209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4248 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4248  H(+)-transporting two-sector ATPase  100 
 
 		 443 aa  867    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36680  Trk-type K+ transport system, membrane component  53.53 
 
 		 432 aa  417  9.999999999999999e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0226532  normal  0.574785 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1512  H(+)-transporting two-sector ATPase  54.52 
 
 		 454 aa  407  1.0000000000000001e-112  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112909 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1634  H(+)-transporting two-sector ATPase  54.05 
 
 		 479 aa  392  1e-108  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.717149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1511  H(+)-transporting two-sector ATPase  50.45 
 
 		 452 aa  385  1e-106  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112441 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1710  H(+)-transporting two-sector ATPase  51.76 
 
 		 449 aa  383  1e-105  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.438668  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2842  H(+)-transporting two-sector ATPase  49.44 
 
 		 446 aa  382  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.115847  normal  0.0824986 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2860  H(+)-transporting two-sector ATPase  52.13 
 
 		 460 aa  372  1e-102  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.704642 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4696  H(+)-transporting two-sector ATPase  54.52 
 
 		 452 aa  373  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.307434  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0524  H(+)-transporting two-sector ATPase  47.06 
 
 		 473 aa  369  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3754  cation transporter  51.12 
 
 		 464 aa  369  1e-101  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7572  cation transporter  48.42 
 
 		 444 aa  371  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.807634  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14850  potassium uptake protein, TrkH family  48.62 
 
 		 431 aa  367  1e-100  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.599997  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0215  cation transporter  50 
 
 		 443 aa  357  1.9999999999999998e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0397  cation transporter  50.23 
 
 		 443 aa  355  6.999999999999999e-97  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06990  Trk-type K+ transport system, membrane component  47.63 
 
 		 458 aa  352  7e-96  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2302  putative cation transporter  48.19 
 
 		 469 aa  346  4e-94  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0373  H(+)-transporting two-sector ATPase  47.4 
 
 		 444 aa  344  2e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.468283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0444  H(+)-transporting two-sector ATPase  47.76 
 
 		 444 aa  342  1e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.897006  hitchhiker  0.000125843 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4246  H(+)-transporting two-sector ATPase  51.76 
 
 		 450 aa  338  1.9999999999999998e-91  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.453683 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3573  H(+)-transporting two-sector ATPase  49.32 
 
 		 442 aa  335  9e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.250788 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3269  H(+)-transporting two-sector ATPase  44.92 
 
 		 456 aa  332  6e-90  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.724123  normal  0.0805206 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0506  H(+)-transporting two-sector ATPase  44.8 
 
 		 458 aa  330  4e-89  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.042504 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0458  H(+)-transporting two-sector ATPase  48.19 
 
 		 444 aa  325  7e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11710  potassium uptake protein, TrkH family  40.49 
 
 		 446 aa  317  3e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000213719  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0429  H(+)-transporting two-sector ATPase  45.07 
 
 		 461 aa  310  5e-83  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0140  TrkH family potassium uptake protein  42.17 
 
 		 447 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000106231  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24340  Trk-type K+ transport system, membrane component  45.95 
 
 		 471 aa  305  1.0000000000000001e-81  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2746  H(+)-transporting two-sector ATPase  45.5 
 
 		 457 aa  302  6.000000000000001e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.111298  hitchhiker  0.000348018 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3144  H(+)-transporting two-sector ATPase  44.82 
 
 		 477 aa  300  3e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.197302 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3346  cation transporter  44.14 
 
 		 477 aa  293  6e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1755  K+ transporter Trk  44.08 
 
 		 443 aa  291  1e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000259228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1067  potassium uptake protein, TrkH family  40.45 
 
 		 445 aa  291  2e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1616  TrkH family potassium uptake protein  40.77 
 
 		 444 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000038325  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11700  potassium uptake protein, TrkH family  39.19 
 
 		 441 aa  284  2.0000000000000002e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00105837  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0431  potassium uptake protein, TrkH family  38.93 
 
 		 446 aa  282  9e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000154787  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3883  TrkH family potassium uptake protein  38.72 
 
 		 443 aa  277  3e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00920835 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1658  TrkH family potassium uptake protein  37.72 
 
 		 450 aa  276  4e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.552595  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2143  TrkH family potassium uptake protein  38.93 
 
 		 446 aa  273  4.0000000000000004e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00831138  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18030  Trk-type K+ transport system, membrane component  44.07 
 
 		 491 aa  273  4.0000000000000004e-72  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.834963  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1442  potassium uptake protein, TrkH family  38.34 
 
 		 447 aa  273  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3901  potassium uptake protein, TrkH family  38.12 
 
 		 447 aa  273  6e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1312  TrkH family potassium uptake protein  38.57 
 
 		 447 aa  271  2e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.03643  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1855  TrkH family potassium uptake protein  38.43 
 
 		 446 aa  270  4e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000925763  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1115  TrkH family potassium uptake protein  39.15 
 
 		 447 aa  269  5.9999999999999995e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.447299  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1274  potassium/sodium uptake protein  38.34 
 
 		 447 aa  269  8e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1275  potassium/sodium uptake protein  38.34 
 
 		 447 aa  269  8e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.185636  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1509  TrkH family potassium uptake protein  37.89 
 
 		 447 aa  266  7e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.556551  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1301  TrkH family potassium uptake protein  38.12 
 
 		 447 aa  266  7e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0881391  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1409  TrkH family potassium uptake protein  38.12 
 
