42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1944 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1944  putative methyltransferase  100 
 
 		 243 aa  498  1e-140  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.197915  hitchhiker  0.0000642802 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0148  hypothetical protein  41.44 
 
 		 222 aa  141  9e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.434014 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0205  hypothetical protein  39.78 
 
 		 222 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.314754 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0289  hypothetical protein  39.44 
 
 		 239 aa  132  5e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.159555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0250  hypothetical protein  43.4 
 
 		 97 aa  57.4  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0188439  normal  0.0226545 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1486  hypothetical protein  41.38 
 
 		 477 aa  55.8  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0673077 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0368  hypothetical protein  28.76 
 
 		 216 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.810453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0347  hypothetical protein  28.76 
 
 		 216 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.834243 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0358  hypothetical protein  28.76 
 
 		 216 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2745  hypothetical protein  29.63 
 
 		 378 aa  53.9  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2733  glycosyltransferase-like protein  26.06 
 
 		 329 aa  50.1  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3506  hypothetical protein  23.88 
 
 		 209 aa  50.1  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.906839 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2587  hypothetical protein  27.74 
 
 		 204 aa  50.4  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1635  hypothetical protein  25.16 
 
 		 219 aa  49.7  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0150544  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1613  hypothetical protein  25.16 
 
 		 219 aa  49.7  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.800747  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1764  hypothetical protein  25.16 
 
 		 219 aa  49.7  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1814  hypothetical protein  25.16 
 
 		 219 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1585  hypothetical protein  25.16 
 
 		 219 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.189915  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1839  hypothetical protein  23.78 
 
 		 219 aa  48.9  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1893  hypothetical protein  24.03 
 
 		 219 aa  48.9  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00821908  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2490  hypothetical protein  25.68 
 
 		 204 aa  48.1  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.144778  normal  0.0598589 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2408  glycosyl transferase family 2  26.71 
 
 		 1334 aa  47.4  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3358  hypothetical protein  30.19 
 
 		 261 aa  47.4  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8251  hypothetical protein  26.47 
 
 		 210 aa  47.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0194223 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2215  O-methyltransferase family 3  23.38 
 
 		 231 aa  46.6  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0387  hypothetical protein  25.5 
 
 		 212 aa  46.6  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0835  hypothetical protein  24.28 
 
 		 223 aa  47  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0732  hypothetical protein  29.85 
 
 		 290 aa  46.6  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.872425  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1634  hypothetical protein  21.74 
 
 		 219 aa  45.8  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.257483  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3565  hypothetical protein  21.74 
 
 		 219 aa  45.8  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.876515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3869  hypothetical protein  26.67 
 
 		 233 aa  45.4  0.0007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2577  macrocin-O-methyltransferase domain-containing protein  28.19 
 
 		 268 aa  45.8  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000150088  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1779  hypothetical protein  21.74 
 
 		 219 aa  45.4  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2999  glycosyl transferase family 2  24.65 
 
 		 988 aa  45.4  0.0009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1218  hypothetical protein  26.42 
 
 		 518 aa  44.3  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0013  hypothetical protein  25.45 
 
 		 190 aa  44.3  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1971  glycosyl transferase family 2  21.95 
 
 		 1084 aa  43.5  0.003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1203  putative methyltransferase  27.75 
 
 		 266 aa  42.7  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.139767  normal  0.896147 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0113  hypothetical protein  25.4 
 
 		 260 aa  42.4  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.119878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1845  cephalosporin hydroxylase  40 
 
 		 584 aa  42  0.008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2009  hypothetical protein  23.53 
 
 		 200 aa  42  0.009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.567228  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2876  hypothetical protein  25 
 
 		 210 aa  42  0.009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>