More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0877 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_0755  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  94.92 
 
 		 354 aa  706    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.119495  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0933  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  93.5 
 
 		 355 aa  698    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3537  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  94.35 
 
 		 355 aa  703    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0877  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  100 
 
 		 354 aa  736    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000290228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0830  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  94.35 
 
 		 355 aa  703    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.254898  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0879  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  98.31 
 
 		 354 aa  728    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3462  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  94.35 
 
 		 355 aa  703    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1086  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  94.35 
 
 		 355 aa  702    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000814215  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0791  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  96.33 
 
 		 354 aa  714    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.475428  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2756  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  93.22 
 
 		 355 aa  694    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0776  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  93.22 
 
 		 355 aa  696    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0266968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3247  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  93.22 
 
 		 355 aa  696    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0347517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0650  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  96.88 
 
 		 354 aa  719    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0196207  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0875  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  93.22 
 
 		 355 aa  696    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3350  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  93.22 
 
 		 355 aa  696    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000198413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3656  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  94.35 
 
 		 355 aa  703    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3037  fructose-bisphosphate aldolase, class II  79.94 
 
 		 354 aa  601  1.0000000000000001e-171  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05600  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  77.12 
 
 		 354 aa  583  1.0000000000000001e-165  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.933141  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0370  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  77.97 
 
 		 354 aa  583  1.0000000000000001e-165  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0462  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  76.84 
 
 		 354 aa  578  1e-164  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0390  fructose-bisphosphate aldolase, class II  77.12 
 
 		 354 aa  578  1e-164  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4787  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  76.55 
 
 		 354 aa  577  1e-164  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.111053 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07230  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  76.84 
 
 		 354 aa  578  1e-164  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4960  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  76.84 
 
 		 354 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5262  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  76.84 
 
 		 354 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0658  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  76.55 
 
 		 354 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.76632  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4833  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  76.84 
 
 		 354 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0506  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  76.55 
 
 		 354 aa  574  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5009  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  76.55 
 
 		 354 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.694536 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3876  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  75.42 
 
 		 354 aa  562  1.0000000000000001e-159  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2889  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  74.58 
 
 		 354 aa  561  1.0000000000000001e-159  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2386  fructose-bisphosphate aldolase, class II, Calvin cycle subtype  74.58 
 
 		 354 aa  558  1e-158  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.109398 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0708  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  76.52 
 
 		 345 aa  556  1e-157  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0417855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2844  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  74.5 
 
 		 354 aa  556  1e-157  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0683  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  76.45 
 
 		 345 aa  553  1e-156  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.262233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2804  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  73.16 
 
 		 354 aa  550  1e-155  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1974  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  72.6 
 
 		 363 aa  545  1e-154  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0229  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  72.6 
 
 		 363 aa  545  1e-154  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.58536  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0163  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  72.39 
 
 		 355 aa  542  1e-153  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0408428 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1039  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  71.39 
 
 		 354 aa  539  9.999999999999999e-153  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2849  fructose-bisphosphate aldolase, class II, Calvin cycle subtype  72.8 
 
 		 356 aa  535  1e-151  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0980884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3248  fructose-bisphosphate aldolase, class II  72.8 
 
 		 356 aa  535  1e-151  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2793  fructose-bisphosphate aldolase  72.97 
 
 		 345 aa  530  1e-149  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.918989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3624  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  74.2 
 
 		 345 aa  528  1e-149  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.113592  normal  0.210537 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0405  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  71.19 
 
 		 354 aa  530  1e-149  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.841441  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4316  fructose-bisphosphate aldolase, class II  69.83 
 
 		 355 aa  521  1e-147  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0384  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  70.9 
 
 		 354 aa  519  1e-146  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3041  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  69.21 
 
 		 354 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0163377  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3047  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  69.21 
 
 		 354 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.589963  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1489  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  68.36 
 
 		 354 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.156888  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3022  fructose-bisphosphate aldolase, class II, Calvin cycle subtype  71.01 
 
 		 338 aa  512  1e-144  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.625607  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0557  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  69.63 
 
 		 354 aa  514  1e-144  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.368512  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3218  fructose-bisphosphate aldolase  68.08 
 