 		 447 aa  266  7e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.49277  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1480  potassium uptake protein, TrkH family  38.12 
 
 		 447 aa  266  7e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1548  potassium uptake protein, TrkH family  37.67 
 
 		 447 aa  265  1e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0388885  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1583  K+ transporter Trk  38.7 
 
 		 458 aa  262  1e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5257  potassium uptake protein, TrkH family  39.78 
 
 		 443 aa  261  2e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0320519  normal  0.460261 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0518  H(+)-transporting two-sector ATPase  36.2 
 
 		 457 aa  259  5.0000000000000005e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.32097  normal  0.402385 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3549  K+ transporter Trk  38.75 
 
 		 449 aa  258  1e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.840794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3208  potassium uptake protein, TrkH family  41.26 
 
 		 443 aa  258  1e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.554615 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1080  K+ transporter Trk  41.03 
 
 		 447 aa  257  3e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00642094 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0545  TrkH family potassium uptake protein  40.53 
 
 		 458 aa  254  2.0000000000000002e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0415  H(+)-transporting two-sector ATPase  35.56 
 
 		 455 aa  250  3e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000197091  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1584  potassium uptake protein, TrkH family  36.71 
 
 		 446 aa  250  4e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000191225  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2080  potassium uptake protein, TrkH family  37.28 
 
 		 447 aa  249  9e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000161963  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2829  potassium uptake protein, TrkH family  38.73 
 
 		 453 aa  249  1e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0462619 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0338  H(+)-transporting two-sector ATPase  35.89 
 
 		 456 aa  246  4.9999999999999997e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.029372  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0103  potassium uptake protein, TrkH family  39.37 
 
 		 443 aa  245  9.999999999999999e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000278363  decreased coverage  8.777620000000001e-18 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0312  TrkH family potassium uptake protein  34.16 
 
 		 574 aa  244  1.9999999999999999e-63  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00568204  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2521  cation transporter  38.65 
 
 		 445 aa  244  3e-63  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0493111  normal  0.0380202 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1794  H(+)-transporting two-sector ATPase  40.75 
 
 		 453 aa  243  3.9999999999999997e-63  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0376  cation transport protein  38.27 
 
 		 439 aa  243  7e-63  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0013  H(+)-transporting two-sector ATPase  35.12 
 
 		 442 aa  241  2e-62  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3602  cation transporter  37.31 
 
 		 457 aa  241  2.9999999999999997e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0795  Trk-type K+ transport systems membrane component  35.89 
 
 		 488 aa  239  9e-62  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.937253  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0628  H(+)-transporting two-sector ATPase  39.16 
 
 		 417 aa  237  3e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4805  K+ transporter Trk  38.64 
 
 		 422 aa  237  3e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1607  K+ uptake transporter, KtrB subunit  34.42 
 
 		 586 aa  237  4e-61  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00112335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4053  potassium uptake protein, TrkH family  39.57 
 
 		 454 aa  237  4e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4092  potassium uptake protein, TrkH family  39.57 
 
 		 454 aa  237  4e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.407165  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3464  potassium uptake protein, TrkH family  38.48 
 
 		 444 aa  236  7e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1835  cation transporter  34.42 
 
 		 586 aa  236  9e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.120084  normal  0.898069 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0248  potassium uptake protein, TrkH family  34.23 
 
 		 451 aa  235  9e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000139888  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0749  TrkH family potassium uptake protein  38.26 
 
 		 441 aa  235  1.0000000000000001e-60  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.313509 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0121  potassium uptake protein, TrkH family  36.7 
 
 		 449 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000217077  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1558  H(+)-transporting two-sector ATPase  35.33 
 
 		 447 aa  234  2.0000000000000002e-60  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.206556  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1834  H(+)-transporting two-sector ATPase  34.81 
 
 		 633 aa  234  3e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1540  H(+)-transporting two-sector ATPase  38.14 
 
 		 454 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.935092 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0727  potassium uptake protein, TrkH family  41.03 
 
 		 429 aa  231  1e-59  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.157517  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1462  potassium uptake protein, TrkH family  35.79 
 
 		 443 aa  230  4e-59  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000505239  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3556  H(+)-transporting two-sector ATPase  34.41 
 
 		 453 aa  228  1e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4305  TrkH family potassium uptake protein  36.24 
 
 		 454 aa  228  2e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0672228  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001289  potassium uptake protein integral membrane component KtrB  35.31 
 
 		 454 aa  227  3e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0053  potassium uptake protein, TrkH family  36.01 
 
 		 454 aa  227  3e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0695  Na+-transporting ATP synthase  38.12 
 
 		 471 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000433945  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2640  H(+)-transporting two-sector ATPase  32.85 
 
 		 584 aa  226  6e-58  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4282  potassium uptake protein KtrB  36.77 
 
 		 454 aa  225  1e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0567  TrkH family potassium uptake protein  38.51 
 
 		 443 aa  225  1e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0065  Trk-type K+ transport systems, membrane component  35.16 
 
 		 467 aa  225  1e-57  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1927  H(+)-transporting two-sector ATPase  33.94 
 
 		 430 aa  225  1e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2065  H(+)-transporting two-sector ATPase  34.55 
 
 		 435 aa  224  2e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.403223  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2102  H(+)-transporting two-sector ATPase  34.55 
 
 		 435 aa  224  2e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0464809  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0086  TrkH family potassium uptake protein  37.31 
 
 		 457 aa  222  8e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000329525  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>