78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1138 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_1138  amino acid-binding ACT domain protein  100 
 
 
143 aa  288  1e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000787959  normal  0.731263 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0447  amino acid-binding ACT domain protein  78.72 
 
 
143 aa  231  3e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.266025 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0796  amino acid-binding ACT domain protein  76.22 
 
 
143 aa  229  7.000000000000001e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1522  amino acid-binding ACT domain-containing protein  73.94 
 
 
170 aa  225  2e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0251264 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1682  amino acid-binding ACT domain-containing protein  72.73 
 
 
143 aa  222  2e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2088  ACT domain-containing protein  71.13 
 
 
143 aa  213  7e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.835718  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1120  amino acid-binding ACT domain protein  68.31 
 
 
143 aa  207  4e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.298875  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2132  amino acid-binding ACT domain-containing protein  67.83 
 
 
143 aa  201  2e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0184772  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1859  amino acid-binding ACT domain protein  67.83 
 
 
143 aa  201  3e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00254903  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1736  ACT domain-containing protein  66.43 
 
 
143 aa  197  3e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0567956  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1670  amino acid-binding ACT domain-containing protein  66.43 
 
 
143 aa  197  3e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2322  amino acid-binding ACT domain-containing protein  62.24 
 
 
143 aa  195  2.0000000000000003e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2191  amino acid-binding ACT domain protein  64.34 
 
 
143 aa  194  4.0000000000000005e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1824  ACT domain-containing protein  64.34 
 
 
143 aa  192  9e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2036  amino acid-binding ACT domain protein  64.34 
 
 
143 aa  192  1e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000214069 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2883  amino acid-binding ACT domain-containing protein  58.74 
 
 
143 aa  178  2e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.14042  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1570  ACT domain-containing protein  61.54 
 
 
143 aa  173  9e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3510  amino acid-binding ACT domain protein  57.34 
 
 
143 aa  170  5e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0260882  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0514  ACT domain-containing protein  55.94 
 
 
143 aa  167  6e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0670  amino acid-binding ACT domain protein  52.82 
 
 
143 aa  164  2.9999999999999998e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1503  amino acid-binding ACT domain protein  51.75 
 
 
143 aa  159  2e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1575  amino acid-binding ACT domain-containing protein  56.72 
 
 
143 aa  157  4e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.114486  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0616  ACT domain-containing protein  49.65 
 
 
143 aa  156  9e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.896722  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0167  amino acid-binding ACT domain protein  53.15 
 
 
143 aa  155  1e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0816  amino acid-binding ACT  50 
 
 
142 aa  154  3e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.842739  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0832  amino acid-binding ACT domain-containing protein  50.36 
 
 
147 aa  151  4e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219299  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0261  amino acid-binding ACT domain-containing protein  46.04 
 
 
144 aa  139  9.999999999999999e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0159897  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0053  amino acid-binding ACT domain protein  46.85 
 
 
147 aa  137  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0041  amino acid-binding ACT domain protein  46.85 
 
 
147 aa  137  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0037  ACT domain-containing protein  46.15 
 
 
147 aa  137  7e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0040  amino acid-binding ACT domain-containing protein  43.36 
 
 
147 aa  134  6.0000000000000005e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0065  hypothetical protein  44.76 
 
 
142 aa  130  3.9999999999999996e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1743  amino acid-binding ACT domain-containing protein  41.26 
 
 
141 aa  130  5e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.237603 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0074  amino acid-binding ACT domain protein  44.76 
 
 
142 aa  130  6.999999999999999e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1591  amino acid-binding ACT domain-containing protein  41.26 
 
 
141 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0860  amino acid-binding ACT domain-containing protein  40.56 
 
 
141 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0495792  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1971  amino acid-binding ACT domain-containing protein  44.44 
 
 
142 aa  128  2.0000000000000002e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0069  amino acid-binding ACT domain protein  42.66 
 
