33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1885 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1885  hypothetical protein  100 
 
 		 162 aa  326  8e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.116311  decreased coverage  0.00989828 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3523  hypothetical protein  44.83 
 
 		 161 aa  122  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1413  hypothetical protein  42.45 
 
 		 160 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000339871 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4689  hypothetical protein  44.97 
 
 		 155 aa  92  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.679753 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0930  hypothetical protein  42.18 
 
 		 149 aa  90.5  8e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.299203  normal  0.372054 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4545  hypothetical protein  42.57 
 
 		 155 aa  87  9e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.274906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4176  hypothetical protein  42.57 
 
 		 155 aa  86.3  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1835  hypothetical protein  32.61 
 
 		 146 aa  75.1  0.0000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03832  hypothetical protein  28.87 
 
 		 147 aa  71.2  0.000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0547406  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3060  hypothetical protein  33.11 
 
 		 152 aa  70.9  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.589548 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1535  hypothetical protein  30.99 
 
 		 150 aa  67.4  0.00000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3242  hypothetical protein  30.07 
 
 		 145 aa  65.1  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.613004  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3141  hypothetical protein  30.07 
 
 		 145 aa  65.1  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.820618  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0698  hypothetical protein  29.29 
 
 		 147 aa  63.5  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0315317  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0709  hypothetical protein  30 
 
 		 159 aa  62.8  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.16043e-28 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1641  hypothetical protein  32.21 
 
 		 158 aa  62  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000251884  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0865  hypothetical protein  28.26 
 
 		 151 aa  60.8  0.000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.580747  normal  0.63192 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1238  hypothetical protein  28.57 
 
 		 160 aa  60.8  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.3294  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3043  hypothetical protein  30.77 
 
 		 145 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.173126  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0250  hypothetical protein  29.37 
 
 		 146 aa  58.9  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.846895  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1953  hypothetical protein  28.26 
 
 		 155 aa  58.5  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2835  hypothetical protein  31.82 
 
 		 182 aa  55.8  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0924305  normal  0.295808 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1833  hypothetical protein  26.21 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00164737  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0286  hypothetical protein  29.55 
 
 		 154 aa  52  0.000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1560  hypothetical protein  25 
 
 		 150 aa  50.4  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.704785 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2956  hypothetical protein  28.06 
 
 		 153 aa  48.1  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.296838  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0643  hypothetical protein  25.74 
 
 		 151 aa  47.8  0.00007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.792914  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0260  hypothetical protein  24.48 
 
 		 152 aa  47.4  0.00008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.275031  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1798  hypothetical protein  27.21 
 
 		 160 aa  47.4  0.00008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.425473 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0507  hypothetical protein  32.97 
 
 		 160 aa  46.2  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0906713  normal  0.610727 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5116  hypothetical protein  25.19 
 
 		 144 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.965316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2378  hypothetical protein  34.91 
 
 		 150 aa  46.6  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13471  HAMP domain-containing protein  28.91 
 
 		 132 aa  45.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>