87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1084 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_1084  hypothetical protein  100 
 
 
579 aa  1152    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.880417 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0009  protein of unknown function DUF814  41.87 
 
 
660 aa  375  1e-103  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.111959 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2344  hypothetical protein  40.42 
 
 
515 aa  347  3e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000192452  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0294  protein of unknown function DUF814  39.3 
 
 
577 aa  341  2e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.254135  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1735  protein of unknown function DUF814  32.23 
 
 
518 aa  215  1.9999999999999998e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.676814 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0239  protein of unknown function DUF814  35.57 
 
 
498 aa  144  6e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2332  Fibronectin-binding A domain protein  22.64 
 
 
595 aa  76.6  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0124404 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1812  Fibronectin-binding A domain protein  26.63 
 
 
568 aa  72.4  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3600  fibronectin-binding A domain-containing protein  32.31 
 
 
583 aa  70.5  0.00000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.110241 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0581  fibronectin-binding A-like protein  32.73 
 
 
588 aa  70.5  0.00000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09780  Fibronectin-binding A domain protein  23.64 
 
 
585 aa  70.5  0.00000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1871  Fibronectin-binding A domain protein  33.33 
 
 
584 aa  69.3  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0246704  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4287  fibronectin-binding A domain-containing protein  29.56 
 
 
583 aa  65.1  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0863996 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0618  fibronectin-binding A domain-containing protein  37.14 
 
 
578 aa  63.2  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1691  fibronectin-binding A domain-containing protein  26.62 
 
 
592 aa  63.5  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1964  Fibronectin-binding A domain protein  33.96 
 
 
592 aa  62.8  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4126  Fibronectin-binding A domain protein  25.77 
 
 
573 aa  62  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1823  Fibronectin-binding A domain protein  27.34 
 
 
585 aa  62  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3634  fibronectin-binding protein  23.92 
 
 
569 aa  60.8  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4013  fibronectin/fibrinogen-binding protein  23.92 
 
 
569 aa  60.8  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3889  putative fibronectin-binding protein  23.92 
 
 
569 aa  60.8  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000127726 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3616  fibronectin-binding protein  23.92 
 
 
569 aa  60.5  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3726  fibronectin/fibrinogen-binding protein  23.92 
 
 
569 aa  60.8  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3919  fibronectin/fibrinogen-binding protein, putative  23.92 
 
 
569 aa  60.1  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3923  putative fibronectin-binding protein  23.92 
 
 
569 aa  59.7  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3974  putative fibronectin-binding protein  24.04 
 
 
569 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.27289  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1767  fibronectin-binding A domain-containing protein  34.02 
 
 
570 aa  58.9  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0286424  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1275  RNA-binding protein-like protein  25.99 
 
 
601 aa  58.9  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1314  Fibronectin-binding A domain protein  34.23 
 
 
594 aa  58.5  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1269  putative fibronectin-binding protein  23.56 
 
 
569 aa  58.9  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1639  Fibronectin-binding A domain protein  24.64 
 
 
573 aa  58.5  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0598  fibronectin/fibrinogen-binding protein  26.89 
 
 
440 aa  58.5  0.0000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.167837  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1325  Fibronectin-binding A domain protein  24.48 
 
 
579 aa  58.2  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1943  Fibronectin-binding A domain protein  24.68 
 
 
579 aa  58.2  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0886  hypothetical protein  28.84 
 
 
584 aa  57.8  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2197  Hsp12 variant C  28.93 
 
 
440 aa  57.8  0.0000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1053  Fibronectin-binding A domain protein  24.75 
 
 
570 aa  57.4  0.0000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000411066  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0555  fibronectin-binding A domain-containing protein  30.77 
 
 
549 aa  57.4  0.0000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00535298  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2252  protein of unknown function DUF814  25.88 
 
 
441 aa  57.4  0.0000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.557488  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0490  fibronectin-binding A domain-containing protein  33.65 
 
 
561 aa  56.2  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1454  RNA-binding protein  27.95 
 
 
566 aa  56.2  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000048196  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2527  fibronectin-binding A domain-containing protein  23.56 
 
 
569 aa  55.8  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2801  RNA-binding protein  30.19 
 
 
520 aa  56.2  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0364556  normal  0.260678 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0942  hypothetical protein  25.36 
 
 
541 aa  56.2  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2041  Fibronectin-binding A domain protein  21.13 
 
