More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0102 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_0102  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  100 
 
 
278 aa  551  1e-156  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4459  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  81.29 
 
 
278 aa  459  9.999999999999999e-129  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.806671  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5676  undecaprenol kinase  71.94 
 
 
278 aa  393  1e-108  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.229303  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2775  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  54.68 
 
 
280 aa  299  3e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000224739  hitchhiker  0.000207521 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4503  undecaprenol kinase  53.96 
 
 
278 aa  281  7.000000000000001e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.978161  decreased coverage  0.00384903 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3860  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  48.38 
 
 
278 aa  244  9e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0340187  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0766  undecaprenyl-diphosphatase  47.65 
 
 
276 aa  238  1e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.935106  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2623  undecaprenyl-diphosphatase  45.49 
 
 
274 aa  236  2e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.151549  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3043  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.01 
 
 
276 aa  228  1e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3220  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.44 
 
 
276 aa  225  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.247054  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3158  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.44 
 
 
282 aa  226  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3170  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.44 
 
 
276 aa  225  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.822675  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2660  undecaprenol kinase  44.24 
 
 
277 aa  222  4.9999999999999996e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.235772  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2438  undecaprenol kinase  44.64 
 
 
280 aa  220  1.9999999999999999e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.153714  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1838  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.39 
 
 
292 aa  219  3e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.155916  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12166  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.86 
 
 
276 aa  219  5e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.490022 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1937  undecaprenol kinase  44.09 
 
 
272 aa  218  1e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.07864  normal  0.489948 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09180  Undecaprenyl-diphosphatase  40.64 
 
 
281 aa  215  8e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.352379  normal  0.402204 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0482  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.72 
 
 
282 aa  214  9.999999999999999e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0712412  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1910  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  45.52 
 
 
277 aa  213  2.9999999999999995e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000014335 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2133  undecaprenol kinase  44.01 
 
 
281 aa  211  7e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.141893  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1692  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.46 
 
 
282 aa  211  1e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2250  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.03 
 
 
282 aa  210  2e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.246331  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1818  putative undecaprenol kinase  46.92 
 
 
281 aa  210  2e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.387789  normal  0.233202 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2167  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  45.8 
 
 
286 aa  210  2e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00790926  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2282  undecaprenol kinase  44.96 
 
 
273 aa  209  4e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000232331  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3522  undecaprenol kinase  42.11 
 
 
274 aa  207  2e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.555118  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2797  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.01 
 
 
292 aa  206  3e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3483  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.94 
 
 
276 aa  206  4e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0662586  normal  0.599871 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1735  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.81 
 
 
283 aa  203  2e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20010  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.3 
 
 
286 aa  204  2e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00122239 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0789  Undecaprenyl-diphosphatase  40.73 
 
 
279 aa  202  4e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0413787  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11800  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.73 
 
 
277 aa  200  1.9999999999999998e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.105146  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2318  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.37 
 
 
278 aa  200  3e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00237783 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16250  Undecaprenyl-diphosphatase  40.22 
 
 
290 aa  197  1.0000000000000001e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0295918  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2164  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.31 
 
 
278 aa  196  5.000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0646427  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0665  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.93 
 
 
282 aa  195  8.000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.790774  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4500  undecaprenol kinase  37.32 
 
 
386 aa  194  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0444  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.82 
 
 
282 aa  193  2e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2249  undecaprenol kinase  41.38 
 
 
290 aa  192  7e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.221802  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4191  undecaprenol kinase  37.94 
 
 
320 aa  192  7e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195911 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2011  undecaprenol kinase  43.12 
 
 
300 aa  191  9e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1869  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.3 
 
 
282 aa  191  1e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0119311 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20990  Undecaprenyl-diphosphatase  42.54 
 
 
285 aa  191  2e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.475195 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0330  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.15 
 
 
266 aa  186  3e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0633  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.58 
 
 
320 aa  186  4e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.395478 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1967  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.63 
 
 
288 aa  181  2e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.39732  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3232  undecaprenol kinase  37.36 
 
 
322 aa  177  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.14463 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2864  undecaprenol kinase  37.36 
 