 
142 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0168  amino acid-binding ACT domain-containing protein  40.56 
 
 
141 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.25479  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0071  amino acid-binding ACT domain-containing protein  50 
 
 
145 aa  122  2e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4321  ACT domain-containing protein  41.38 
 
 
149 aa  119  1.9999999999999998e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2859  amino acid-binding ACT domain protein  41.01 
 
 
151 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0210  acetolactate synthase small subunit  39.72 
 
 
145 aa  118  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.846842 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3086  amino acid-binding ACT domain-containing protein  41.35 
 
 
135 aa  118  3e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3082  amino acid-binding ACT domain-containing protein  39.16 
 
 
143 aa  118  3e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1421  hypothetical protein  41.01 
 
 
151 aa  117  7.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0708  amino acid-binding ACT domain-containing protein  47.01 
 
 
144 aa  116  9.999999999999999e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.464159  normal  0.126423 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1623  amino acid-binding ACT  44.03 
 
 
144 aa  112  3e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.856261 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0208  amino acid-binding (ACT) protein  40.43 
 
 
145 aa  110  9e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2122  amino acid-binding ACT domain protein  46.83 
 
 
144 aa  105  1e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1579  amino acid-binding ACT domain protein  38.3 
 
 
142 aa  105  2e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.210637 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13420  ACT domain-containing protein  39.72 
 
 
142 aa  103  7e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0748  amino acid-binding ACT domain-containing protein  41.61 
 
 
143 aa  101  4e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00491505  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06230  ACT domain-containing protein  35.46 
 
 
142 aa  100  6e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.58032  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1455  hypothetical protein  34.31 
 
 
144 aa  98.2  4e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.323054 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0901  ACT domain-containing protein  36.29 
 
 
129 aa  97.4  6e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_885  ACT domain protein  35.16 
 
 
129 aa  97.1  7e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1014  ACT domain-containing protein  35.16 
 
 
129 aa  95.9  2e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1319  ACT domain-containing protein  36.11 
 
 
144 aa  91.3  4e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1584  amino acid-binding ACT domain protein  38.46 
 
 
144 aa  85.1  3e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0505283 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0720  putative acetolactate synthase small regulatory subunit  32.84 
 
 
151 aa  82.4  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.726001 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0909  amino acid-binding ACT domain-containing protein  30.22 
 
 
153 aa  75.1  0.0000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.394001  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2427  amino acid-binding ACT domain protein  34.86 
 
 
129 aa  72  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.662665  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2514  amino acid-binding ACT domain protein  33.94 
 
 
129 aa  70.1  0.000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.583261  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1433  ACT domain-containing protein  33.94 
 
 
129 aa  69.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.50436  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3113  amino acid-binding ACT domain protein  35.71 
 
 
137 aa  67.4  0.00000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.569355  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2396  amino acid-binding ACT domain-containing protein  38 
 
 
129 aa  63.9  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0873  amino acid-binding ACT  27.07 
 
 
152 aa  59.3  0.00000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1107  acetolactate synthase small subunit  29.77 
 
 
136 aa  55.1  0.0000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1309  amino acid-binding ACT domain-containing protein  30.39 
 
 
142 aa  50.4  0.000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2624  acetolactate synthase, small subunit  37.29 
 
 
160 aa  47  0.00008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0326  hypothetical protein  23.71 
 
 
125 aa  41.2  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2019  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  28.47 
 
 
164 aa  40.8  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.128941  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2879  amino acid-binding ACT domain-containing protein  25 
 
 
128 aa  40.4  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.555565 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3130  acetolactate synthase, small subunit  40 
 
 
160 aa  40.4  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3431  acetolactate synthase, small subunit  33.93 
 
 
166 aa  40.4  0.008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.418353  normal  0.014642 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0528  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  46.67 
 
 
165 aa  40.4  0.009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.973022 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2139  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  44.44 
 
 
164 aa  40.4  0.009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.141993  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>