15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_2598 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_2598  endodeoxyribonuclease RusA  100 
 
 
141 aa  290  3e-78  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000397063  decreased coverage  0.000000107809 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0662  endodeoxyribonuclease RusA  43.14 
 
 
144 aa  67  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0942  endodeoxyribonuclease RusA family protein  36.36 
 
 
128 aa  63.5  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2384  endodeoxyribonuclease RusA  35.96 
 
 
157 aa  57  0.00000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0419395  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2445  endodeoxyribonuclease RusA  37.08 
 
 
124 aa  54.3  0.0000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0308  endodeoxyribonuclease RusA  39.71 
 
 
112 aa  52.8  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1739  endodeoxyribonuclease RusA  35.94 
 
 
146 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000109309 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1833  endodeoxyribonuclease RusA  32.35 
 
 
156 aa  50.8  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00492976 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54080  endodeoxyribonuclease  52.5 
 
 
386 aa  47.8  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0504  endodeoxyribonuclease RusA  36.67 
 
 
114 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000274562  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2398  endodeoxyribonuclease RusA  33.33 
 
 
149 aa  47  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3008  endodeoxyribonuclease RusA  34.07 
 
 
135 aa  45.4  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3695  endodeoxyribonuclease RusA  36 
 
 
135 aa  42  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3364  endodeoxyribonuclease RusA  39.39 
 
 
132 aa  42  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0618192  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7130  endodeoxyribonuclease RusA  39.58 
 
 
180 aa  41.2  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0963838  hitchhiker  0.0000462878 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>