More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1398 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_1398  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  100 
 
 
307 aa  633  1e-180  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.635947  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0092  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  77.2 
 
 
307 aa  504  9.999999999999999e-143  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2341  fructose-bisphosphate aldolase  78.03 
 
 
307 aa  502  1e-141  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0142507  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1089  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  74.92 
 
 
307 aa  495  1e-139  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.234641  normal  0.481189 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0013  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  74.92 
 
 
307 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0162404 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0131  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  74.43 
 
 
308 aa  462  1e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0621  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  71.75 
 
 
323 aa  451  1.0000000000000001e-126  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000156456  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0349  fructose-bisphosphate aldolase  69.41 
 
 
309 aa  446  1.0000000000000001e-124  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000191041  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0035  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  66.13 
 
 
309 aa  434  1e-120  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.643061  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2222  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  66.01 
 
 
311 aa  420  1e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000908669  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0949  fructose-bisphosphate aldolase  56.41 
 
 
325 aa  352  2.9999999999999997e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0554404  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0353  fructose-bisphosphate aldolase  55.52 
 
 
325 aa  351  7e-96  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.198569  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2822  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  55.45 
 
 
320 aa  350  2e-95  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000185169  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2253  fructose-bisphosphate aldolase  53.65 
 
 
327 aa  346  3e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1329  fructose-bisphosphate aldolase  55.77 
 
 
324 aa  343  2e-93  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.569053  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1021  fructose-bisphosphate aldolase  56.27 
 
 
324 aa  343  2.9999999999999997e-93  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0751312  normal  0.0186184 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0728  fructose-bisphosphate aldolase  56.59 
 
 
324 aa  341  7e-93  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1253  fructose-bisphosphate aldolase  55.31 
 
 
324 aa  341  1e-92  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.750489  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2033  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  55.52 
 
 
325 aa  338  5e-92  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000857052  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1362  fructose-bisphosphate aldolase  55.48 
 
 
324 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1045  fructose-bisphosphate aldolase  54.81 
 
 
324 aa  335  5e-91  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000000468946  unclonable  0.00000168547 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1325  fructose-bisphosphate aldolase  53.85 
 
 
374 aa  333  2e-90  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0035  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  53.23 
 
 
328 aa  316  3e-85  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0761  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  50.99 
 
 
330 aa  309  4e-83  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0614307  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0646  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  47.76 
 
 
312 aa  308  8e-83  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2411  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  53.27 
 
 
284 aa  305  5.0000000000000004e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0613985  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0675  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  49.04 
 
 
313 aa  304  1.0000000000000001e-81  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0651  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  48.72 
 
 
313 aa  301  1e-80  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.18209  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2083  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  51.49 
 
 
308 aa  297  1e-79  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18020  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  50.49 
 
 
284 aa  295  8e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000218144  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0759  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  49.35 
 
 
305 aa  288  8e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0182955 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3176  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  50.65 
 
 
284 aa  288  1e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00142497  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1613  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  48.24 
 
 
344 aa  286  2e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.690914 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1272  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  46.36 
 
 
311 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.21247  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5097  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  46.71 
 
 
354 aa  285  8e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1489  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  47.66 
 
 
354 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.156888  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22740  ketose-bisphosphate aldolase  48.52 
 
 
283 aa  283  4.0000000000000003e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2873  fructose-1,6-bisphosphate aldolase class II  49 
 
 
307 aa  282  5.000000000000001e-75  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3869  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  47.02 
 
 
354 aa  280  1e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.652473  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2404  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  49 
 
 
286 aa  280  2e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0291  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  46.39 
 
 
354 aa  279  5e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0178057 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0480  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  46.71 
 
 
354 aa  278  6e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.669489  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0493  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  46.71 
 
 
354 aa  278  6e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.85021  normal  0.786226 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0935  fructose-bisphosphate aldolase, class II  47.63 
 
 
370 aa  276  2e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0573  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  47.6 
 
 
354 aa  276  3e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4747  fructose-bisphosphate aldolase, class II  47.65 
 
