52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0997 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0997  adenylylsulfate reductase, beta subunit  100 
 
 		 144 aa  301  3.0000000000000004e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000160425  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0636  adenylylsulfate reductase, beta subunit  70.68 
 
 		 147 aa  197  3.9999999999999996e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1838  adenylylsulfate reductase, beta subunit  70.4 
 
 		 140 aa  196  1.0000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0138336  normal  0.023497 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1047  adenylylsulfate reductase, beta subunit  64.38 
 
 		 147 aa  195  2.0000000000000003e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0187678  normal  0.010444 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1886  adenylylsulfate reductase, beta subunit  75.89 
 
 		 145 aa  192  1e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000106288  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0040  adenylylsulfate reductase, beta subunit  73.04 
 
 		 140 aa  192  1e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.333831  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1586  adenylylsulfate reductase subunit beta  73.04 
 
 		 140 aa  190  4e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00926364  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1967  adenylylsulfate reductase, beta subunit  63.51 
 
 		 167 aa  189  1e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0419652 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3578  adenylylsulfate reductase, beta subunit  65.41 
 
 		 146 aa  186  7e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000448806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3197  adenylylsulfate reductase, beta subunit  62.24 
 
 		 162 aa  185  1e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.00000000312858  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1081  adenylylsulfate reductase, beta subunit  60.27 
 
 		 147 aa  184  4e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2892  adenylylsulfate reductase, beta subunit  63.43 
 
 		 167 aa  183  6e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.409396 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2130  adenylylsulfate reductase, beta subunit  60.84 
 
 		 162 aa  183  6e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.925917  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2137  adenylylsulfate reductase, beta subunit  62.69 
 
 		 167 aa  182  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1109  adenylylsulfate reductase subunit beta  63.7 
 
 		 162 aa  182  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000257152  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0873  adenylylsulfate reductase, beta subunit  59.03 
 
 		 161 aa  178  2.9999999999999997e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.970747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1429  adenylylsulfate reductase, beta subunit  45.19 
 
 		 160 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0667078 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0272  adenylylsulfate reductase, beta subunit  50.45 
 
 		 161 aa  111  3e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000000000553885  hitchhiker  0.000000190129 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0064  adenylylsulfate reductase, beta subunit  49.11 
 
 		 159 aa  111  3e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0351  adenylylsulfate reductase, beta subunit  51.55 
 
 		 160 aa  105  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.480328  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2283  adenylylsulfate reductase, beta subunit  50.52 
 
 		 160 aa  103  8e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1234  adenylylsulfate reductase, beta subunit  41.48 
 
 		 164 aa  99.8  1e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.480788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0789  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.95 
 
 		 107 aa  85.5  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1888  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.7 
 
 		 114 aa  85.1  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000841156  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1709  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain protein  38.1 
 
 		 118 aa  81.6  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0925  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.67 
 
 		 113 aa  79.3  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02130  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.41 
 
 		 107 aa  66.2  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1297  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  41.27 
 
 		 81 aa  47  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.814234  normal  0.164928 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1973  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  43.55 
 
 		 81 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6104  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  43.55 
 
 		 81 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.416021  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1961  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.68 
 
 		 81 aa  45.4  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.323948  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5288  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  45.65 
 
 		 81 aa  45.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.782627  normal  0.0624847 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34920  putative ferredoxin  39.68 
 
 		 81 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000025951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1888  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.68 
 
 		 81 aa  45.4  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.394196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1831  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 103 aa  44.3  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0759  ferredoxin  40 
 
 		 60 aa  43.9  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000247622 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1192  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.86 
 
 		 105 aa  43.5  0.0009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5012  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.68 
 
 		 81 aa  42.7  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4092  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  39.68 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.141555  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4204  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  39.68 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0206  ferredoxin, 4Fe-4S  39.68 
 
 		 81 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.623695 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1997  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  41.94 
 
 		 81 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.859731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3162  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  40.62 
 
 		 81 aa  42.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.274063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6150  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.35 
 
 		 77 aa  41.2  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0537  glutamate synthase (NADPH)  37.31 
 
 		 507 aa  41.6  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0523  glutamate synthase (NADPH)  37.31 
 
 		 507 aa  41.6  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.55997  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2289  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.29 
 
 		 118 aa  41.6  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.372027  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4197  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40.68 
 
 		 77 aa  40.8  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4143  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  31.4 
 
 		 107 aa  40.8  0.007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.456282  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3789  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  42.55 
 
 		 76 aa  40.8  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0877  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.1 
 
 		 995 aa  40.8  0.007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0618  hypothetical protein  30.16 
 
 		 255 aa  40.8  0.007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>