More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1208 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1208  FolC bifunctional protein  100 
 
 		 445 aa  889    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.482446 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1166  FolC bifunctional protein  41.48 
 
 		 452 aa  267  2.9999999999999995e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.343564  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12370  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  41.19 
 
 		 470 aa  255  1.0000000000000001e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.867028  normal  0.34816 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3470  FolC bifunctional protein  42.99 
 
 		 460 aa  252  7e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00143451  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09160  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  37.01 
 
 		 464 aa  233  5e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.2219 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0971  FolC bifunctional protein  39.95 
 
 		 463 aa  233  6e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.764071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5271  FolC bifunctional protein  42.58 
 
 		 468 aa  232  1e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.73776  normal  0.0925623 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1582  FolC bifunctional protein  39.87 
 
 		 447 aa  231  2e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1456  FolC bifunctional protein  41.15 
 
 		 461 aa  229  8e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.363059  normal  0.651546 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23910  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  38.68 
 
 		 466 aa  225  1e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.290984  normal  0.331564 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2190  folylpolyglutamate synthetase  42.13 
 
 		 443 aa  224  2e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.400499  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3391  FolC bifunctional protein  42.93 
 
 		 450 aa  224  2e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2151  FolC bifunctional protein  36.95 
 
 		 452 aa  220  3.9999999999999997e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000358705 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10060  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  42.63 
 
 		 517 aa  219  5e-56  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0614785  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3492  FolC bifunctional protein  40.32 
 
 		 444 aa  219  6e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.371874 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1149  FolC bifunctional protein  43.7 
 
 		 468 aa  218  2e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.498576  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3871  FolC bifunctional protein  40.5 
 
 		 444 aa  218  2e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000822129 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0467  FolC bifunctional protein  39.71 
 
 		 434 aa  218  2.9999999999999998e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000374021  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2764  FolC bifunctional protein  34.78 
 
 		 424 aa  217  2.9999999999999998e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1536  FolC bifunctional protein  36.88 
 
 		 471 aa  217  4e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00142339  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1671  FolC bifunctional protein  36.09 
 
 		 431 aa  217  4e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.239696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0880  FolC bifunctional protein  34.62 
 
 		 431 aa  216  7e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2472  FolC bifunctional protein  41.1 
 
 		 448 aa  216  7e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.829093 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1496  FolC bifunctional protein  42.97 
 
 		 515 aa  216  8e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.038753  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4548  folylpolyglutamate synthase  31.57 
 
 		 433 aa  216  9e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07720  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  36.97 
 
 		 427 aa  215  9.999999999999999e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.278263 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12473  folylpolyglutamate synthase protein folC  39.9 
 
 		 487 aa  215  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.669208 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2209  FolC bifunctional protein  33.74 
 
 		 429 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.791737  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4354  folylpolyglutamate synthase  31.33 
 
 		 433 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4190  folylpolyglutamate synthase  31.33 
 
 		 433 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4689  folylpolyglutamate synthase  31.33 
 
 		 433 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2054  FolC bifunctional protein  40.16 
 
 		 508 aa  213  7.999999999999999e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.832058  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2397  FolC bifunctional protein  37.34 
 
 		 452 aa  213  7.999999999999999e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0236925  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2780  FolC bifunctional protein  38.48 
 
 		 437 aa  213  7.999999999999999e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.38262  normal  0.709673 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3345  FolC bifunctional protein  35.38 
 
 		 429 aa  212  1e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.63219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0742  FolC bifunctional protein  41.19 
 
 		 445 aa  212  1e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0127305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0464  bifunctional protein FolC  35.25 
 
 		 485 aa  211  2e-53  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4201  folylpolyglutamate synthase  30.58 
 
 		 433 aa  211  2e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4544  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  31.08 
 
 		 433 aa  211  2e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2475  folylpolyglutamate synthetase  38.61 
 
 		 424 aa  211  2e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1159  FolC bifunctional protein  40.24 
 
 		 448 aa  211  2e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3497  FolC bifunctional protein  40.16 
 
 		 526 aa  211  2e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1648  hypothetical protein  34.55 
 
 		 416 aa  211  3e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4590  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  30.84 
 
 		 433 aa  211  3e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1384  FolC bifunctional protein  32.6 
 
 		 428 aa  209  5e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1447  FolC bifunctional protein  31.21 
 
 		 424 aa  209  8e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0659  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  30.6 
 
 		 433 aa  209  1e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4575  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  30.6 
 
 		 433 aa  209  1e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.095656  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3173  FolC bifunctional protein  30.83 
 
 		 433 aa  207  2e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4302  FolC bifunctional protein  30.84 
 
 		 433 aa  207  2e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3277  FolC bifunctional protein  37.98 
 
