29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2667 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_2667  hypothetical protein  100 
 
 
323 aa  642    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.141568 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2272  hypothetical protein  72.19 
 
 
319 aa  423  1e-117  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2939  hypothetical protein  59.63 
 
 
319 aa  384  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0036  nucleoside recognition domain protein  62.26 
 
 
329 aa  344  8.999999999999999e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2421  hypothetical protein  49.52 
 
 
316 aa  288  8e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2642  hypothetical protein  38.67 
 
 
457 aa  179  7e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2309  hypothetical protein  40.91 
 
 
362 aa  172  5e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.145713 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3102  hypothetical protein  38.31 
 
 
378 aa  167  2e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1500  nucleoside recognition domain-containing protein  33.55 
 
 
318 aa  140  3e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.879771  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1132  nucleoside recognition domain-containing protein  32.88 
 
 
319 aa  130  3e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.765619  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0416  putative transporter  28.03 
 
 
310 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0477  hypothetical protein  27.69 
 
 
397 aa  104  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0106  nucleoside recognition domain-containing protein  24.21 
 
 
323 aa  92.4  9e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.153  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0605  nucleoside recognition domain-containing protein  23.21 
 
 
317 aa  88.2  2e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0772602  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1779  nucleoside recognition domain-containing protein  23.21 
 
 
317 aa  88.2  2e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.344331  hitchhiker  0.000321752 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0884  nucleoside recognition domain-containing protein  23.59 
 
 
317 aa  81.3  0.00000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0818  nucleoside recognition domain-containing protein  23.61 
 
 
314 aa  81.3  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.307616  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1099  nucleoside recognition domain-containing protein  23.19 
 
 
314 aa  79.3  0.00000000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.379741  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0005  nucleoside recognition domain-containing protein  22.64 
 
 
331 aa  77  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.540211  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1285  nucleoside recognition  19.79 
 
 
314 aa  72.4  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.242231  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3528  hypothetical protein  21.36 
 
 
312 aa  69.3  0.00000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.976665  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2938  hypothetical protein  66.67 
 
 
81 aa  68.9  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0410  nucleoside recognition domain-containing protein  22.38 
 
 
312 aa  66.6  0.0000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2936  hypothetical protein  68.09 
 
 
90 aa  64.3  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2937  hypothetical protein  65.91 
 
 
62 aa  62.8  0.000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1669  nucleoside recognition domain protein  28.15 
 
 
327 aa  61.6  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0151875  normal  0.642767 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0368  nucleoside recognition domain-containing protein  29.37 
 
 
302 aa  60.8  0.00000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0980587  normal  0.268222 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0236  nucleoside recognition domain-containing protein  29.86 
 
 
302 aa  58.5  0.0000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0234  nucleoside recognition domain-containing protein  26.6 
 
 
298 aa  52.8  0.000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.918857 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>