20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0838 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_0838  hypothetical protein  100 
 
 
250 aa  511  1e-144  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.14986 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0582  hypothetical protein  30 
 
 
275 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3371  hypothetical protein  30 
 
 
275 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3542  hypothetical protein  34.01 
 
 
266 aa  125  5e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0736  hypothetical protein  31.44 
 
 
264 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0684  hypothetical protein  30.21 
 
 
271 aa  112  6e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0694  hypothetical protein  30.21 
 
 
271 aa  112  6e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0663  hypothetical protein  29.69 
 
 
266 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3568  hypothetical protein  31.79 
 
 
248 aa  94.7  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.550402  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3148  hypothetical protein  26.51 
 
 
253 aa  70.9  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0494985  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1295  hypothetical protein  27.78 
 
 
239 aa  68.9  0.00000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.634955  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0388  hypothetical protein  25.91 
 
 
274 aa  60.8  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.333934 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1907  hypothetical protein  26.21 
 
 
247 aa  54.7  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.392589  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0809  hypothetical protein  19.2 
 
 
237 aa  53.9  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2944  hypothetical protein  24.75 
 
 
246 aa  54.7  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2780  hypothetical protein  27.32 
 
 
302 aa  52  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00291479  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0053  hypothetical protein  23.7 
 
 
249 aa  50.4  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2231  hypothetical protein  21.36 
 
 
274 aa  46.6  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1135  extracellular solute-binding protein  23.13 
 
 
268 aa  43.9  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0567537  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2636  hypothetical protein  27.19 
 
 
246 aa  42  0.01  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>