60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_04240 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_3634  conserved hypothetical protein  100 
 
 		 157 aa  214  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000501605  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4903  hypothetical protein  100 
 
 		 157 aa  214  2.9999999999999998e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000105362  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4908  hypothetical protein  100 
 
 		 155 aa  214  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000000105331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3692  hypothetical protein  100 
 
 		 157 aa  214  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000191847  hitchhiker  0.00156887 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4956  hypothetical protein  100 
 
 		 157 aa  214  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000176607  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04240  conserved inner membrane protein  100 
 
 		 108 aa  214  5e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000281641  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04206  hypothetical protein  100 
 
 		 108 aa  214  5e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000212595  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5876  hypothetical protein  99.07 
 
 		 157 aa  211  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000857143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4595  hypothetical protein  99.07 
 
 		 157 aa  211  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.2901e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4959  hypothetical protein  89.81 
 
 		 157 aa  201  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.375809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4866  hypothetical protein  89.81 
 
 		 157 aa  201  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4799  hypothetical protein  89.81 
 
 		 157 aa  201  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.221212  normal  0.570717 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4953  hypothetical protein  89.81 
 
 		 157 aa  201  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4900  hypothetical protein  89.81 
 
 		 157 aa  201  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.816628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0521  hypothetical protein  89.81 
 
 		 157 aa  198  1.9999999999999998e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00650808 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0719  hypothetical protein  75 
 
 		 156 aa  169  7.999999999999999e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.334296 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0558  hypothetical protein  74.77 
 
 		 156 aa  166  1e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.73355  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3579  hypothetical protein  74.07 
 
 		 156 aa  164  5e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3837  hypothetical protein  76.47 
 
 		 156 aa  164  5e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3450  hypothetical protein  74.07 
 
 		 156 aa  164  5e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0598  hypothetical protein  75.49 
 
 		 156 aa  162  2.0000000000000002e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.762355  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0779  hypothetical protein  73.33 
 
 		 157 aa  152  2e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.393956  normal  0.136083 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3642  hypothetical protein  76.19 
 
 		 156 aa  150  7e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00804  hypothetical protein  57.01 
 
 		 161 aa  131  3.9999999999999996e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001669  hypothetical protein  56.07 
 
 		 157 aa  130  7.999999999999999e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.811357  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2857  hypothetical protein  53.33 
 
 		 161 aa  124  4.0000000000000003e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00177194  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0365  membrane protein  49.04 
 
 		 163 aa  109  1.0000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0190  hypothetical protein  49.48 
 
 		 159 aa  102  2e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3690  hypothetical protein  41.12 
 
 		 153 aa  85.9  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.460322  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3647  hypothetical protein  42.45 
 
 		 157 aa  84.3  4e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3121  hypothetical protein  42.45 
 
 		 157 aa  84  6e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3215  hypothetical protein  42.45 
 
 		 157 aa  84  6e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.488511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0899  hypothetical protein  42.45 
 
 		 157 aa  84  6e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0908411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0873  hypothetical protein  42.45 
 
 		 156 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0929072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0856  hypothetical protein  41.35 
 
 		 157 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0789379  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1291  hypothetical protein  42.99 
 
 		 154 aa  81.6  0.000000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.762277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2825  hypothetical protein  41.51 
 
 		 155 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.538821 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0958  hypothetical protein  41.51 
 
 		 155 aa  80.5  0.000000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0983  hypothetical protein  40.57 
 
 		 157 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.348363  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3085  hypothetical protein  40 
 
 		 156 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1008  hypothetical protein  40.57 
 
 		 156 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000353059 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1073  hypothetical protein  39.62 
 
 		 157 aa  79  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0136401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3319  hypothetical protein  39.62 
 
 		 157 aa  79  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.999931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1040  hypothetical protein  39.62 
 
 		 157 aa  79  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0218174  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2003  hypothetical protein  41.58 
 
 		 150 aa  78.6  0.00000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0477013 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2923  hypothetical protein  39.62 
 
 		 155 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000118164  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0971  hypothetical protein  39.62 
 
 		 157 aa  79  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.295057  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0800  hypothetical protein  41.51 
 
 		 154 aa  77.8  0.00000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1965  ThrE family exporter, small subunit  36.79 
 
 		 150 aa  75.5  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1692  ThrE family exporter small subunit  35.92 
 
 		 150 aa  72.4  0.000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1180  hypothetical protein  30.53 
 
 		 164 aa  50.8  0.000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2926  hypothetical protein  34.62 
 
 		 159 aa  50.8  0.000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.67774  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1299  hypothetical protein  30.53 
 
 		 164 aa  50.4  0.000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1086  hypothetical protein  28.42 
 
 		 174 aa  49.7  0.00001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.829899  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1963  hypothetical protein  26 
 
 		 167 aa  48.5  0.00003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0436579  hitchhiker  0.000913146 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2892  hypothetical protein  28.43 
 
 		 161 aa  47.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.078452  normal  0.0867852 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1825  hypothetical protein  25.23 
 
 		 168 aa  46.6  0.0001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2543  hypothetical protein  32.35 
 
 		 159 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1064  protein of unknown function DUF1212  27.42 
 
 		 478 aa  41.6  0.004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.103063  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0379  hypothetical protein  27.68 
 
 		 177 aa  40.4  0.008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>