More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_380 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0438  metallo-beta-lactamase family protein  99.82 
 
 		 551 aa  1114    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.386369  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3163  beta-lactamase domain protein  55.78 
 
 		 554 aa  642    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0415  beta-lactamase domain-containing protein  98.91 
 
 		 551 aa  1107    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.223724  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_380  metallo-beta-lactamase  100 
 
 		 551 aa  1115    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1938  beta-lactamase domain-containing protein  55.05 
 
 		 554 aa  631  1e-180  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0947  beta-lactamase domain-containing protein  55.47 
 
 		 554 aa  632  1e-180  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1494  beta-lactamase domain-containing protein  54.45 
 
 		 560 aa  630  1e-179  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000870726  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1678  beta-lactamase domain protein  52.44 
 
 		 553 aa  623  1e-177  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1302  hypothetical protein  54.99 
 
 		 555 aa  622  1e-177  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1772  beta-lactamase domain protein  53.99 
 
 		 555 aa  617  1e-175  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0198506  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1069  hypothetical protein  51.37 
 
 		 555 aa  609  1e-173  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000100194  normal  0.0563275 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2028  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  52.54 
 
 		 555 aa  602  1.0000000000000001e-171  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1745  RNA-metabolizing metallo-beta-lactamase family protein  52.17 
 
 		 555 aa  598  1e-170  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1268  metallo-beta-lactamase family protein  51 
 
 		 553 aa  592  1e-168  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000954754  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1816  beta-lactamase domain-containing protein  51.89 
 
 		 559 aa  588  1e-167  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000137497  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1460  beta-lactamase domain protein  50.82 
 
 		 566 aa  591  1e-167  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1460  beta-lactamase domain protein  51.36 
 
 		 551 aa  582  1.0000000000000001e-165  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000017363  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0796  beta-lactamase domain protein  51.09 
 
 		 553 aa  582  1.0000000000000001e-165  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3657  beta-lactamase domain protein  51.37 
 
 		 554 aa  580  1e-164  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000145039  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3833  metallo-beta-lactamase family protein  50.18 
 
 		 556 aa  570  1e-161  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000419922  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3648  metallo-beta-lactamase family protein  50.18 
 
 		 556 aa  570  1e-161  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3538  metallo-beta-lactamase family protein  50.18 
 
 		 556 aa  570  1e-161  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0178756  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3567  beta-lactamase domain-containing protein  49.82 
 
 		 556 aa  570  1e-161  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00558369  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3556  metallo-beta-lactamase family protein  50.18 
 
 		 556 aa  570  1e-161  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3845  metallo-beta-lactamase family protein  50.18 
 
 		 556 aa  570  1e-161  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000592634  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3933  metallo-beta-lactamase family protein  50.18 
 
 		 556 aa  570  1e-161  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00612119  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3896  metallo-beta-lactamase family protein  50 
 
 		 556 aa  568  1e-161  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0341705  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3809  metallo-beta-lactamase family protein  50.18 
 
 		 556 aa  570  1e-161  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2993599999999999e-37 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1403  metallo-beta-lactamase family protein  49.82 
 
 		 556 aa  567  1e-160  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0055609  hitchhiker  0.000000000000158477 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0627  beta-lactamase domain protein  49.64 
 
 		 555 aa  567  1e-160  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.223093  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2449  beta-lactamase domain-containing protein  48.91 
 
 		 583 aa  564  1.0000000000000001e-159  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0351233  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0366  hypothetical protein  49.45 
 
 		 558 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0664287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3668  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  48.28 
 
 		 557 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000237244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1676  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  48.1 
 
 		 557 aa  562  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0518689  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08700  beta-lactamase domain protein  50.45 
 
 		 558 aa  562  1.0000000000000001e-159  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000465654  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1522  metallo-beta-lactamase family protein  47.92 
 
 		 557 aa  560  1e-158  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0439193  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1494  Zn-dependent hydrolase  47.74 
 
 		 557 aa  560  1e-158  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000794402  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1484  Zn-dependent hydrolase  47.74 
 
 		 557 aa  558  1e-158  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000568728  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1781  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  47.92 
 
 		 557 aa  558  1e-158  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0160352  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1707  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  47.92 
 
 		 557 aa  560  1e-158  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1730  metallo-beta-lactamase family protein  47.56 
 
 		 557 aa  555  1e-157  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.744262  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4393  beta-lactamase domain-containing protein  50.18 
 
 		 558 aa  557  1e-157  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0728616  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0947  beta-lactamase domain protein  48.28 
 
 		 555 aa  551  1e-156  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164083  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4078  beta-lactamase domain-containing protein  47.95 
 
 		 561 aa  550  1e-155  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35741  normal  0.385079 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2447  beta-lactamase domain protein  47.22 
 
 		 557 aa  551  1e-155  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1827  beta-lactamase domain protein  48.1 
 
 		 555 aa  547  1e-154  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0875  beta-lactamase domain-containing protein  47.42 
 
 		 561 aa  547  1e-154  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0942136  normal  0.212553 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3113  metallo-beta-lactamase family protein  49.91 
 
 		 533 aa  544  1e-153  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4026  hypothetical protein  47.62 
 
 		 555 aa  543  1e-153  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0999117  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2679  beta-lactamase domain-containing protein  46.65 
 
 		 555 aa  544  1e-153  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000157483  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3887  hypothetical protein  47.62 
 
