More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0970 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_0970  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  100 
 
 
316 aa  610  9.999999999999999e-175  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3332  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  41.46 
 
 
317 aa  233  2.0000000000000002e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3825  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  41.14 
 
 
317 aa  231  1e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.194441  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1269  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  41.88 
 
 
316 aa  227  2e-58  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.877633 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1388  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  38.29 
 
 
317 aa  214  1.9999999999999998e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3700  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  38.58 
 
 
327 aa  209  7e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0768904  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2715  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  38.32 
 
 
439 aa  199  5e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777462 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4534  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  38.46 
 
 
328 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0891717  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1501  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  36.61 
 
 
442 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3167  electron transfer flavoprotein alpha subunit  40.85 
 
 
328 aa  197  3e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.144656  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0386  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  42.28 
 
 
315 aa  197  3e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1358  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  37.73 
 
 
452 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2927  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  37.69 
 
 
452 aa  196  6e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2298  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  40.55 
 
 
328 aa  194  2e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.8751  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1699  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  37.27 
 
 
326 aa  193  2e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.440081  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1857  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  42.33 
 
 
330 aa  194  2e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.519797  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2415  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  38.27 
 
 
441 aa  192  7e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1879  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  33.44 
 
 
410 aa  190  2e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.281207  normal  0.354147 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0571  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  36.14 
 
 
443 aa  191  2e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.871139  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1779  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  36.73 
 
 
325 aa  189  4e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1078  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  34.89 
 
 
335 aa  189  5e-47  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.224584 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2257  electron transfer flavoprotein subunit alpha  36.96 
 
 
442 aa  187  2e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00336089  hitchhiker  0.0000000000804212 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2582  3-hydroxybutyryl-CoA dehydrogenase  34.56 
 
 
335 aa  187  2e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2284  3-hydroxybutyryl-CoA dehydrogenase  34.56 
 
 
335 aa  187  2e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.383741  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0059  electron transfer flavoprotein alpha and beta-subunits  38.58 
 
 
341 aa  183  3e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00122913 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2066  electron transfer flavoprotein subunit alpha  34.89 
 
 
448 aa  181  1e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2786  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  35.2 
 
 
447 aa  181  1e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2132  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  35.42 
 
 
436 aa  181  1e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000989021 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3615  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  35.8 
 
 
368 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0544664 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1354  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  35.31 
 
 
334 aa  179  5.999999999999999e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00167442  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1212  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  34.78 
 
 
441 aa  178  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.72306  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1590  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  37.07 
 
 
327 aa  177  2e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5956  electron transfer flavoprotein alpha subunit  38.92 
 
 
316 aa  177  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.149032 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1554  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  36.96 
 
 
364 aa  177  3e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.243155  normal  0.702054 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1467  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  34.58 
 
 
447 aa  176  4e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0141  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  36.23 
 
 
369 aa  176  6e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1195  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  34.95 
 
 
364 aa  175  9e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.028424 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1479  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  34.95 
 
 
364 aa  175  9e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1836  electron transfer flavoprotein alpha subunit  39.44 
 
 
325 aa  175  9e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0730508  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2775  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  35.42 
 
 
428 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00380307  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2796  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  34.88 
 
 
340 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2861  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  36.11 
 
 
329 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10530  electron transfer flavoprotein, alpha subunit, FixB  36.2 
 
 
360 aa  174  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.291846  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2625  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  36.2 
 
 
325 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000950552  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2086  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  35.21 
 
 
436 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1544  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  32.3 
 
 
339 aa  172  5e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0131  electron transfer flavoprotein alpha subunit  33.33 
 
 
333 aa  172  5.999999999999999e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0684  electron transfer flavoprotein subunit alpha  34.98 
 
 
443 aa  172  6.999999999999999e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0329544  normal  0.845757 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7738  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  34.78 
 
 
374 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0342501  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0488  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  36.42 
 
 
370 aa  171  1e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0831  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  35.29 
 
 
325 aa  171  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1435  electron transfer flavoprotein fixB (alpha subunit)  34.37 
 
