More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_4043 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012892  B21_03505  hypothetical protein  98.79 
 
 
497 aa  1035  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.973058  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5110  sulfatase  98.19 
 
 
497 aa  1026  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.36096 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4186  sulfatase  98.79 
 
 
497 aa  1033  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4043  sulfatase  100 
 
 
497 aa  1045  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0025  sulfatase  98.79 
 
 
497 aa  1035  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03562  predicted sulfatase/phosphatase  98.79 
 
 
497 aa  1035  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.678565  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3064  arylsulfatase A  30.43 
 
 
494 aa  173  5e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.886966  normal  0.178037 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1529  sulfatase  28.95 
 
 
499 aa  165  1e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.856317  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0177  sulfatase  29.42 
 
 
505 aa  164  3e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0888  sulfatase  27.08 
 
 
517 aa  162  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  1.91984e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2381  sulfatase family protein  27.98 
 
 
511 aa  160  6e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0569  sulfatase  28.42 
 
 
497 aa  156  8e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3492  sulfatase  27.96 
 
 
498 aa  155  2e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0151  sulfatase  27.08 
 
 
473 aa  155  2e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.110259  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1250  sulfatase  26.3 
 
 
489 aa  154  3e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.820666  normal  0.257041 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2286  sulfatase  27.35 
 
 
498 aa  153  6e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.220131 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3323  sulfatase  26.61 
 
 
502 aa  152  9e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2368  putative N-acetylglucosamine-6-sulfatase  27.51 
 
 
537 aa  152  1e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0651  sulfatase  32 
 
 
535 aa  152  1e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3133  sulfatase  27.17 
 
 
504 aa  151  2e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1506  sulfatase  30.3 
 
 
501 aa  149  1e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.265184 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2121  choline sulfatase  29.43 
 
 
522 aa  148  2e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0841  sulfatase family protein  29.43 
 
 
522 aa  148  2e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.767417  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1966  choline sulfatase  29.43 
 
 
522 aa  148  2e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0697  choline sulfatase  29.43 
 
 
522 aa  148  2e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.286425  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0484  choline sulfatase  29.43 
 
 
517 aa  148  2e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0993  choline sulfatase  29.43 
 
 
522 aa  148  2e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.37476  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0753  sulfatase family protein  29.43 
 
 
517 aa  149  2e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.1985  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1855  choline sulfatase  29.2 
 
 
517 aa  147  3e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.250441  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1716  sulfatase  28.07 
 
 
508 aa  148  3e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5764  sulfatase  28.6 
 
 
482 aa  147  5e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1494  sulfatase  27.69 
 
 
502 aa  146  7e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000530638  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2247  sulfatase  27.21 
 
 
501 aa  145  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.466267 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0911  choline-sulfatase  26.22 
 
 
509 aa  144  3e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  9.29958e-05  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3570  choline-sulfatase  29.25 
 
 
511 aa  144  3e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3441  sulfatase  26.65 
 
 
511 aa  144  4e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0813077  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0594  putative choline sulfatase  27 
 
 
501 aa  144  4e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6693  choline-sulfatase  26.27 
 
 
502 aa  143  9e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.17144  normal  0.223575 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0064  sulfatase  28.49 
 
 
502 aa  142  1e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1150  choline sulfatase  27.16 
 
 
496 aa  142  2e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0496  sulfatase  27.03 
 
 
501 aa  141  2e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.261478  normal  0.387641 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22600  choline-sulfatase  26.78 
 
 
520 aa  142  2e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.124418  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0587  sulfatase  28.16 
 
 
511 aa  141  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0126  sulfatase  28.98 
 
 
467 aa  140  4e-32  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3296  sulfatase  29.21 
 
 
516 aa  139  8e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.787928  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5072  sulfatase  29.21 
 
 
516 aa  139  8e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.263154  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5790  choline-sulfatase  25.93 
 
 
504 aa  139  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0271234 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1573  putative choline-sulfatase  26.92 
 
 
515 aa  139  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1708  sulfatase  28.29 
 
 
449 aa  139  2e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3655  sulfatase  26.2 
 
 
526 aa  137  3e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0999851 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5213  choline-sulfatase  28.99 
 