 		 555 aa  544  1e-153  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0624715  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3719  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  47.62 
 
 		 555 aa  544  1e-153  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.998295  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3735  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  47.62 
 
 		 555 aa  544  1e-153  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3992  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  47.62 
 
 		 555 aa  544  1e-153  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4190  hypothetical protein  47.62 
 
 		 555 aa  544  1e-153  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.491645  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4097  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  47.62 
 
 		 555 aa  544  1e-153  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000534796  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1333  beta-lactamase domain-containing protein  45.59 
 
 		 557 aa  543  1e-153  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4080  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  46.84 
 
 		 555 aa  543  1e-153  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0747948  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1160  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  47.02 
 
 		 555 aa  543  1e-153  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.121903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4416  beta-lactamase domain-containing protein  46.57 
 
 		 569 aa  542  1e-153  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3804  beta-lactamase domain-containing protein  47.62 
 
 		 555 aa  543  1e-153  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.199247  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2294  beta-lactamase domain-containing protein  48.47 
 
 		 618 aa  544  1e-153  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0941  beta-lactamase domain protein  46.53 
 
 		 560 aa  541  9.999999999999999e-153  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4057  beta-lactamase domain protein  48.82 
 
 		 558 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3971  beta-lactamase domain protein  48.28 
 
 		 558 aa  535  1e-151  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.313503  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1150  beta-lactamase domain protein  45.83 
 
 		 548 aa  535  1e-151  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1171  beta-lactamase domain protein  46.91 
 
 		 555 aa  529  1e-149  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000121599  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0383  beta-lactamase domain-containing protein  47.81 
 
 		 569 aa  526  1e-148  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2063  beta-lactamase domain protein  46.27 
 
 		 556 aa  524  1e-147  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1149  beta-lactamase domain-containing protein  46.63 
 
 		 565 aa  522  1e-147  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1171  beta-lactamase domain-containing protein  46.63 
 
 		 565 aa  522  1e-147  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3415  beta-lactamase domain protein  47.26 
 
 		 593 aa  521  1e-146  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0676  metallo-beta-lactamase family protein  46.08 
 
 		 560 aa  517  1.0000000000000001e-145  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1420  hypothetical protein  44.34 
 
 		 547 aa  512  1e-144  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.128957  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2198  metallo-beta-lactamase superfamily protein  45.03 
 
 		 555 aa  501  1e-140  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2092  beta-lactamase-like  46.4 
 
 		 556 aa  500  1e-140  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.471204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1597  beta-lactamase domain-containing protein  46.65 
 
 		 561 aa  497  1e-139  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0645  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  45.8 
 
 		 564 aa  495  9.999999999999999e-139  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000101529  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0324  mRNA degradation ribonuclease J1/J2enzyme  43.8 
 
 		 561 aa  493  9.999999999999999e-139  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1749  mRNA degradation ribonuclease J1/J2enzyme  44.55 
 
 		 560 aa  488  1e-137  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.568373  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0478  beta-lactamase domain protein  45.72 
 
 		 572 aa  490  1e-137  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3518  beta-lactamase domain protein  43.82 
 
 		 552 aa  487  1e-136  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000333928  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0787  beta-lactamase domain protein  47.59 
 
 		 554 aa  488  1e-136  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000129126  normal  0.323008 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0179  beta-lactamase domain protein  43.22 
 
 		 591 aa  486  1e-136  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2585  beta-lactamase domain-containing protein  43.8 
 
 		 549 aa  482  1e-135  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0424665  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1761  metallo-beta-lactamase superfamily protein  44.55 
 
 		 559 aa  476  1e-133  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.662098  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2016  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  44.6 
 
 		 578 aa  478  1e-133  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0968063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07540  predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  46.04 
 
 		 631 aa  475  1e-133  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000160452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1184  mRNA degradation ribonuclease J1/J2enzyme  41.97 
 
 		 559 aa  475  1e-133  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.238589  normal  0.189095 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3238  beta-lactamase domain protein  42.91 
 
 		 556 aa  475  1e-132  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.015572  normal  0.303561 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1623  mRNA degradation ribonuclease J1/J2enzyme  41.23 
 
 		 560 aa  475  1e-132  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0647  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  43.68 
 
 		 561 aa  472  1e-132  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1625  beta-lactamase domain protein  46.63 
 
 		 590 aa  471  1.0000000000000001e-131  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000210591  hitchhiker  0.00000143957 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3309  beta-lactamase domain protein  44.53 
 
 		 561 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0174304  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1081  beta-lactamase domain-containing protein  44.53 
 
 		 561 aa  468  9.999999999999999e-131  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0177081  hitchhiker  0.00575165 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1242  mRNA degradation ribonuclease J1/J2enzyme  43.35 
 
 		 573 aa  467  9.999999999999999e-131  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.752598  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10660  predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  44.89 
 
 		 644 aa  461  9.999999999999999e-129  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000341022  unclonable  0.00000000210768 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1516  beta-lactamase domain-containing protein  42.5 
 
 		 618 aa  459  9.999999999999999e-129  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1348  beta-lactamase domain-containing protein  42.83 
 
 		 562 aa  458  9.999999999999999e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0621121  hitchhiker  0.000323796 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1390  beta-lactamase domain-containing protein  42.65 
 
 		 562 aa  457  1e-127  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>