50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0045 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0045  hypothetical protein  100 
 
 		 124 aa  248  2e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000429273 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1781  UspA domain-containing protein  33.03 
 
 		 285 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0839  hypothetical protein  29.82 
 
 		 120 aa  63.9  0.0000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360004 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0759  hypothetical protein  29.82 
 
 		 120 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1323  hypothetical protein  30.7 
 
 		 120 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.804067  normal  0.155599 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1011  hypothetical protein  29.82 
 
 		 120 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.116392  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3480  UspA domain protein  32.32 
 
 		 119 aa  59.7  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0372  hypothetical protein  31.93 
 
 		 122 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0110151 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2958  hypothetical protein  33.62 
 
 		 122 aa  57  0.00000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.702882  normal  0.292777 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2854  hypothetical protein  35.29 
 
 		 127 aa  54.7  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.148058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3056  hypothetical protein  33.93 
 
 		 113 aa  52.4  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.3077  normal  0.011343 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3682  hypothetical protein  35.96 
 
 		 132 aa  52  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3102  hypothetical protein  36.08 
 
 		 125 aa  51.2  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.593174 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2519  hypothetical protein  25.93 
 
 		 120 aa  51.2  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.063986  normal  0.852215 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2981  hypothetical protein  31.07 
 
 		 127 aa  49.7  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3336  hypothetical protein  35.14 
 
 		 184 aa  49.7  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.185768  normal  0.354376 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1029  hypothetical protein  30.28 
 
 		 127 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.674916 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0576  hypothetical protein  29.91 
 
 		 126 aa  48.9  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3250  hypothetical protein  33.03 
 
 		 132 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1041  hypothetical protein  30.28 
 
 		 127 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.756046 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2220  hypothetical protein  27.62 
 
 		 124 aa  49.3  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00202987  normal  0.0726864 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3149  hypothetical protein  32.04 
 
 		 132 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3715  hypothetical protein  28.04 
 
 		 125 aa  48.5  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2511  hypothetical protein  26.72 
 
 		 120 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0873  hypothetical protein  32.11 
 
 		 132 aa  48.1  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1487  hypothetical protein  30.36 
 
 		 114 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3331  hypothetical protein  30.1 
 
 		 127 aa  47.4  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1509  hypothetical protein  30.36 
 
 		 114 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.322803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1008  hypothetical protein  30.1 
 
 		 127 aa  47.4  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2063  hypothetical protein  27.1 
 
 		 121 aa  47.4  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1485  hypothetical protein  29.57 
 
 		 121 aa  47  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1767  hypothetical protein  26.72 
 
 		 120 aa  47  0.00008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.144768  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1774  hypothetical protein  25.86 
 
 		 120 aa  47  0.00009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3356  hypothetical protein  27.45 
 
 		 126 aa  47  0.00009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.630899  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1811  hypothetical protein  25.86 
 
 		 120 aa  47  0.00009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.937461 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1638  hypothetical protein  25.42 
 
 		 127 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0416797 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5736  hypothetical protein  30.28 
 
 		 130 aa  46.2  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.853657  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1336  hypothetical protein  25.47 
 
 		 130 aa  46.6  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2331  hypothetical protein  25 
 
 		 125 aa  46.6  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0160  hypothetical protein  23.36 
 
 		 120 aa  45.8  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1240  hypothetical protein  29.2 
 
 		 125 aa  45.8  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.370362  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2602  hypothetical protein  27.1 
 
 		 127 aa  45.1  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0738008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1563  hypothetical protein  25.42 
 
 		 127 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1109  hypothetical protein  30 
 
 		 122 aa  44.7  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.705839 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2890  hypothetical protein  25.47 
 
 		 126 aa  44.3  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1630  hypothetical protein  25.42 
 
 		 127 aa  43.5  0.0009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.634363  normal  0.124961 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3965  hypothetical protein  32.67 
 
 		 103 aa  43.5  0.0009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0238816  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3627  hypothetical protein  32.67 
 
 		 103 aa  43.5  0.0009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0256  hypothetical protein  26.42 
 
 		 127 aa  40.8  0.007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1548  hypothetical protein  22.86 
 
 		 126 aa  40  0.01  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.466583  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>