 		 354 aa  512  1e-144  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.338247  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0573  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  69.05 
 
 		 354 aa  508  1e-143  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4576  fructose-bisphosphate aldolase  69.05 
 
 		 354 aa  508  1e-143  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1518  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  69.77 
 
 		 345 aa  509  1e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000980725  decreased coverage  0.000076105 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0935  fructose-bisphosphate aldolase, class II  68.19 
 
 		 370 aa  507  9.999999999999999e-143  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0480  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  68.77 
 
 		 354 aa  507  9.999999999999999e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.669489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0493  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  68.48 
 
 		 354 aa  505  9.999999999999999e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.85021  normal  0.786226 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0503  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  68.48 
 
 		 354 aa  503  1e-141  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.262664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1988  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  71.17 
 
 		 338 aa  498  1e-140  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0362683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0248  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  65.82 
 
 		 354 aa  498  1e-140  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000074313  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2243  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  69.94 
 
 		 349 aa  499  1e-140  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0152373 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2447  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  70.72 
 
 		 345 aa  501  1e-140  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.88579 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3304  fructose-bisphosphate aldolase, class II, Calvin cycle subtype  67.34 
 
 		 354 aa  496  1e-139  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3955  fructose-bisphosphate aldolase  67.34 
 
 		 354 aa  496  1e-139  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.145603  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5097  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  65.72 
 
 		 354 aa  493  9.999999999999999e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1530  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  66.1 
 
 		 354 aa  493  9.999999999999999e-139  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3596  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  66.38 
 
 		 354 aa  488  1e-137  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000879946 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0672  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  67.05 
 
 		 354 aa  491  1e-137  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181894  normal  0.967694 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5957  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  67.05 
 
 		 354 aa  488  1e-137  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.67865  normal  0.160231 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2546  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  66.76 
 
 		 354 aa  488  1e-137  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4630  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  66.48 
 
 		 354 aa  488  1e-137  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2655  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  67.05 
 
 		 354 aa  488  1e-137  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2015  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  67.05 
 
 		 354 aa  488  1e-137  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1815  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  66.1 
 
 		 354 aa  491  1e-137  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.267172  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2673  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  66.76 
 
 		 354 aa  488  1e-137  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000776519  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2626  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  67.05 
 
 		 354 aa  488  1e-137  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0937863  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1912  fructose-bisphosphate aldolase, class II  67.05 
 
 		 354 aa  486  1e-136  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.326014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0461  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  66.48 
 
 		 354 aa  484  1e-136  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.671902  normal  0.237356 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0361  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  67.71 
 
 		 354 aa  487  1e-136  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000396687 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3275  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  65.25 
 
 		 354 aa  485  1e-136  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.604828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0040  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  65.9 
 
 		 354 aa  483  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0841  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  65.9 
 
 		 354 aa  483  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0836  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  65.9 
 
 		 354 aa  483  1e-135  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0299  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  65.9 
 
 		 354 aa  483  1e-135  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0267498  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0997  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  65.9 
 
 		 354 aa  483  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0596  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  65.54 
 
 		 354 aa  482  1e-135  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0665  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  65.9 
 
 		 354 aa  483  1e-135  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0204  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  64.69 
 
 		 354 aa  482  1e-135  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0691  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  65.62 
 
 		 354 aa  481  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.858155  normal  0.247033 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3869  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  65.9 
 
 		 354 aa  483  1e-135  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.652473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0594  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  65.9 
 
 		 354 aa  483  1e-135  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2428  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  65.9 
 
 		 354 aa  483  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4747  fructose-bisphosphate aldolase, class II  63.9 
 
 		 354 aa  478  1e-134  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.384431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3751  fructose-bisphosphate aldolase, class II  67.54 
 
 		 345 aa  480  1e-134  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08421  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  65.25 
 
 		 357 aa  476  1e-133  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.201369  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2369  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  64.31 
 
 		 355 aa  474  1e-133  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.545417 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0789  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  65.25 
 
 		 357 aa  476  1e-133  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08441  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  64.97 
 
 		 357 aa  475  1e-133  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>