59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0043 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_0043  hypothetical protein  100 
 
 
170 aa  340  5.999999999999999e-93  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.132531  normal  0.0395538 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2816  hypothetical protein  60.93 
 
 
171 aa  164  4e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3635  hypothetical protein  59.06 
 
 
167 aa  163  1.0000000000000001e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.514742  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2951  hypothetical protein  57.97 
 
 
170 aa  153  1e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1286  hypothetical protein  52.86 
 
 
186 aa  147  7e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1770  hypothetical protein  49.35 
 
 
178 aa  147  8e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.117901 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5035  hypothetical protein  55.33 
 
 
170 aa  145  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.349078 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0334  hypothetical protein  55.56 
 
 
179 aa  142  3e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0085748 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0966  hypothetical protein  50.38 
 
 
181 aa  130  9e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0228  hypothetical protein  48.92 
 
 
225 aa  129  2.0000000000000002e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.202432  normal  0.354498 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1662  hypothetical protein  51.08 
 
 
197 aa  128  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.35409 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0095  hypothetical protein  46.38 
 
 
213 aa  126  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.250747  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0176  hypothetical protein  43.67 
 
 
173 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.754868  normal  0.876478 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1577  hypothetical protein  50.76 
 
 
197 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.0747974 
 
 
-
 
NC_004310  BR2007  hypothetical protein  49.62 
 
 
167 aa  123  1e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.100253  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3790  hypothetical protein  50.35 
 
 
168 aa  123  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.231006 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1930  hypothetical protein  49.62 
 
 
167 aa  123  1e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1856  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  50 
 
 
197 aa  122  3e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.809056 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1019  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  51.18 
 
 
177 aa  121  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0088  hypothetical protein  45.21 
 
 
189 aa  121  5e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.600446  normal  0.0826635 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0439  hypothetical protein  41.94 
 
 
189 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4226  hypothetical protein  45.26 
 
 
186 aa  119  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0287  hypothetical protein  38.75 
 
 
187 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0382  hypothetical protein  44.06 
 
 
189 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.687515  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1401  hypothetical protein  50.79 
 
 
177 aa  115  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0281  hypothetical protein  43.38 
 
 
199 aa  115  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.117733 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0049  hypothetical protein  44.85 
 
 
151 aa  111  5e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.286188 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0041  hypothetical protein  46.81 
 
 
164 aa  110  7.000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000155161 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3057  hypothetical protein  45.11 
 
 
182 aa  110  9e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3423  hypothetical protein  44.53 
 
 
204 aa  110  9e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4106  hypothetical protein  47.62 
 
 
185 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.382148 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3130  hypothetical protein  45.32 
 
 
164 aa  106  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00016542 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2376  hypothetical protein  47.45 
 
 
174 aa  105  3e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0061  hypothetical protein  39.31 
 
 
202 aa  104  5e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0415  hypothetical protein  43.06 
 
 
192 aa  104  6e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.659798  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3762  hypothetical protein  40.74 
 
 
173 aa  104  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0845  hypothetical protein  45.07 
 
 
164 aa  102  4e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2503  hypothetical protein  45.07 
 
 
164 aa  102  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.984407 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4087  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  40 
 
 
173 aa  100  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0547  hypothetical protein  39.02 
 
 
275 aa  99  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2911  hypothetical protein  38.4 
 
 
503 aa  78.2  0.00000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000449033 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3257  hypothetical protein  32.54 
 
 
288 aa  75.9  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1372  hypothetical protein  37.6 
 
 
503 aa  75.5  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0697094  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0735  hypothetical protein  34.4 
 
 
358 aa  71.6  0.000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0966  hypothetical protein  33.58 
 
 
248 aa  68.6  0.00000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1793  hypothetical protein  28.35 
 
 
226 aa  63.9  0.000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2747  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.21 
 
 
216 aa  62.4  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10314  hypothetical protein  30.28 
 
 
218 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0397  hypothetical protein  31.94 
 
 
217 aa  57  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0406  hypothetical protein  31.94 
 
 
217 aa  57  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.99368 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2092  hypothetical protein  28.57 
 
 
295 aa  56.6  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0385  hypothetical protein  31.94 
 
 
217 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.195483 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04119  hypothetical protein  29.85 
 
 
248 aa  52.4  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.997583  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1667  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.21 
 
 
314 aa  51.2  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0431  hypothetical protein  29.25 
 
 
230 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.329815 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0310  hypothetical protein  29.86 
 
 
221 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.139767 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3678  hypothetical protein  29.71 
 
 
222 aa  48.9  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0369739  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0976  GW repeat-containing protein  25.48 
 
 
530 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.306565  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0337  hypothetical protein  28.57 
 
 
253 aa  44.7  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>