.72 
 
 		 230 aa  85.1  9e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.432882  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0461  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.75 
 
 		 217 aa  85.1  9e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0110  HAD family hydrolase  30 
 
 		 227 aa  85.1  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2640  HAD family hydrolase  34.97 
 
 		 237 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.576989  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1190  hypothetical protein  31.4 
 
 		 204 aa  84.7  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.995327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0113  HAD family hydrolase  29.38 
 
 		 215 aa  84.3  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.254082  normal  0.189909 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3074  HAD family hydrolase  29.5 
 
 		 222 aa  84.3  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>