46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1894 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1894  putative ATP synthase  100 
 
 		 108 aa  213  5e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0232779 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3247  hypothetical protein  40.4 
 
 		 123 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6943  hypothetical protein  55.38 
 
 		 125 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0327018 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7656  hypothetical protein  38.46 
 
 		 126 aa  62  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.120785  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3673  hypothetical protein  36.17 
 
 		 111 aa  58.2  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000387976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0831  FoF1 ATP synthase, subunit I  36.94 
 
 		 128 aa  57  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.101619 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0189  hypothetical protein  35.64 
 
 		 111 aa  53.9  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0744  hypothetical protein  43.06 
 
 		 123 aa  53.9  0.0000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.32586  normal  0.360588 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1386  ATP synthase protein I  49.15 
 
 		 91 aa  53.9  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0698  hypothetical protein  39.34 
 
 		 141 aa  53.1  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0270  FoF1 ATP synthase, subunit I  37.04 
 
 		 127 aa  53.1  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0239  FoF1 ATP synthase, subunit I  36.05 
 
 		 127 aa  52  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2595  ATP synthase F0, subunit I  47.17 
 
 		 113 aa  52.4  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00463887 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0553  ATP synthase protein, subunit I  42.42 
 
 		 112 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3823  hypothetical protein  39.18 
 
 		 144 aa  51.2  0.000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0442976 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1583  ATP synthase protein I  43.75 
 
 		 71 aa  50.4  0.000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0022057  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0915  FoF1 ATP synthase, subunit I  28.87 
 
 		 128 aa  50.4  0.000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.668534  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0375  hypothetical protein  44.83 
 
 		 145 aa  50.1  0.00001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4570  FoF1 ATP synthase, subunit I  51.02 
 
 		 128 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0511  ATP synthase protein, subunit I  32.41 
 
 		 110 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.277873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2880  hypothetical protein  28.04 
 
 		 113 aa  49.3  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.737806  normal  0.211367 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0695  hypothetical protein  33.33 
 
 		 143 aa  48.1  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1980  FoF1 ATP synthase, subunit I  40.3 
 
 		 127 aa  47.8  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.596839  normal  0.0599038 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2700  FoF1 ATP synthase, subunit I  35.23 
 
 		 111 aa  46.2  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.571975  normal  0.0892291 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1039  FoF1 ATP synthase, subunit I  35.23 
 
 		 111 aa  46.2  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0928  ATP synthase subunit I  37.93 
 
 		 115 aa  45.8  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.826917  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3929  hypothetical protein  36.84 
 
 		 80 aa  45.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000115703  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0381  ATP sythase protein I, putative  42 
 
 		 132 aa  45.4  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2252  hypothetical protein  45.65 
 
 		 118 aa  45.4  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00019318  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0499  ATP sythase I  41.82 
 
 		 132 aa  45.8  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.417293  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3031  ATP synthase F0  39.66 
 
 		 110 aa  45.4  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.285856 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4013  hypothetical protein  36.84 
 
 		 80 aa  45.4  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.49788e-30 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0446  putative FOF1 ATP synthase, subunit I transmembrane protein  31.18 
 
 		 119 aa  45.1  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.912309  normal  0.120038 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4482  hypothetical protein  28.89 
 
 		 106 aa  45.1  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.597175 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0393  putative ATP sythase protein I  42 
 
 		 132 aa  45.4  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2667  hypothetical protein  47.73 
 
 		 78 aa  45.1  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000715899  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2089  ATP synthase protein I  39.39 
 
 		 101 aa  44.7  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0218096  normal  0.87278 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0715  hypothetical protein  31.31 
 
 		 124 aa  43.5  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.631945  normal  0.508769 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3140  hypothetical protein  44.9 
 
 		 80 aa  42.7  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000379803  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2797  ATP synthase protein I  30.3 
 
 		 87 aa  42.7  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0200156  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0013  hypothetical protein  39.29 
 
 		 82 aa  42.4  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000501969  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0766  ATP synthase F0, subunit I  30.34 
 
 		 120 aa  42  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1509  hypothetical protein  42.55 
 
 		 79 aa  40.8  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3176  hypothetical protein  35.19 
 
 		 122 aa  40.4  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.984172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0333  hypothetical protein  32.14 
 
 		 96 aa  40.4  0.009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4817  FoF1 ATP synthase, subunit I  36.05 
 
 		 123 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.340179  normal  0.811608 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>