38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2125 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2125  hypothetical protein  100 
 
 
318 aa  652    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21011  Galanin  35.44 
 
 
329 aa  176  5e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.647337 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2285  putative galanin  33.33 
 
 
321 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0636  hypothetical protein  31.6 
 
 
373 aa  114  2.0000000000000002e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1737  hypothetical protein  27.88 
 
 
346 aa  110  2.0000000000000002e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0635  hydrogenase expression/formation protein  30.86 
 
 
367 aa  105  1e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1703  hypothetical protein  27.3 
 
 
296 aa  99.8  5e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.314163  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3561  hypothetical protein  26.35 
 
 
338 aa  88.6  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1736  putative Galanin  27.33 
 
 
315 aa  84.7  0.000000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.432742  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1883  hypothetical protein  27.27 
 
 
523 aa  84  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0087  hypothetical protein  32.05 
 
 
337 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0091  hypothetical protein  32.05 
 
 
337 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0092  hypothetical protein  32.05 
 
 
337 aa  79.7  0.00000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0093  hypothetical protein  32.05 
 
 
337 aa  79.3  0.00000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0090  hypothetical protein  26.75 
 
 
337 aa  79.3  0.00000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0088  hypothetical protein  27.16 
 
 
337 aa  79  0.00000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4262  hypothetical protein  27.16 
 
 
337 aa  79  0.00000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0158  hypothetical protein  26.02 
 
 
336 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0138  hypothetical protein  28.22 
 
 
336 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1519  hypothetical protein  26.22 
 
 
338 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.323363  normal  0.955579 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3651  hypothetical protein  28.71 
 
 
336 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4055  hypothetical protein  26.22 
 
 
340 aa  69.7  0.00000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1927  hypothetical protein  25.81 
 
 
323 aa  68.9  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.815512  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0874  hypothetical protein  26.1 
 
 
324 aa  68.2  0.0000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.256496  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1735  hypothetical protein  22.99 
 
 
330 aa  68.2  0.0000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.6897  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2740  hypothetical protein  25.91 
 
 
337 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000125522  hitchhiker  0.000527325 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3556  hypothetical protein  31.53 
 
 
332 aa  65.1  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.56461  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2814  hypothetical protein  25.91 
 
 
360 aa  58.5  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1542  hypothetical protein  25.91 
 
 
364 aa  57  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1570  hypothetical protein  26.87 
 
 
364 aa  56.2  0.0000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.315068  normal  0.277616 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2556  hypothetical protein  26.94 
 
 
360 aa  54.3  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.209543  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4661  hypothetical protein  30.63 
 
 
345 aa  51.2  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4245  hypothetical protein  27.82 
 
 
345 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3924  hypothetical protein  31.51 
 
 
342 aa  47.4  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4040  hypothetical protein  29.36 
 
 
342 aa  47.4  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3831  hypothetical protein  31.51 
 
 
342 aa  47  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.634724 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4379  hypothetical protein  31.82 
 
 
345 aa  46.2  0.0007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4206  hypothetical protein  31.82 
 
 
345 aa  46.2  0.0007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>