More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0047 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_2531  argininosuccinate synthase  78.7 
 
 
400 aa  662  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00599814  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1900  argininosuccinate synthase  85.71 
 
 
396 aa  719  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.99384 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0047  argininosuccinate synthase  100 
 
 
401 aa  833  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1729  argininosuccinate synthase  73.01 
 
 
407 aa  614  1e-175  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.57009  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0247  argininosuccinate synthase  71.47 
 
 
403 aa  584  1e-166  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1095  argininosuccinate synthase  69.95 
 
 
401 aa  579  1e-164  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.142038  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0495  argininosuccinate synthase  63.28 
 
 
405 aa  512  1e-144  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.337809  normal  0.895355 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2417  argininosuccinate synthase  61.4 
 
 
406 aa  510  1e-143  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.20961  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3751  argininosuccinate synthase  60.61 
 
 
419 aa  509  1e-143  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3745  argininosuccinate synthase  61.73 
 
 
406 aa  510  1e-143  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0324  argininosuccinate synthase  61.68 
 
 
403 aa  510  1e-143  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1533  argininosuccinate synthase  61.31 
 
 
410 aa  509  1e-143  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.535542  normal  0.279557 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2293  argininosuccinate synthase  61.48 
 
 
413 aa  509  1e-143  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.052711 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0061  argininosuccinate synthase  61.18 
 
 
401 aa  508  1e-143  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.372491 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2568  argininosuccinate synthase  61.48 
 
 
413 aa  509  1e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0384503 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2491  argininosuccinate synthase  61.98 
 
 
399 aa  511  1e-143  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2250  argininosuccinate synthase  61.23 
 
 
413 aa  505  1e-142  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.137068  normal  0.557536 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3638  argininosuccinate synthase  61.48 
 
 
406 aa  506  1e-142  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0609  argininosuccinate synthase  62.03 
 
 
412 aa  507  1e-142  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3472  argininosuccinate synthase  63.18 
 
 
406 aa  506  1e-142  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1273  argininosuccinate synthase  61.14 
 
 
426 aa  505  1e-142  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0227151 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7386  argininosuccinate synthase  61.14 
 
 
413 aa  501  1e-141  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0914  argininosuccinate synthase  60.2 
 
 
402 aa  503  1e-141  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  2.89862e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1382  argininosuccinate synthase  60.95 
 
 
416 aa  503  1e-141  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.924271 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3623  argininosuccinate synthase  60.34 
 
 
409 aa  502  1e-141  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.724533  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2698  argininosuccinate synthase  61.62 
 
 
397 aa  502  1e-141  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.823792  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3742  argininosuccinate synthase  59.6 
 
 
407 aa  499  1e-140  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  9.83467e-05 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2361  argininosuccinate synthase  60.61 
 
 
397 aa  499  1e-140  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0152126  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0725  argininosuccinate synthase  62.56 
 
 
403 aa  500  1e-140  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.304208  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2803  argininosuccinate synthase  60.59 
 
 
409 aa  499  1e-140  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.953161  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1195  argininosuccinate synthase  64.34 
 
 
404 aa  499  1e-140  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_19853  predicted protein  62.21 
 
 
402 aa  500  1e-140  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0228  argininosuccinate synthase  60.2 
 
 
406 aa  499  1e-140  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6641  argininosuccinate synthase  60.4 
 
 
413 aa  495  1e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.453364  normal  0.0120904 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2452  Argininosuccinate synthase  59.95 
 
 
404 aa  496  1e-139  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.341026  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3331  argininosuccinate synthase  58.35 
 
 
409 aa  496  1e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3718  argininosuccinate synthase  60.15 
 
 
407 aa  492  1e-138  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.248104  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2231  argininosuccinate synthase  60.2 
 
 
404 aa  494  1e-138  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1377  argininosuccinate synthase  62.18 
 
 
410 aa  492  1e-138  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1659  argininosuccinate synthase  58.29 
 
 
411 aa  493  1e-138  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00409616  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0067  argininosuccinate synthase  61.29 
 
 
407 aa  492  1e-138  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3344  argininosuccinate synthase  61.25 
 
 
419 aa  491  1e-138  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2970  argininosuccinate synthase  61.95 
 
 
405 aa  491  1e-138  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0698642 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2916  argininosuccinate synthase  60.35 
 
 
410 aa  488  1e-137  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2873  argininosuccinate synthase  60.5 
 
 
408 aa  489  1e-137  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4161  argininosuccinate synthase  59.35 
 
 
409 aa  488  1e-137  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0397228  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2588  argininosuccinate synthase  58.65 
 
 
403 aa  488  1e-137  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4763  argininosuccinate synthase  59.16 
 
 
407 aa  489  1e-137  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.235186 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1043  argininosuccinate synthase  60.31 
 
 
407 aa  489  1e-137  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0153  argininosuccinate synthase  58.44 
 
 
406 aa  488  1e-137  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1753  argininosuccinate synthase  60.76 
 
