More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_0044 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00046  predicted electron transfer flavoprotein, NAD/FAD-binding domain and ETFP adenine nucleotide-binding domain-like protein  99.36 
 
 
313 aa  640  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3613  putative electron transfer flavoprotein FixB  99.36 
 
 
313 aa  640  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0679985 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00045  hypothetical protein  99.36 
 
 
313 aa  640  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0044  putative electron transfer flavoprotein FixB  100 
 
 
313 aa  644  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.676424  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0046  putative electron transfer flavoprotein FixB  98.72 
 
 
313 aa  637  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0048  putative electron transfer flavoprotein FixB  99.04 
 
 
313 aa  639  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0046  putative electron transfer flavoprotein FixB  98.72 
 
 
313 aa  637  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3557  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  99.36 
 
 
313 aa  640  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0086  putative electron transfer flavoprotein FixB  83.71 
 
 
313 aa  555  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.424213 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0082  putative electron transfer flavoprotein FixB  84.03 
 
 
313 aa  554  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0085  putative electron transfer flavoprotein FixB  84.35 
 
 
313 aa  556  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0082  putative electron transfer flavoprotein FixB  83.07 
 
 
313 aa  551  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0083  putative electron transfer flavoprotein FixB  83.39 
 
 
313 aa  551  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.656034  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3231  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  57.37 
 
 
314 aa  359  4e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.7218  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2678  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  55.45 
 
 
313 aa  346  3e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.873608 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4040  electron transfer flavoprotein alpha subunit  53.85 
 
 
313 aa  346  4e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01656  hypothetical protein  45.08 
 
 
312 aa  276  4e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01667  predicted electron transfer flavoprotein, FAD-binding  45.08 
 
 
312 aa  276  4e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1944  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  45.08 
 
 
312 aa  276  5e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.436869  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1497  electron transfer flavoprotein subunit YdiR  43.95 
 
 
312 aa  275  6e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.186284 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1915  electron transfer flavoprotein subunit YdiR  44.76 
 
 
312 aa  275  1e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1901  electron transfer flavoprotein subunit YdiR  44.76 
 
 
312 aa  273  2e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2415  electron transfer flavoprotein subunit YdiR  44.76 
 
 
312 aa  273  4e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1396  electron transfer flavoprotein subunit YdiR  43.57 
 
 
317 aa  272  5e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0992416  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1933  electron transfer flavoprotein subunit YdiR  44.76 
 
 
312 aa  272  7e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0148505 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1819  electron transfer flavoprotein subunit YdiR  42.17 
 
 
311 aa  271  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1449  electron transfer flavoprotein subunit YdiR  42.49 
 
 
311 aa  271  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364862  normal  0.334512 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1991  electron transfer flavoprotein subunit YdiR  42.17 
 
 
311 aa  269  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.237399  normal  0.0177014 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1465  electron transfer flavoprotein subunit YdiR  42.17 
 
 
311 aa  269  5e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.486189 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1483  electron transfer flavoprotein subunit YdiR  42.17 
 
 
311 aa  269  5e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.327265  normal  0.060964 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4605  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  42.49 
 
 
315 aa  256  3e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1020  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  41.23 
 
 
315 aa  246  3e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0573  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  42.81 
 
 
312 aa  237  2e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.18897  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0312  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  39.41 
 
 
297 aa  211  1e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00347621  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3929  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  37.03 
 
 
319 aa  196  4e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.326065 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1823  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  37.58 
 
 
293 aa  195  7e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.207117  normal  0.343811 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2872  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  37.01 
 
 
305 aa  193  3e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08780  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  35.9 
 
 
295 aa  181  1e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.821197 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1842  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  34.71 
 
 
296 aa  170  3e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.192292  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0915  electron transfer flavoprotein alpha subunit  39.83 
 
 
296 aa  169  4e-41  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0314059 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2007  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  36.27 
 
 
298 aa  169  8e-41  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.175857 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3105  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  40.94 
 
 
294 aa  168  1e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000291698 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0266  hypothetical protein  29.56 
 
 
319 aa  166  5e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3759  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  35.93 
 
 
321 aa  163  4e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0995938  hitchhiker  0.00147037 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0755  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  33.9 
 
 
300 aa  160  3e-38  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.714567 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2212  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  35.93 
 
 
299 aa  160  3e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.131964  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02680  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  35.37 
 
