More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1994 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU2559  exopolyphosphatase, putative  62.48 
 
 
513 aa  644    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1994  Ppx/GppA phosphatase  100 
 
 
510 aa  1031    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000431495 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2570  Ppx/GppA phosphatase  63.91 
 
 
513 aa  672    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0880  Ppx/GppA phosphatase  65.03 
 
 
513 aa  659    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000414352 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2233  Ppx/GppA phosphatase  97.05 
 
 
511 aa  947    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0592  Ppx/GppA phosphatase  53.07 
 
 
519 aa  529  1e-149  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1965  exopolyphosphatase  38.51 
 
 
549 aa  311  1e-83  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.363541  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3712  Ppx/GppA phosphatase  36.03 
 
 
545 aa  297  4e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.42303 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3658  Ppx/GppA phosphatase  36.03 
 
 
545 aa  297  4e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1083  Ppx/GppA phosphatase  35.84 
 
 
570 aa  291  1e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.376324  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1160  Ppx/GppA phosphatase  33.46 
 
 
550 aa  278  2e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0231  Ppx/GppA phosphatase  35.26 
 
 
544 aa  268  1e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.448988 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1244  Ppx/GppA phosphatase  34.57 
 
 
534 aa  266  7e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.199997  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1198  Ppx/GppA phosphatase  32.68 
 
 
549 aa  262  1e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1993  Ppx/GppA phosphatase  33.01 
 
 
519 aa  256  9e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1573  Ppx/GppA phosphatase  34.12 
 
 
505 aa  256  1.0000000000000001e-66  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1739  guanosine-5'-triphosphate,3'-diphosphate diphosphatase  33.97 
 
 
532 aa  254  3e-66  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.22047  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0972  Ppx/GppA phosphatase  35.99 
 
 
520 aa  254  3e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2990  Ppx/GppA phosphatase  31.6 
 
 
519 aa  250  4e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1456  Ppx/GppA phosphatase  32.29 
 
 
553 aa  248  1e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.240113 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4141  Ppx/GppA phosphatase  34.4 
 
 
557 aa  247  4.9999999999999997e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0501  Ppx/GppA phosphatase  31.52 
 
 
519 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0278  Ppx/GppA phosphatase  31.73 
 
 
501 aa  243  7.999999999999999e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00854606  normal  0.782575 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05201  putative exopolyphosphatase  30.77 
 
 
531 aa  242  9e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0423  exopolyphosphatase, putative  32.38 
 
 
519 aa  242  1e-62  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0454  Ppx/GppA phosphatase  32.42 
 
 
521 aa  242  1e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.976943 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0457  putative exopolyphosphatase  30.81 
 
 
531 aa  241  2.9999999999999997e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.337159  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1197  Ppx/GppA phosphatase  33.27 
 
 
502 aa  238  2e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.639933 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0489  Ppx/GppA phosphatase  30.99 
 
 
527 aa  236  6e-61  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1684  exopolyphosphatase, putative  35.62 
 
 
514 aa  236  7e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3530  Ppx/GppA phosphatase  33.01 
 
 
550 aa  234  3e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.984084 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0623  exopolyphosphatase  33.01 
 
 
545 aa  234  3e-60  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.797716  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0498  Ppx/GppA phosphatase  33.27 
 
 
521 aa  233  5e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0574  Ppx/GppA phosphatase  33.33 
 
 
511 aa  233  5e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.289083  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1789  putative exopolyphosphatase  34.73 
 
 
544 aa  232  1e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.810374  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04581  putative exopolyphosphatase  32.77 
 
 
539 aa  232  1e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04821  putative exopolyphosphatase  30.62 
 
 
531 aa  231  2e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.467797  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05121  putative exopolyphosphatase  34.59 
 
 
544 aa  231  3e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.434231 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1243  Ppx/GppA phosphatase  34.41 
 
 
501 aa  230  4e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.085362 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05131  putative exopolyphosphatase  30.58 
 
 
531 aa  229  8e-59  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1955  Ppx/GppA phosphatase  33.59 
 
 
523 aa  227  4e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0958558 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1033  Ppx/GppA phosphatase  30.77 
 
 
505 aa  227  4e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.35316  normal  0.768311 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06591  putative exopolyphosphatase  33.07 
 
 
548 aa  227  5.0000000000000005e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4617  Ppx/GppA phosphatase  30.95 
 
 
502 aa  216  5.9999999999999996e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0819  Ppx/GppA phosphatase  30.26 
 
 
500 aa  213  4.9999999999999996e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1179  Ppx/GppA phosphatase  30.99 
 
 
507 aa  212  1e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2578  Ppx/GppA phosphatase  29.37 
 
 
506 aa  210  5e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1192  Ppx/GppA phosphatase  29.59 
 