 
410 aa  488  1e-137  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.233709  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2067  argininosuccinate synthase  59.69 
 
 
414 aa  491  1e-137  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.369104 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0206  argininosuccinate synthase  58.67 
 
 
406 aa  489  1e-137  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  4.61564e-05 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2650  argininosuccinate synthase  60.75 
 
 
408 aa  489  1e-137  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0103879  normal  0.341748 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2013  argininosuccinate synthase  59.36 
 
 
409 aa  490  1e-137  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0978065  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4040  argininosuccinate synthase  59.9 
 
 
407 aa  489  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1212  argininosuccinate synthase  60.5 
 
 
408 aa  489  1e-137  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0680  argininosuccinate synthase  60.45 
 
 
408 aa  487  1e-136  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0688  argininosuccinate synthase  59.2 
 
 
408 aa  485  1e-136  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1849  argininosuccinate synthase  61.11 
 
 
409 aa  486  1e-136  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.544372 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1631  argininosuccinate synthase  57.25 
 
 
412 aa  484  1e-136  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0894235  hitchhiker  0.00967015 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2108  argininosuccinate synthase  60.05 
 
 
405 aa  487  1e-136  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0355  argininosuccinate synthase  58.77 
 
 
407 aa  486  1e-136  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.752574  normal  0.580202 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4517  argininosuccinate synthase  58.25 
 
 
405 aa  485  1e-136  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00862615 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1099  argininosuccinate synthase  59.54 
 
 
408 aa  488  1e-136  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2537  argininosuccinate synthase  59.15 
 
 
403 aa  485  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.994167  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0601  argininosuccinate synthase  60.05 
 
 
402 aa  483  1e-135  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  1.97496e-10 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0795  argininosuccinate synthase  56.93 
 
 
401 aa  482  1e-135  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3171  argininosuccinate synthase  58.97 
 
 
408 aa  484  1e-135  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.416548  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18740  argininosuccinate synthase  58.44 
 
 
405 aa  483  1e-135  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00166387  normal  0.0969777 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0499  argininosuccinate synthase  59.8 
 
 
408 aa  484  1e-135  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0086  argininosuccinate synthase  58.96 
 
 
412 aa  482  1e-135  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.509496  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0073  argininosuccinate synthase  58.96 
 
 
406 aa  482  1e-135  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1394  argininosuccinate synthase  58 
 
 
405 aa  482  1e-135  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.664295 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4324  argininosuccinate synthase  58.94 
 
 
405 aa  481  1e-135  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3148  argininosuccinate synthase  58.59 
 
 
405 aa  483  1e-135  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2423  argininosuccinate synthase  57.96 
 
 
409 aa  481  1e-135  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.106011  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1468  argininosuccinate synthase  60.25 
 
 
410 aa  482  1e-135  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0853487  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0084  argininosuccinate synthase  59.55 
 
 
409 aa  481  1e-135  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0882429  normal  0.0155281 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2127  argininosuccinate synthase  58.78 
 
 
406 aa  483  1e-135  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.263511  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0074  argininosuccinate synthase  58.96 
 
 
406 aa  483  1e-135  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.874295  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1708  argininosuccinate synthase  58.88 
 
 
406 aa  482  1e-135  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0472214  hitchhiker  0.00281031 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3063  argininosuccinate synthase  59.15 
 
 
405 aa  479  1e-134  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711058  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3206  argininosuccinate synthase  60 
 
 
408 aa  478  1e-134  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1129  argininosuccinate synthase  58.44 
 
 
405 aa  478  1e-134  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.504857  normal  0.904376 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1622  argininosuccinate synthase  58.19 
 
 
405 aa  481  1e-134  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00134855  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0747  argininosuccinate synthase  59.39 
 
 
409 aa  479  1e-134  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.289107  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0756  argininosuccinate synthase  60 
 
 
408 aa  481  1e-134  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.589205  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1864  argininosuccinate synthase  56.75 
 
 
412 aa  480  1e-134  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0468314  normal  0.0853528 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1373  argininosuccinate synthase  58.12 
 
 
404 aa  479  1e-134  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0310982  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0571  argininosuccinate synthase  57.33 
 
 
401 aa  479  1e-134  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3031  argininosuccinate synthase  59.85 
 
 
468 aa  481  1e-134  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.526147  normal  0.562744 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1088  argininosuccinate synthase  58.44 
 
 
405 aa  478  1e-134  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14080  argininosuccinate synthase  58.42 
 
 
406 aa  475  1e-133  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00581538  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2883  argininosuccinate synthase  59.41 
 
 
407 aa  477  1e-133  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0277  argininosuccinate synthase  58.69 
 
 
401 aa  478  1e-133  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2674  argininosuccinate synthase  60.1 
 
 
409 aa  478  1e-133  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1117  argininosuccinate synthase  58.44 
 
 
405 aa  477  1e-133  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1828  argininosuccinate synthase  57.51 
 
 
399 aa  472  1e-132  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0390  argininosuccinate synthase  56.6 
 
 
397 aa  472  1e-132  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0852004 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>