 
322 aa  177  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1194  undecaprenol kinase  38.68 
 
 
289 aa  177  2e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0743133  normal  0.0386066 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3596  undecaprenol kinase  39.35 
 
 
272 aa  174  9.999999999999999e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.557046  normal  0.0100362 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0358  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.13 
 
 
283 aa  174  1.9999999999999998e-42  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0725  putative undecaprenol kinase  40.94 
 
 
281 aa  172  6.999999999999999e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.60596  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1478  undecaprenol kinase  38.66 
 
 
290 aa  171  7.999999999999999e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.310776  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0446  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.52 
 
 
294 aa  170  2e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0953446  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0157  undecaprenyl-diphosphatase  39.23 
 
 
292 aa  169  4e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.214752  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0164  Undecaprenyl-diphosphatase  38.46 
 
 
292 aa  168  8e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4021  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.71 
 
 
276 aa  168  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.597407 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2175  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.13 
 
 
276 aa  167  2e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0169688 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0163  putative undecaprenol kinase  34.89 
 
 
304 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.714151  normal  0.0225352 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28720  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.32 
 
 
277 aa  166  2.9999999999999998e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4798  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.23 
 
 
312 aa  166  2.9999999999999998e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0638126  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3141  undecaprenol kinase, putative  39.62 
 
 
276 aa  166  5e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0312713  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3383  putative undecaprenol kinase  35.79 
 
 
290 aa  165  5.9999999999999996e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1864  undecaprenol kinase  36.36 
 
 
266 aa  166  5.9999999999999996e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.114213  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0835  putative undecaprenol kinase  37.26 
 
 
261 aa  165  9e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2332  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  35.51 
 
 
287 aa  164  1.0000000000000001e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.684943  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3008  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.25 
 
 
276 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112856  normal  0.65432 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0805  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.77 
 
 
276 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.838445  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0887  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.41 
 
 
276 aa  162  6e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.763797  normal  0.521518 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1051  undecaprenol kinase, putative  37.37 
 
 
274 aa  162  6e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.566548  normal  0.338834 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0438  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.41 
 
 
276 aa  162  6e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0621374  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0917  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.41 
 
 
276 aa  162  6e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.319747  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03448  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.06 
 
 
266 aa  162  7e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0858  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.4 
 
 
278 aa  161  9e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0794  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.13 
 
 
276 aa  161  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2474  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.63 
 
 
276 aa  160  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02211  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  35.61 
 
 
293 aa  160  2e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1243  undecaprenyl-diphosphatase  35.88 
 
 
272 aa  160  2e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.373475  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1803  undecaprenyl-diphosphatase  36.23 
 
 
274 aa  159  3e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2042  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.23 
 
 
274 aa  160  3e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.493495  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1046  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.31 
 
 
266 aa  160  3e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.403088  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3119  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.52 
 
 
278 aa  159  4e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.592205  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2756  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.47 
 
 
276 aa  159  4e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0605  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.86 
 
 
278 aa  159  4e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2919  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.49 
 
 
276 aa  159  5e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.151391  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1004  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  35.21 
 
 
266 aa  159  6e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00218186  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1080  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  35.71 
 
 
266 aa  159  6e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.025115  normal  0.0318175 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2705  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  35.14 
 
 
293 aa  158  8e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.965795 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2289  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.86 
 
 
274 aa  158  8e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00352871  normal  0.150685 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0335  undecaprenol kinase  35.97 
 
 
291 aa  158  1e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.395953  normal  0.197846 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3337  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.11 
 
 
277 aa  158  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.712485  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3826  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.66 
 
 
277 aa  157  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.98827 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0967  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  33.7 
 
 
266 aa  157  3e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000277611  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2469  undecaprenyl-diphosphatase  33.23 
 
 
339 aa  156  3e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0199195  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39190  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.11 
 
 
277 aa  156  3e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0708152  normal  0.2464 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2827  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.75 
 
 
276 aa  156  4e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2722  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  35.48 
 
 
259 aa  156  4e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3599  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.23 
 
 
274 aa  155  5.0000000000000005e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.59164  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3583  putative undecaprenol kinase  36.33 
 
 
273 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>