More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_1418 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_1418  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  100 
 
 
361 aa  718    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0333314  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0644  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  50.73 
 
 
340 aa  315  9e-85  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00119245  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0310  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  45.91 
 
 
346 aa  295  1e-78  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1844  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  45.19 
 
 
348 aa  290  2e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0176696  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2808  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  44.11 
 
 
352 aa  291  2e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.247614  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22110  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  46.73 
 
 
350 aa  288  9e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2402  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  44.54 
 
 
348 aa  287  2e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.507579  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1817  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  44.84 
 
 
348 aa  285  5.999999999999999e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00980836 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1440  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  41.18 
 
 
363 aa  285  1.0000000000000001e-75  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0673  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  46.47 
 
 
333 aa  283  3.0000000000000004e-75  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1064  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  41.42 
 
 
345 aa  283  4.0000000000000003e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2106  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  44.38 
 
 
349 aa  281  2e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000519432  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1856  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  41.3 
 
 
349 aa  280  3e-74  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.154474 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002781  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  41.96 
 
 
346 aa  279  5e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2992  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  41.72 
 
 
345 aa  279  5e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.84534  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1182  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  42.27 
 
 
358 aa  279  5e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.66248  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2153  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  45.13 
 
 
348 aa  279  5e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000138623  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1624  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  41.19 
 
 
349 aa  279  6e-74  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.133695 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1046  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  39.82 
 
 
347 aa  278  7e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3187  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  41.12 
 
 
345 aa  278  9e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1129  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  41.12 
 
 
345 aa  278  9e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0373  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  43.03 
 
 
345 aa  278  1e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2046  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  43.6 
 
 
350 aa  278  1e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.200017 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1665  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  40.91 
 
 
352 aa  277  2e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.294401  normal  0.678153 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4053  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  40.91 
 
 
352 aa  277  2e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2112  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  40.41 
 
 
358 aa  278  2e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1263  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  40.91 
 
 
352 aa  277  2e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.045095 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03200  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  41.67 
 
 
346 aa  276  3e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3524  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  42.64 
 
 
359 aa  276  5e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00772577  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0205  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  42.34 
 
 
346 aa  275  6e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.201771 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1758  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  43.23 
 
 
348 aa  275  7e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.27324  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1223  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  40.91 
 
 
352 aa  275  7e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0174491  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1293  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  44.51 
 
 
350 aa  275  8e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.14528e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1777  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  44.9 
 
 
345 aa  275  1.0000000000000001e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000154728  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1247  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  41.64 
 
 
346 aa  275  1.0000000000000001e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0130533 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1819  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  42.27 
 
 
346 aa  274  2.0000000000000002e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0732  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  42.26 
 
 
354 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000206442  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0265  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  42.47 
 
 
363 aa  274  2.0000000000000002e-72  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02148  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  40.35 
 
 
346 aa  274  2.0000000000000002e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1928  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  42.47 
 
 
352 aa  274  2.0000000000000002e-72  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2390  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  40.36 
 
 
346 aa  273  3e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0523  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  46.18 
 
 
336 aa  273  3e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2996  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  40.99 
 
 
352 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.55909  hitchhiker  0.000666575 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0261  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  43.6 
 
 
346 aa  272  5.000000000000001e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0293  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  43.95 
 
 
346 aa  273  5.000000000000001e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1631  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  41.19 
 
 
347 aa  272  5.000000000000001e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0725  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  40.92 
 
 
362 aa  272  6e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0588894  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2183  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  42.82 
 
 
340 aa  271  9e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0710  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  41.47 
 
 
359 aa  271  1e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2489  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  42.9 
 
 
345 aa  271  1e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.742519  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0701  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  41.47 
 
 
359 aa  271  1e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0732  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  43.02 
 
 
346 aa  271  1e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.773105 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1633  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  41.25 
 
 
352 aa  270  2e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.117601 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3120  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  40.29 
 
 
347 aa  271  2e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0894  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  41.96 
 
 
369 aa  270  2e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000980143 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1772  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  42.56 
 
 
350 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000204477  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2545  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  42.56 
 
 
341 aa  270  2.9999999999999997e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1351  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  40.29 
 
 
347 aa  270  2.9999999999999997e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1234  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  40.29 
 
 
347 aa  270  2.9999999999999997e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.701579  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1513  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  39.65 
 
 
345 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000222973  normal  0.483677 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0665  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  43.41 
 
 
342 aa  269  5e-71  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2094  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  39.52 
 
 
345 aa  269  5e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000188129  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52040  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  41.84 
 
 
353 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00555218 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2576  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  41.76 
 
 
363 aa  268  8.999999999999999e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01760  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  39.77 
 
 
351 aa  268  1e-70  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1573  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  42.47 
 
 
359 aa  268  1e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00140561 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1897  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  42.47 
 
 
345 aa  268  1e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_78660  predicted protein  42.69 
 
 
795 aa  268  2e-70  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0555555 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3278  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  42.17 
 
 
348 aa  267  2e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.487138  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2316  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  40.62 
 
 
353 aa  267  2e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.631588 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2695  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  42.12 
 
 
350 aa  266  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36890  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  40.18 
 
 
351 aa  266  2.9999999999999995e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2647  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  42.12 
 
 
350 aa  266  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.42877  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0675  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  45.59 
 
 
333 aa  266  2.9999999999999995e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2868  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  42.12 
 
 
345 aa  266  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2988  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  41.82 
 
 
345 aa  266  4e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.263587 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2737  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  42.12 
 
 
345 aa  266  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4564  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  41.76 
 
 
410 aa  266  4e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2759  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  42.12 
 
 
345 aa  266  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.168086  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3689  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  39.83 
 
 
352 aa  266  5e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0683899  decreased coverage  0.000265107 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2617  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  42.04 
 
 
379 aa  266  5e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1170  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  42.73 
 
 
345 aa  266  5.999999999999999e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2782  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  42.73 
 
 
345 aa  266  5.999999999999999e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.171997  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2317  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  40.83 
 
 
351 aa  265  7e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1476  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  42.73 
 
 
339 aa  265  7e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2195  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  40.83 
 
 
351 aa  265  7e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.401729  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3300  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  40.83 
 
 
351 aa  265  7e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.863837  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0511  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  40.83 
 
 
351 aa  265  7e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.799332  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1088  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  40.83 
 
 
351 aa  265  7e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02391  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  42.73 
 
 
345 aa  265  8e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0803604  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02353  hypothetical protein  42.73 
 
 
345 aa  265  8e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0952896  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2873  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  42.73 
 
 
345 aa  265  8e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.636308  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2634  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  42.73 
 
 
345 aa  265  8e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.302094  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1177  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  42.73 
 
 
345 aa  265  8e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0570522 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2647  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  42.73 
 
 
345 aa  265  8e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3311  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  40.83 
 
 
351 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3722  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  43.03 
 
 
345 aa  265  1e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.108743  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1317  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  40.83 
 
 
351 aa  265  1e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.124371  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0051  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  43.28 
 
 
333 aa  265  1e-69  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2858  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  42.56 
 
 
351 aa  264  2e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.693195  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>