 
532 aa  55.5  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.662273  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0171  hypothetical protein  32.21 
 
 
496 aa  55.1  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0303739  normal  0.463043 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2377  Fibronectin-binding A domain protein  25.89 
 
 
513 aa  55.5  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1579  fibronectin/fibrinogen-binding protein, internal deletion  25.35 
 
 
471 aa  55.1  0.000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00739832  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0569  fibronectin-binding A domain-containing protein  29.13 
 
 
549 aa  55.1  0.000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45207  predicted protein  29.55 
 
 
448 aa  54.3  0.000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.1729  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1815  adherence and virulence protein A  23.74 
 
 
575 aa  53.9  0.000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4565  Fibronectin-binding A domain-containing protein  25.33 
 
 
575 aa  53.9  0.000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.871344  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2635  protein of unknown function DUF814  30.54 
 
 
557 aa  53.1  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2101  fibronectin-binding protein  25.23 
 
 
575 aa  52.4  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1625  protein of unknown function DUF814  25.47 
 
 
548 aa  52.8  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0725  fibronectin-binding protein, putative  25.45 
 
 
547 aa  52.8  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.657746  normal  0.950358 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1207  Fibronectin-binding A domain protein  21.55 
 
 
520 aa  52.4  0.00002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0162  hypothetical protein  36 
 
 
496 aa  52  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.562717  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1423  fibronectin-binding A-like protein  28.86 
 
 
517 aa  51.2  0.00005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.151074 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28821  predicted protein  31.15 
 
 
253 aa  51.2  0.00006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0827  protein of unknown function DUF814  22.05 
 
 
546 aa  51.2  0.00006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3303  hypothetical protein  25.1 
 
 
579 aa  51.2  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.1343  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0170  protein of unknown function DUF814  35.2 
 
 
494 aa  50.4  0.00008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0361  putative fibronectin/fibrinogen binding protein  25.12 
 
 
435 aa  50.1  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3698  fibronectin-binding A domain-containing protein  21.74 
 
 
569 aa  50.1  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1538  conserved hypothetical protein (DUF814 domain protein), putative fibronectin/fibrinogen binding protein  45 
 
 
434 aa  50.1  0.0001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0279  protein of unknown function DUF814  30.19 
 
 
557 aa  49.3  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1575  hypothetical protein  32.22 
 
 
797 aa  48.9  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.842074  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1538  fibronectin/fibrinogen binding protein, putative  25.25 
 
 
435 aa  49.7  0.0002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2016  protein of unknown function DUF814  27.88 
 
 
533 aa  49.7  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0963  Fibronectin-binding A domain protein  18.78 
 
 
582 aa  48.5  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000189089  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2902  fibronectin-binding A domain-containing protein  23.61 
 
 
594 aa  48.1  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000222554  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1348  fibronectin/fibrinogen binding protein, putative  24.63 
 
 
435 aa  47.4  0.0008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0194  putative fibronectin/fibrinogen-binding protein  26.45 
 
 
437 aa  46.6  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0181  Fibronectin-binding A domain protein  37.25 
 
 
514 aa  46.6  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1297  fibronectin-binding A domain-containing protein  25.74 
 
 
586 aa  46.6  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0123  hypothetical protein  32.39 
 
 
441 aa  46.6  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.417424  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0695  protein of unknown function DUF814  31.58 
 
 
508 aa  45.8  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000721327  unclonable  0.00000000020456 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0538  hypothetical protein  31.58 
 
 
508 aa  45.8  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.24326  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1391  hypothetical protein  29.89 
 
 
663 aa  45.8  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0603621  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1848  fibronectin-binding A domain-containing protein  19.69 
 
 
534 aa  45.4  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0932  fibronectin-binding A domain-containing protein  28.71 
 
 
560 aa  45.1  0.004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1450  fibronectin-binding protein  26.17 
 
 
540 aa  45.1  0.004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1011  fibronectin-binding protein  27.71 
 
 
563 aa  45.1  0.004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000321701  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1892  protein of unknown function DUF814  24.78 
 
 
546 aa  43.9  0.008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.256138  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1324  Fibronectin-binding A domain protein  27.1 
 
 
576 aa  43.5  0.01  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0826  protein of unknown function DUF814  23.56 
 
 
538 aa  43.5  0.01  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.810258  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>