 
516 aa  137  6e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5075  choline-sulfatase  28.21 
 
 
512 aa  137  6e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287023  hitchhiker  0.0038506 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3290  choline-sulfatase  25.56 
 
 
513 aa  136  1e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0029  sulfatase  26.56 
 
 
501 aa  135  2e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1700  sulfatase  27.42 
 
 
479 aa  134  3e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0968821  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0093  choline-sulfatase  26.91 
 
 
505 aa  134  5e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  8.95462e-10 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0096  choline-sulfatase  27.94 
 
 
505 aa  134  6e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.574472  hitchhiker  9.26567e-05 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0093  sulfatase  26.57 
 
 
505 aa  132  1e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2763  sulfatase  27.39 
 
 
478 aa  132  1e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.449052  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0077  choline sulfatase  27.38 
 
 
505 aa  132  1e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.604146  hitchhiker  0.000459968 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5009  choline-sulfatase  29.18 
 
 
516 aa  132  1e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6149  choline-sulfatase  26.2 
 
 
503 aa  131  2e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.989807 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4484  sulfatase  28.51 
 
 
511 aa  132  2e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3206  sulfatase  28.89 
 
 
586 aa  131  2e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.338438  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0032  choline sulfatase  26.87 
 
 
503 aa  131  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.193076  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00380  choline sulfatase  27.57 
 
 
503 aa  131  4e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.103488 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2602  sulfatase  30.69 
 
 
452 aa  130  6e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0165  sulfatase family protein  26.33 
 
 
501 aa  129  9e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1802  sulfatase  27.27 
 
 
518 aa  129  1e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.389525 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2434  sulfatase  24.85 
 
 
564 aa  129  1e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05449  conserved hypothetical protein similar to choline sulphatase (Eurofung)  26.28 
 
 
594 aa  129  2e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0257615  normal  0.340962 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1701  sulfatase  30.26 
 
 
475 aa  128  2e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.987903  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6647  sulfatase  25.99 
 
 
476 aa  128  2e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.707956 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2250  sulfatase  29.42 
 
 
478 aa  128  2e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.739264 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0038  sulfatase  28.57 
 
 
497 aa  127  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2051  sulfatase  27.19 
 
 
474 aa  126  8e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0158429  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0026  sulfatase  27.21 
 
 
510 aa  126  9e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.407954  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0881  sulfatase  23.82 
 
 
510 aa  125  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.789189  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0764  sulfatase  24.95 
 
 
559 aa  126  1e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.726055  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2358  sulfatase family protein  26.64 
 
 
499 aa  125  2e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.303331  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0304  sulfatase  27.48 
 
 
497 aa  125  2e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.567268  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0357  sulfatase  25.91 
 
 
491 aa  125  2e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1568  sulfatase  28.82 
 
 
549 aa  124  4e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.423465  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28180  arylsulfatase A family protein  26.74 
 
 
480 aa  124  4e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4646  sulfatase  26.17 
 
 
461 aa  122  1e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3985  sulfatase  27.42 
 
 
478 aa  122  1e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.135566  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1005  sulfatase  28.77 
 
 
518 aa  122  1e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.549789  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0040  sulfatase  28.35 
 
 
497 aa  122  2e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.872346  normal  0.13967 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0039  sulfatase  28.35 
 
 
497 aa  122  2e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.225946 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0040  sulfatase  28.35 
 
 
497 aa  122  2e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.843312  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0038  sulfatase  28.35 
 
 
497 aa  122  2e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.292867  hitchhiker  0.00560398 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0795  sulfatase  27.55 
 
 
549 aa  122  2e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0245615  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0571  sulfatase  25.31 
 
 
517 aa  121  3e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3903  sulfatase  27.52 
 
 
486 aa  121  3e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1182  sulfatase  28.39 
 
 
465 aa  121  3e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3166  sulfatase  25.75 
 
 
482 aa  120  4e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0564  sulfatase  24.77 
 
 
512 aa  120  4e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.449143 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2600  sulfatase  27.22 
 
 
447 aa  118  2e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1574  sulfatase  26.69 
 
 
554 aa  118  3e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2055  sulfatase  28.22 
 
 
601 aa  117  3e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>