 
302 aa  159  6e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.867701 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0332  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  38.1 
 
 
287 aa  154  2e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.791227  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0576  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  36.89 
 
 
287 aa  153  4e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.248124  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0107  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  33.22 
 
 
329 aa  147  3e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.281869 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0712  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  35.17 
 
 
320 aa  143  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.940601 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09240  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  37.41 
 
 
297 aa  144  3e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.263835 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1360  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  36.75 
 
 
321 aa  142  1e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.223995 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2121  electron transfer flavoprotein alpha subunit  29.71 
 
 
311 aa  140  3e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0463  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  37.12 
 
 
332 aa  138  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3078  electron transfer flavoprotein  37.39 
 
 
311 aa  137  3e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2056  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  35.02 
 
 
323 aa  136  4e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0300917 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0065  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  38.36 
 
 
320 aa  136  5e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.777154  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2262  electron transfer flavoprotein subunit alpha  35.86 
 
 
301 aa  135  7e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0143745  hitchhiker  5.46266e-07 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3700  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  36.96 
 
 
327 aa  135  1e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0768904  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0439  electron transfer flavoprotein alpha subunit  43.61 
 
 
302 aa  134  2e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2298  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  31.68 
 
 
328 aa  134  2e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.8751  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2265  electron transfer flavoprotein subunit alpha  36.8 
 
 
322 aa  133  5e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0896895  hitchhiker  1.42262e-05 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2861  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  35.22 
 
 
329 aa  132  5e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001582  electron transfer flavoprotein alpha subunit  32.61 
 
 
321 aa  132  6e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0053  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  37.9 
 
 
320 aa  132  9e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1590  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  36.36 
 
 
327 aa  132  9e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0970  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  36.02 
 
 
316 aa  131  1e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2775  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  31.41 
 
 
428 aa  131  1e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00380307  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05549  acyl-CoA dehydrogenase, short-chain specific  37.78 
 
 
321 aa  130  3e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13044  electron transfer flavoprotein alpha subunit fixB  37.5 
 
 
318 aa  130  4e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00188433  hitchhiker  0.00116016 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2551  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  37.78 
 
 
308 aa  129  5e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.147723  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2829  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  41.18 
 
 
305 aa  129  7e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2314  electron transfer flavoprotein beta-subunit  29.91 
 
 
371 aa  129  7e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.261239  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2557  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  36.6 
 
 
308 aa  128  1e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3332  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  36.24 
 
 
317 aa  128  1e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1269  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  34.22 
 
 
316 aa  128  1e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.877633 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1751  electron transfer flavoprotein alpha subunit  38.17 
 
 
311 aa  128  1e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0899131 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3825  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  35.81 
 
 
317 aa  128  1e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.194441  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1699  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  30.22 
 
 
326 aa  128  1e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.440081  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3647  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  36.03 
 
 
329 aa  127  2e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1078  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  31.72 
 
 
335 aa  127  2e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.224584 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1690  electron transfer flavoprotein subunit alpha  36.84 
 
 
308 aa  127  2e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2199  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  34.89 
 
 
347 aa  127  3e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0323  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  36.84 
 
 
308 aa  127  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.501158  normal  0.94208 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13283  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  32.31 
 
 
321 aa  127  3e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.873366  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1602  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  40.35 
 
 
304 aa  127  3e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.679429  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2088  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  30.67 
 
 
316 aa  127  3e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3569  putative electron transfer flavoprotein, alpha subunit  38.89 
 
 
311 aa  126  4e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0141  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  48.06 
 
 
369 aa  126  4e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1419  electron transfer flavoprotein alpha subunit  46.34 
 
 
320 aa  126  4e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00843459  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10530  electron transfer flavoprotein, alpha subunit, FixB  41.42 
 
 
360 aa  126  4e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.291846  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3167  electron transfer flavoprotein alpha subunit  30.84 
 
 
328 aa  126  5e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.144656  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1075  electron transfer flavoprotein alpha subunit  35.68 
 
 
320 aa  126  5e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1470  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  40.83 
 
 
302 aa  126  5e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2520  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  40.57 
 
 
304 aa  126  5e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2464  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  33.23 
 
 
316 aa  125  9e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.61274e-06 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2783  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  40.46 
 
 
302 aa  125  9e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4534  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  35.92 
 
 
328 aa  125  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0891717  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0605  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  30.74 
 
 
325 aa  125  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>