More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2469 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_2469  undecaprenyl-diphosphatase  100 
 
 
339 aa  637    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0199195  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2797  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  54.23 
 
 
292 aa  289  4e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2660  undecaprenol kinase  50.15 
 
 
277 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.235772  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09180  Undecaprenyl-diphosphatase  45.1 
 
 
281 aa  253  3e-66  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.352379  normal  0.402204 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20010  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  47.2 
 
 
286 aa  250  2e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00122239 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1838  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.95 
 
 
292 aa  247  2e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.155916  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0789  Undecaprenyl-diphosphatase  44.38 
 
 
279 aa  244  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0413787  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2623  undecaprenyl-diphosphatase  44.94 
 
 
274 aa  242  7.999999999999999e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.151549  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16250  Undecaprenyl-diphosphatase  45.85 
 
 
290 aa  240  2.9999999999999997e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0295918  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1910  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  45.03 
 
 
277 aa  230  3e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000014335 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20990  Undecaprenyl-diphosphatase  47.17 
 
 
285 aa  226  3e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.475195 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1937  undecaprenol kinase  43.15 
 
 
272 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.07864  normal  0.489948 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2249  undecaprenol kinase  48.45 
 
 
290 aa  226  6e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.221802  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2133  undecaprenol kinase  43.45 
 
 
281 aa  225  7e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.141893  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1818  putative undecaprenol kinase  47.34 
 
 
281 aa  224  2e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.387789  normal  0.233202 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1194  undecaprenol kinase  43.67 
 
 
289 aa  223  4.9999999999999996e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0743133  normal  0.0386066 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4500  undecaprenol kinase  41.64 
 
 
386 aa  219  3.9999999999999997e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2011  undecaprenol kinase  47 
 
 
300 aa  218  1e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2167  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.17 
 
 
286 aa  218  1e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00790926  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2438  undecaprenol kinase  41.84 
 
 
280 aa  214  1.9999999999999998e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.153714  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2318  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.01 
 
 
278 aa  212  5.999999999999999e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00237783 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1692  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.9 
 
 
282 aa  209  5e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0482  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.69 
 
 
282 aa  207  2e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0712412  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11800  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.51 
 
 
277 aa  207  2e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.105146  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1869  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.1 
 
 
282 aa  205  7e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0119311 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3522  undecaprenol kinase  39.94 
 
 
274 aa  202  5e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.555118  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3158  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.77 
 
 
282 aa  202  5e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3170  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.77 
 
 
276 aa  202  5e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.822675  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3220  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.77 
 
 
276 aa  202  5e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.247054  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2164  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.13 
 
 
278 aa  202  6e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0646427  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2282  undecaprenol kinase  41.25 
 
 
273 aa  202  8e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000232331  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1735  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.28 
 
 
283 aa  201  9.999999999999999e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3043  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.37 
 
 
276 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1478  undecaprenol kinase  42.14 
 
 
290 aa  199  7e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.310776  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0444  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.42 
 
 
282 aa  196  5.000000000000001e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3483  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.07 
 
 
276 aa  194  1e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0662586  normal  0.599871 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2250  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.53 
 
 
282 aa  192  1e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.246331  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0446  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.9 
 
 
294 aa  187  2e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0953446  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0665  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.23 
 
 
282 aa  186  7e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.790774  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12166  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.39 
 
 
276 aa  183  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.490022 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0330  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.67 
 
 
266 aa  175  9.999999999999999e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2775  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.35 
 
 
280 aa  172  5e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000224739  hitchhiker  0.000207521 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0102  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  33.53 
 
 
278 aa  169  5e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2835  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  35.85 
 
 
265 aa  168  9e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4459  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  34.41 
 
 
278 aa  168  1e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.806671  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4342  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  34.85 
 
 
272 aa  167  2e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3596  undecaprenol kinase  36.34 
 
 
272 aa  167  2.9999999999999998e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.557046  normal  0.0100362 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0859  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  34.95 
 
 
265 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.136204  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4503  undecaprenol kinase  34.9 
 
 
278 aa  164  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.978161  decreased coverage  0.00384903 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0831  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  33.84 
 
 
266 aa  160  3e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000733877  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5676  undecaprenol kinase  34.89 
 