 
367 aa  171  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000130268  normal  0.0153048 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0697  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  36.48 
 
 
317 aa  171  2e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1607  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  31.15 
 
 
399 aa  171  2e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3647  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  34.67 
 
 
329 aa  170  3e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0583  electron transfer flavoprotein alpha subunit  34.57 
 
 
341 aa  170  3e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6229  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  34.15 
 
 
370 aa  170  3e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0411  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  36.76 
 
 
325 aa  170  3e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0107  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  34.89 
 
 
329 aa  169  5e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.281869 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2266  electron transfer flavoprotein  34.15 
 
 
365 aa  168  9e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1369  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  31.58 
 
 
374 aa  168  1e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1075  electron transfer flavoprotein alpha subunit  37.54 
 
 
320 aa  167  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3576  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  36.14 
 
 
369 aa  167  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.846794  normal  0.141898 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1419  electron transfer flavoprotein alpha subunit  40.26 
 
 
320 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00843459  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5871  protein FixB  33.73 
 
 
368 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0138766  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0049  electron transfer flavoprotein alpha and beta subunits  37.42 
 
 
321 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0921  electron transfer flavoprotein alpha subunit  34.7 
 
 
323 aa  164  3e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.541285 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4014  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  35.58 
 
 
663 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.797538  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4447  electron transfer flavoprotein beta-subunit  34.34 
 
 
369 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3658  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  38.12 
 
 
320 aa  162  7e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1089  electron transfer flavoprotein beta-subunit  33.94 
 
 
368 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.419334  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0065  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  36.91 
 
 
320 aa  162  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.777154  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2949  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  38.02 
 
 
303 aa  161  1e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28250  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  40.56 
 
 
319 aa  161  2e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1373  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  32.4 
 
 
399 aa  160  2e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.255821  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2262  electron transfer flavoprotein subunit alpha  35.26 
 
 
301 aa  160  3e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0143745  hitchhiker  0.000000546266 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0368  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  33.23 
 
 
338 aa  160  4e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0985  electron transfer flavoprotein subunit beta  33.33 
 
 
367 aa  159  5e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.104458 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0053  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  36.19 
 
 
320 aa  159  5e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5085  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  33.64 
 
 
368 aa  159  7e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3597  electron transfer flavoprotein alpha subunit  35.45 
 
 
342 aa  158  9e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13044  electron transfer flavoprotein alpha subunit fixB  35.6 
 
 
318 aa  158  1e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00188433  hitchhiker  0.00116016 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2916  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  35.53 
 
 
318 aa  157  2e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.113103  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1484  electron transfer flavoprotein alpha subunit  30.41 
 
 
397 aa  157  2e-37  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.11518  normal  0.562863 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1334  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  36.33 
 
 
303 aa  157  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0720  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  36.56 
 
 
316 aa  157  3e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0900083  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5047  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  33.54 
 
 
375 aa  157  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.303357  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0309  electron transfer flavoprotein, alpha subunit/FixB family protein  31.78 
 
 
397 aa  156  4e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0304  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  32.09 
 
 
397 aa  155  7e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2314  electron transfer flavoprotein beta-subunit  31.48 
 
 
371 aa  155  7e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.261239  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0476  electron transfer flavoprotein alpha subunit  33.33 
 
 
350 aa  154  1e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000000313809  decreased coverage  0.000297308 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1602  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  32.48 
 
 
304 aa  154  1e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.679429  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1539  electron transfer flavoprotein beta-subunit  33.33 
 
 
439 aa  154  1e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.345257  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0050  electron transfer flavoprotein alpha and beta subunits  35.13 
 
 
320 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.69565 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8113  electron transfer flavoprotein alpha subunit  34.81 
 
 
317 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.733777 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0957  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  35.15 
 
 
342 aa  154  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0915  electron transfer flavoprotein alpha subunit  41.31 
 
 
296 aa  154  2e-36  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0314059 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3165  electron transfer flavoprotein alpha subunit  35.96 
 
 
317 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4649  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  33.44 
 
 
325 aa  153  4e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4650  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  33.44 
 
 
325 aa  153  4e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>