 		 424 aa  206  9e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7286  FolC bifunctional protein  38.3 
 
 		 440 aa  205  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0401599  normal  0.82683 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1542  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase (folylpolyglutamate synthetase)  31.7 
 
 		 429 aa  203  5e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0207441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0533  FolC bifunctional protein  34.54 
 
 		 440 aa  203  6e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.861672 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1456  FolC bifunctional protein  30.8 
 
 		 438 aa  202  8e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2552  FolC bifunctional protein  35.23 
 
 		 431 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0970266  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7289  FolC bifunctional protein  38.43 
 
 		 515 aa  202  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0218  folylpolyglutamate synthase  34.97 
 
 		 543 aa  202  9.999999999999999e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.296373  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1472  FolC bifunctional protein  43.29 
 
 		 425 aa  201  1.9999999999999998e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0335611  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2308  FolC bifunctional protein  38.5 
 
 		 442 aa  201  3e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.000000091683  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1996  FolC bifunctional protein  34.62 
 
 		 428 aa  200  5e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0734572  normal  0.0222652 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0510  FolC bifunctional protein  30.93 
 
 		 437 aa  199  6e-50  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1041  FolC bifunctional protein  31.01 
 
 		 451 aa  197  5.000000000000001e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0295  FolC bifunctional protein  38.6 
 
 		 426 aa  195  2e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2567  FolC bifunctional protein  39.53 
 
 		 477 aa  195  2e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0405628 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2572  FolC bifunctional protein  30.58 
 
 		 431 aa  194  3e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4541  FolC bifunctional protein  35.65 
 
 		 453 aa  194  3e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.195738  normal  0.774158 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1469  FolC bifunctional protein  36.53 
 
 		 471 aa  192  7e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0493364  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0602  dihydropteroate synthase  37.77 
 
 		 813 aa  192  1e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3348  FolC bifunctional protein  36.73 
 
 		 424 aa  191  2e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1166  FolC bifunctional protein  30.58 
 
 		 428 aa  191  2e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1391  folylpolyglutamate synthase  31.57 
 
 		 404 aa  190  5e-47  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4713  dihydropteroate synthase  35.06 
 
 		 810 aa  189  8e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.464706  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1490  FolC bifunctional protein  28.67 
 
 		 432 aa  188  1e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01530  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  33.33 
 
 		 466 aa  188  2e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0193239 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0782  FolC bifunctional protein  31.67 
 
 		 435 aa  187  3e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0897  FolC bifunctional protein  38.72 
 
 		 424 aa  187  3e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.54283e-31 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0759  FolC bifunctional protein  31.67 
 
 		 437 aa  187  4e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2174  FolC bifunctional protein  29.74 
 
 		 441 aa  185  2.0000000000000003e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1278  folylpolyglutamate synthase  31.41 
 
 		 427 aa  184  2.0000000000000003e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0758  FolC bifunctional protein  30.56 
 
 		 443 aa  184  3e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1110  FolC bifunctional protein  30.25 
 
 		 465 aa  183  4.0000000000000006e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.94602 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1885  FolC bifunctional protein  28.54 
 
 		 441 aa  183  6e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4360  FolC bifunctional protein  31.78 
 
 		 459 aa  182  8.000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0087  FolC bifunctional protein  35.2 
 
 		 454 aa  182  1e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0279686 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4359  FolC bifunctional protein  34.29 
 
 		 427 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.601802  normal  0.624925 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1510  FolC bifunctional protein  27.93 
 
 		 413 aa  181  2.9999999999999997e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0544  FolC bifunctional protein  34.57 
 
 		 425 aa  180  4e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09900  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  36.38 
 
 		 462 aa  180  4e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.175662  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0016  folylpolyglutamate synthetase  33.65 
 
 		 439 aa  180  4.999999999999999e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1568  FolC bifunctional protein  28.98 
 
 		 432 aa  180  5.999999999999999e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1830  FolC bifunctional protein  37.14 
 
 		 432 aa  178  2e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0684286  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1549  FolC bifunctional protein  31.33 
 
 		 422 aa  177  3e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3070  FolC bifunctional protein  30.61 
 
 		 428 aa  177  4e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3147  FolC bifunctional protein  35.45 
 
 		 817 aa  177  4e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0120997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0390  FolC bifunctional protein  33.89 
 
 		 422 aa  176  6e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000576883  normal  0.0116756 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14370  Folylpolyglutamate synthase  31.7 
 
 		 457 aa  176  6e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137038  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3284  dihydropteroate synthase  35.41 
 
 		 847 aa  176  7e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1051  FolC bifunctional protein  29.5 
 
 		 425 aa  176  7e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0119  FolC bifunctional protein  30.46 
 
 		 447 aa  176  9e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.205687 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>