 
354 aa  276  4e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.384431  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4839  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  47.71 
 
 
284 aa  275  6e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.317142  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2386  fructose-bisphosphate aldolase, class II, Calvin cycle subtype  44.86 
 
 
354 aa  275  7e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.109398 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0557  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  46.08 
 
 
354 aa  273  3e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.368512  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3275  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  44.69 
 
 
354 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.604828  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2546  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  45.08 
 
 
354 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0791  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  46.42 
 
 
354 aa  272  4.0000000000000004e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.475428  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2673  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  45.08 
 
 
354 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000776519  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0056  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  49.02 
 
 
287 aa  272  5.000000000000001e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.955798  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4630  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  45.14 
 
 
354 aa  272  6e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0691  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  44.69 
 
 
354 aa  271  7e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.858155  normal  0.247033 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2655  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  45.08 
 
 
354 aa  271  9e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5957  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  45.08 
 
 
354 aa  271  9e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.67865  normal  0.160231 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2015  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  45.08 
 
 
354 aa  271  9e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2626  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  45.08 
 
 
354 aa  271  9e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0937863  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1518  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  47.35 
 
 
345 aa  271  1e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000980725  decreased coverage  0.000076105 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4576  fructose-bisphosphate aldolase  47.02 
 
 
354 aa  271  1e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3250  hypothetical protein  46.49 
 
 
316 aa  270  2e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3624  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  46.65 
 
 
345 aa  270  2e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.113592  normal  0.210537 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0461  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  45.08 
 
 
354 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.671902  normal  0.237356 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0672  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  44.13 
 
 
354 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181894  normal  0.967694 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2889  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  43.93 
 
 
354 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1086  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  45.17 
 
 
355 aa  269  4e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000814215  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0650  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  45.79 
 
 
354 aa  269  4e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0196207  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0841  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  43.81 
 
 
354 aa  269  5e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0836  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  43.81 
 
 
354 aa  269  5e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0040  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  43.81 
 
 
354 aa  269  5e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0594  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  43.81 
 
 
354 aa  269  5e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0299  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  43.81 
 
 
354 aa  269  5e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0267498  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0997  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  43.81 
 
 
354 aa  269  5e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2428  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  43.81 
 
 
354 aa  269  5e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0665  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  43.81 
 
 
354 aa  269  5e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0503  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  46.96 
 
 
354 aa  269  5.9999999999999995e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.262664  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0879  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  45.48 
 
 
354 aa  268  7e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0875  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  45.48 
 
 
355 aa  268  8e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0776  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  45.48 
 
 
355 aa  268  8e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0266968  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3247  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  45.48 
 
 
355 aa  268  8e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0347517  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3350  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  45.48 
 
 
355 aa  268  8e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000198413  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0933  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  45.48 
 
 
355 aa  268  8.999999999999999e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1815  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  44.76 
 
 
354 aa  268  8.999999999999999e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.267172  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1530  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  45.05 
 
 
354 aa  268  1e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0877  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  45.17 
 
 
354 aa  268  1e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000290228  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0204  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  44.2 
 
 
354 aa  267  1e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3656  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  44.55 
 
 
355 aa  267  2e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3537  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  44.55 
 
 
355 aa  267  2e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3462  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  44.55 
 
 
355 aa  267  2e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0830  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  44.55 
 
 
355 aa  267  2e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.254898  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0755  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  45.17 
 
 
354 aa  265  5e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.119495  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2243  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  46.75 
 
 
349 aa  265  7e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0152373 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3596  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  44.21 
 
 
354 aa  265  8.999999999999999e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000879946 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0967  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  45.43 
 
 
359 aa  264  1e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3955  fructose-bisphosphate aldolase  46.39 
 
 
354 aa  264  1e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.145603  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0994  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  45.43 
 
 
359 aa  264  2e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.135805  normal  0.788402 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3304  fructose-bisphosphate aldolase, class II, Calvin cycle subtype  46.39 
 
 
354 aa  263  2e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2793  fructose-bisphosphate aldolase  45.17 
 
 
345 aa  263  2e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.918989  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>