48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3423 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_3423  hypothetical protein  100 
 
 
204 aa  415  9.999999999999999e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0966  hypothetical protein  56.4 
 
 
181 aa  186  3e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3057  hypothetical protein  50 
 
 
182 aa  184  5e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4226  hypothetical protein  52.35 
 
 
186 aa  184  8e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3762  hypothetical protein  50.58 
 
 
173 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2007  hypothetical protein  52.6 
 
 
167 aa  167  9e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.100253  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1930  hypothetical protein  52.6 
 
 
167 aa  167  9e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0061  hypothetical protein  46.28 
 
 
202 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4087  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  48.26 
 
 
173 aa  158  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1577  hypothetical protein  43.88 
 
 
197 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.0747974 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0334  hypothetical protein  44.13 
 
 
179 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0085748 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1856  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  44.04 
 
 
197 aa  139  3e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.809056 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0228  hypothetical protein  47.9 
 
 
225 aa  139  3e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.202432  normal  0.354498 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1770  hypothetical protein  44.89 
 
 
178 aa  137  7.999999999999999e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.117901 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1662  hypothetical protein  44.69 
 
 
197 aa  137  1e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.35409 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1286  hypothetical protein  45.18 
 
 
186 aa  135  5e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0176  hypothetical protein  42.35 
 
 
173 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.754868  normal  0.876478 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0382  hypothetical protein  43.27 
 
 
189 aa  128  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.687515  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2951  hypothetical protein  52.08 
 
 
170 aa  127  2.0000000000000002e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3635  hypothetical protein  44.23 
 
 
167 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.514742  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0281  hypothetical protein  39.64 
 
 
199 aa  124  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.117733 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1401  hypothetical protein  50 
 
 
177 aa  123  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0287  hypothetical protein  39.63 
 
 
187 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0439  hypothetical protein  36.92 
 
 
189 aa  118  7e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1019  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  47.68 
 
 
177 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0095  hypothetical protein  42.76 
 
 
213 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.250747  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0043  hypothetical protein  44.6 
 
 
170 aa  116  3e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.132531  normal  0.0395538 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0088  hypothetical protein  40.37 
 
 
189 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.600446  normal  0.0826635 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0049  hypothetical protein  46.1 
 
 
151 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.286188 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2816  hypothetical protein  45.19 
 
 
171 aa  112  3e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2376  hypothetical protein  52.31 
 
 
174 aa  112  5e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0041  hypothetical protein  42.67 
 
 
164 aa  111  7.000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000155161 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4106  hypothetical protein  47.52 
 
 
185 aa  111  8.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.382148 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0845  hypothetical protein  41.06 
 
 
164 aa  107  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2503  hypothetical protein  41.06 
 
 
164 aa  107  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.984407 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5035  hypothetical protein  44.2 
 
 
170 aa  104  8e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.349078 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3130  hypothetical protein  40.4 
 
 
164 aa  103  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00016542 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0415  hypothetical protein  37.22 
 
 
192 aa  100  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.659798  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3790  hypothetical protein  38.99 
 
 
168 aa  99.8  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.231006 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0547  hypothetical protein  34.72 
 
 
275 aa  74.7  0.0000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1372  hypothetical protein  31.33 
 
 
503 aa  64.7  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0697094  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2911  hypothetical protein  29.7 
 
 
503 aa  62.8  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000449033 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3257  hypothetical protein  31.37 
 
 
288 aa  57.8  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1793  hypothetical protein  25.87 
 
 
226 aa  57.4  0.0000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0976  GW repeat-containing protein  30.43 
 
 
530 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.306565  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3678  hypothetical protein  32.19 
 
 
222 aa  44.3  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0369739  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2747  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.93 
 
 
216 aa  43.5  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1667  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.91 
 
 
314 aa  43.9  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>