41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0046 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_0046  hypothetical protein  100 
 
 
356 aa  719  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3079  hypothetical protein  44.83 
 
 
356 aa  314  1e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  5.78583e-06  unclonable  1.19825e-05 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0492  hypothetical protein  39.82 
 
 
343 aa  239  4e-62  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.894917  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0516  hypothetical protein  38.78 
 
 
342 aa  239  5e-62  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_457  hypothetical protein, methionine synthase II-like protein  38.48 
 
 
342 aa  239  6e-62  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2940  hypothetical protein  37.18 
 
 
355 aa  233  3e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0730629  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1450  hypothetical protein  39.61 
 
 
361 aa  226  5e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  8.25715e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1037  hypothetical protein  35.67 
 
 
354 aa  226  6e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0833  hypothetical protein  38.92 
 
 
355 aa  224  2e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.637029 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2318  hypothetical protein  35.18 
 
 
357 aa  206  3e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  2.6475e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0203  hypothetical protein  37.54 
 
 
350 aa  203  3e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1192  hypothetical protein  31.07 
 
 
346 aa  155  1e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0456752 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0807  hypothetical protein  28.98 
 
 
344 aa  143  6e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.182765  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1397  hypothetical protein  30.82 
 
 
341 aa  127  2e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00537849  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1610  hypothetical protein  26.96 
 
 
342 aa  122  9e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.589994  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1905  hypothetical protein  28.03 
 
 
341 aa  116  6e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  9.83777e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0486  hypothetical protein  30.34 
 
 
346 aa  112  8e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.485103  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0157  hypothetical protein  27.81 
 
 
346 aa  106  5e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.050651  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3098  hypothetical protein  30.26 
 
 
358 aa  102  9e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.944991  normal  0.696919 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3561  hypothetical protein  22.38 
 
 
353 aa  77.8  3e-13  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2108  methionine synthase, vitamin-B12 independent  30.66 
 
 
336 aa  67  4e-10  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.368656  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1722  hypothetical protein  29.82 
 
 
311 aa  66.6  6e-10  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135438  normal  0.137944 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08670  cobalamin-independent methionine synthase  26.15 
 
 
362 aa  62.8  9e-09  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1858  methionine synthase, vitamin-B12 independent  29.07 
 
 
336 aa  62.4  1e-08  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.531176 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1878  methionine synthase, vitamin-B12 independent  29.07 
 
 
339 aa  62  1e-08  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1924  methionine synthase, vitamin-B12 independent  29.07 
 
 
336 aa  62  1e-08  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.261497  normal  0.746847 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3253  Methionine synthase vitamin-B12 independent  28.33 
 
 
336 aa  58.2  2e-07  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1312  Methionine synthase vitamin-B12 independent  26.1 
 
 
335 aa  57.4  4e-07  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.558991  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13030  hypothetical protein  28.77 
 
 
337 aa  54.7  2e-06  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.42817e-20  normal  0.0693618 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1445  Methionine synthase vitamin-B12 independent  28.57 
 
 
362 aa  54.3  3e-06  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.354895 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0159  Methionine synthase vitamin-B12 independent  24.68 
 
 
347 aa  54.3  3e-06  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2350  hypothetical protein  23.1 
 
 
339 aa  52.8  9e-06  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0185233  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2364  Methionine synthase vitamin-B12 independent  28.57 
 
 
370 aa  51.2  3e-05  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.974097  normal  0.700828 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1819  methionine synthase, vitamin-B12 independent  25.53 
 
 
320 aa  50.1  6e-05  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.153408  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4252  methionine synthase, vitamin-B12 independent  26.46 
 
 
336 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.418665  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0602  hypothetical protein  24.1 
 
 
342 aa  49.3  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.441061  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2908  Methionine synthase vitamin-B12 independent  23.64 
 
 
335 aa  48.1  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.977615  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3565  Methionine synthase vitamin-B12 independent  27.62 
 
 
337 aa  47  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0908729  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3444  methionine synthase, vitamin-B12 independent  27.06 
 
 
338 aa  46.6  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.76983  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3648  methionine synthase, vitamin-B12 independent  23.93 
 
 
376 aa  46.6  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.744365  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8078  hypothetical protein  25.15 
 
 
334 aa  43.5  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>