 
278 aa  159  4e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.229303  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0054  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  31.72 
 
 
267 aa  159  7e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.849769  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2826  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  33.75 
 
 
266 aa  159  7e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0258083  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3232  undecaprenol kinase  33.33 
 
 
322 aa  158  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.14463 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2864  undecaprenol kinase  33.33 
 
 
322 aa  158  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2690  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  31.4 
 
 
267 aa  157  2e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00940094  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4191  undecaprenol kinase  33.33 
 
 
320 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195911 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2988  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  34.06 
 
 
266 aa  156  4e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.22302  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001615  undecaprenyl-diphosphatase  31.33 
 
 
267 aa  155  7e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.754191  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0967  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  32.42 
 
 
266 aa  155  9e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000277611  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1004  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  32.63 
 
 
266 aa  155  9e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00218186  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00857  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  32.02 
 
 
267 aa  155  1e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0633  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  34.55 
 
 
320 aa  155  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.395478 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1196  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  32.42 
 
 
266 aa  153  4e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.38552  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3161  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  32.42 
 
 
266 aa  153  4e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.166065 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1152  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  32.42 
 
 
266 aa  153  4e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0107738  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1229  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  32.42 
 
 
266 aa  153  4e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.188967  normal  0.828376 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1967  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.02 
 
 
288 aa  153  5e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.39732  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1161  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  32.83 
 
 
266 aa  151  1e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000507346  normal  0.0186967 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1080  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  32.63 
 
 
266 aa  151  1e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.025115  normal  0.0318175 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03448  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  32.73 
 
 
266 aa  151  2e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1293  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  31.82 
 
 
266 aa  150  3e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3079  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  32.12 
 
 
266 aa  150  3e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000402787  hitchhiker  0.000110781 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2900  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  32.12 
 
 
266 aa  150  4e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000171872  hitchhiker  0.00310474 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1046  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  33.97 
 
 
266 aa  149  5e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.403088  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2982  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  32.12 
 
 
266 aa  149  5e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000265247  normal  0.0325105 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1112  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  31.21 
 
 
266 aa  149  9e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0511751  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1258  putative undecaprenol kinase  31.97 
 
 
266 aa  148  1.0000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.906554 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2232  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  32.39 
 
 
265 aa  147  3e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00497106  hitchhiker  0.0000196312 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0163  putative undecaprenol kinase  38.12 
 
 
304 aa  146  5e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.714151  normal  0.0225352 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3133  undecaprenyl-diphosphatase  35.26 
 
 
269 aa  145  9e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000445999  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3641  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  32.09 
 
 
265 aa  145  9e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0766  undecaprenyl-diphosphatase  37.69 
 
 
276 aa  145  1e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.935106  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0174  putative undecaprenol kinase  31.06 
 
 
267 aa  143  3e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02211  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  34.38 
 
 
293 aa  142  9e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1734  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  30 
 
 
264 aa  140  1.9999999999999998e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00685278  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1039  undecaprenol kinase  33.85 
 
 
279 aa  139  6e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4798  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  31.78 
 
 
312 aa  139  6e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0638126  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2332  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  34.69 
 
 
287 aa  139  7.999999999999999e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.684943  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0067  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  30.67 
 
 
264 aa  137  2e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3383  putative undecaprenol kinase  34.74 
 
 
290 aa  136  4e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0835  putative undecaprenol kinase  34.24 
 
 
261 aa  136  5e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1243  undecaprenyl-diphosphatase  36.11 
 
 
272 aa  135  8e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.373475  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0358  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  33.75 
 
 
283 aa  132  6e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1209  undecaprenol kinase  33.33 
 
 
290 aa  132  6.999999999999999e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0335  undecaprenol kinase  32.84 
 
 
291 aa  132  9e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.395953  normal  0.197846 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1834  Bacitracin resistance protein BacA  31.72 
 
 
265 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0725  putative undecaprenol kinase  32.62 
 
 
281 aa  132  1.0000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.60596  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1289  undecaprenyl-diphosphatase  30.37 
 
 
258 aa  131  2.0000000000000002e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3583  putative undecaprenol kinase  34.33 
 
 
273 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>