 
500 aa  198  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3517  Ppx/GppA phosphatase  32.37 
 
 
508 aa  194  3e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.380715  normal  0.228242 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2105  Ppx/GppA phosphatase  31.26 
 
 
497 aa  192  9e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000081594  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1916  Ppx/GppA phosphatase family protein  26.56 
 
 
502 aa  189  1e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.050324  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1634  Ppx/GppA phosphatase family protein  26.56 
 
 
502 aa  188  2e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.505763  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1871  Ppx/GppA phosphatase  30.77 
 
 
497 aa  179  8e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.855928  normal  0.965208 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69220  exopolyphosphatase  29.98 
 
 
506 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1158  Ppx/GppA phosphatase  30.62 
 
 
503 aa  174  2.9999999999999996e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.776682  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1441  exopolyphosphatase  30.62 
 
 
503 aa  174  2.9999999999999996e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3323  Ppx/GppA phosphatase  28.63 
 
 
509 aa  168  2e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5125  Ppx/GppA phosphatase  28.79 
 
 
500 aa  167  4e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1861  Ppx/GppA phosphatase  28.18 
 
 
505 aa  167  4e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.925382 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5216  Ppx/GppA phosphatase  28.79 
 
 
500 aa  167  5e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00540  Exopolyphosphatase  36.67 
 
 
305 aa  167  5e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000336687  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5209  Ppx/GppA phosphatase  36.81 
 
 
310 aa  166  6.9999999999999995e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5986  exopolyphosphatase  29.75 
 
 
501 aa  166  9e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2394  exopolyphosphatase  29.11 
 
 
501 aa  166  1.0000000000000001e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0697  Ppx/GppA phosphatase  34.53 
 
 
301 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000153349  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0215  Ppx/GppA phosphatase  30.45 
 
 
509 aa  166  1.0000000000000001e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5277  Ppx/GppA phosphatase  28.57 
 
 
500 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.835084  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0157  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  28.42 
 
 
498 aa  165  2.0000000000000002e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.379833 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0301  Ppx/GppA phosphatase  29.21 
 
 
500 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5463  Ppx/GppA phosphatase  29.18 
 
 
500 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0273745 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0661  Ppx/GppA phosphatase  28.54 
 
 
489 aa  163  8.000000000000001e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0821  Ppx/GppA phosphatase  29.88 
 
 
508 aa  162  2e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47430  Exopolyphosphatase  29.05 
 
 
501 aa  161  2e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.160528  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1046  Ppx/GppA phosphatase  30.86 
 
 
491 aa  161  3e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.223703 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4014  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  27.64 
 
 
498 aa  160  4e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5249  exopolyphosphatase  28.6 
 
 
500 aa  160  6e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5039  Ppx/GppA phosphatase  29.69 
 
 
500 aa  160  6e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0154  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  27.37 
 
 
500 aa  160  7e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3542  exopolyphosphatase  27.41 
 
 
516 aa  160  7e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1343  exopolyphosphatase  27.08 
 
 
519 aa  159  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1226  exopolyphosphatase  27.08 
 
 
519 aa  159  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3112  exopolyphosphatase  27.08 
 
 
519 aa  158  2e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0702  Ppx/GppA phosphatase  35.12 
 
 
307 aa  158  2e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.176002  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4206  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  27.37 
 
 
498 aa  158  2e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0404  Ppx/GppA phosphatase  28.71 
 
 
505 aa  158  2e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0294  exopolyphosphatase  28.14 
 
 
526 aa  157  4e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0201  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  28.09 
 
 
498 aa  157  5.0000000000000005e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0581  Ppx/GppA phosphatase  30.14 
 
 
499 aa  157  6e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.298881  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03154  putative exopolyphosphatase  28.17 
 
 
520 aa  156  9e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2032  Ppx/GppA phosphatase  30.84 
 
 
505 aa  155  1e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.939596  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2991  exopolyphosphatase  27.12 
 
 
513 aa  155  2e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.498711 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2740  exopolyphosphatase  27.73 
 
 
526 aa  154  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.778881 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1892  Ppx/GppA phosphatase  24.48 
 
 
502 aa  154  4e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004382  exopolyphosphatase  28.26 
 
 
501 aa  154  4e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2762  exopolyphosphatase  27.73 
 
 
513 aa  153  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.708148  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02496  exopolyphosphatase  28.71 
 
 
506 aa  153  5.9999999999999996e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.285903  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2871  exopolyphosphatase  27.73 
 
 
526 aa  153  8e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2467  Guanosine-5'-triphosphate,3'-diphosphate diphosphatase  29.25 
 
 
500 aa  153  8e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2650  exopolyphosphatase  27.73 
 
 
526 aa  153  8e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2698  exopolyphosphatase  27.73 
 
 
526 aa  153  8e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>