More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1124 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET1342  aspartate aminotransferase  97.74 
 
 		 398 aa  813    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1124  aspartate aminotransferase  100 
 
 		 398 aa  828    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1153  aminotransferase  96.48 
 
 		 398 aa  805    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2182  aminotransferase, class I and II  57.29 
 
 		 405 aa  474  1e-132  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.100524  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3192  aminotransferase, class I and II  57.7 
 
 		 399 aa  473  1e-132  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.593441  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2861  hypothetical protein  55.32 
 
 		 390 aa  462  1e-129  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0048  aminotransferase class I and II  59.11 
 
 		 401 aa  462  1e-129  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00536151  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2208  aminotransferase class I and II  53.93 
 
 		 387 aa  456  1e-127  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2403  aminotransferase class I and II  57.74 
 
 		 387 aa  453  1.0000000000000001e-126  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0215397  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1205  putative aspartate aminotransferase  53.37 
 
 		 397 aa  452  1.0000000000000001e-126  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5040  hypothetical protein  54.96 
 
 		 396 aa  449  1e-125  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3463  aminotransferase  55.38 
 
 		 393 aa  450  1e-125  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0107968 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0150  aminotransferase class I and II  54.31 
 
 		 386 aa  451  1e-125  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.870631  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1188  aminotransferase  54.15 
 
 		 404 aa  450  1e-125  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0134588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3728  aminotransferase class I and II  55.64 
 
 		 387 aa  448  1e-125  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00181067 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4771  hypothetical protein  54.45 
 
 		 396 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4611  hypothetical protein  54.45 
 
 		 396 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5033  hypothetical protein  55.24 
 
 		 396 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.145667  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5045  hypothetical protein  54.71 
 
 		 396 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5133  hypothetical protein  54.45 
 
 		 396 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5012  hypothetical protein  54.45 
 
 		 396 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0201  hypothetical protein  54.71 
 
 		 396 aa  444  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.39659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0185  aminotransferase, class I and II  54.5 
 
 		 388 aa  445  1.0000000000000001e-124  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000603276  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2664  aminotransferase class I and II  55.5 
 
 		 393 aa  447  1.0000000000000001e-124  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0937488  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4633  hypothetical protein  54.2 
 
 		 396 aa  444  1e-123  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2099  aminotransferase  52.76 
 
 		 391 aa  442  1e-123  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1414  aminotransferase class I and II  53.4 
 
 		 407 aa  444  1e-123  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.445663  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4723  hypothetical protein  53.44 
 
 		 396 aa  438  9.999999999999999e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0880  aminotransferase, class I and II  54.83 
 
 		 396 aa  441  9.999999999999999e-123  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3007  hypothetical protein  54.81 
 
 		 390 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1745  aminotransferase class I and II  55.64 
 
 		 393 aa  435  1e-121  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3512  hypothetical protein  52.62 
 
 		 396 aa  436  1e-121  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0363  aminotransferase  52.24 
 
 		 390 aa  437  1e-121  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0236  aminotransferase, class I and II  53.42 
 
 		 388 aa  437  1e-121  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0701  aspartate aminotransferase  51.04 
 
 		 392 aa  428  1e-119  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4591  aminotransferase class I and II  53.28 
 
 		 386 aa  428  1e-119  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0707  aspartate aminotransferase  50.52 
 
 		 392 aa  426  1e-118  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.498645  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2839  aminotransferase class I and II  52.6 
 
 		 395 aa  427  1e-118  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00326737 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1771  aminotransferase class I and II  51.97 
 
 		 391 aa  423  1e-117  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000897955  normal  0.363557 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2473  aminotransferase, class I and II  50.26 
 
 		 400 aa  424  1e-117  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3240  aminotransferase, class I and II  54.86 
 
 		 388 aa  423  1e-117  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64695  normal  0.434806 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0041  aminotransferase class I and II  51.7 
 
 		 402 aa  419  1e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.782752  normal  0.197817 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2564  aminotransferase class I and II  52.08 
 
 		 386 aa  414  1e-114  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0003  aminotransferase, class I and II  49.74 
 
 		 385 aa  407  1.0000000000000001e-112  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1304  aminotransferase class I and II  51.56 
 
 		 410 aa  402  1e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.735807  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0003  aminotransferase  47.79 
 
 		 387 aa  389  1e-107  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0003  aminotransferase class I and II  47.52 
 
 		 388 aa  390  1e-107  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00871395 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0003  aminotransferase, class I and II  49.35 
 
 		 386 aa  386  1e-106  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.987312  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2149  aminotransferase class I and II  49.08 
 
 		 383 aa  379  1e-104  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.152538 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2858  aminotransferase class I and II  48.03 
 
 		 381 aa  380  1e-104  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.961149  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1533  aminotransferase class I and II  47.4 
 
 		 385 aa  380  1e-104  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3529  aminotransferase class I and II  48.7 
 
 		 385 aa  379  1e-104  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.406883  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1319  aminotransferase class I and II  48.29 
 
 		 380 aa  366  1e-100  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0755058 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3535  aminotransferase class I and II  48.68 
 
 		 381 aa  362  4e-99  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2710  aminotransferase A  41.78 
 
 		 387 aa  316  6e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0183593  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3766  aminotransferase A  41.78 
 
 		 387 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4027  aminotransferase A  41.78 
 
 		 387 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3750  aminotransferase A  41.62 
 
 		 387 aa  312  4.999999999999999e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3918  aminotransferase A  41.51 
 
 		 387 aa  311  1e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4225  aminotransferase A  41.51 
 
 		 387 aa  311  1e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1124  aminotransferase A  40.84 
 
 		 387 aa  310  2e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4133  aminotransferase A  41.25 
 
 		 385 aa  311  2e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.562408  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3837  aminotransferase A  41.1 
 
 		 387 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.995763  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4060  aminotransferase A  41.36 
 
 		 387 aa  309  4e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4115  aminotransferase A  40.68 
 
 		 387 aa  306  3e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1809  aminotransferase A  41.15 
 
 		 385 aa  302  6.000000000000001e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0931  aminotransferase A  40.05 
 
 		 382 aa  299  5e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1888  aminotransferase  40.21 
 
 		 370 aa  298  1e-79  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0698  L-aspartate aminotransferase  42.47 
 
 		 401 aa  297  2e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00325114  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0256  aminotransferase class I and II  40.36 
 
 		 386 aa  295  1e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4126  aromatic amino acid aminotransferase  40.71 
 
 		 394 aa  293  3e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1232  aminotransferase  37.87 
 
 		 399 aa  293  3e-78  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0316  aminotransferase A  38.06 
 
 		 398 aa  292  8e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.125137  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1380  aminotransferase class I and II  41.71 
 
 		 398 aa  291  2e-77  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0129457  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0542  aminotransferase, class I and II  42.51 
 
 		 367 aa  289  7e-77  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0515807  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4784  aspartate aminotransferase  40.58 
 
 		 387 aa  288  9e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2083  aspartate aminotransferase  40.73 
 
 		 380 aa  285  8e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00810333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1192  aminotransferase class I and II  41.65 
 
 		 375 aa  285  8e-76  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1955  aminotransferase  40.83 
 
 		 392 aa  285  1.0000000000000001e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0276062 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0921  aminotransferase  38.3 
 
 		 401 aa  285  1.0000000000000001e-75  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000271022  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1268  aspartate aminotransferase  39.39 
 
 		 395 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.65327  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1924  aspartate aminotransferase  41.96 
 
 		 397 aa  283  3.0000000000000004e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4061  aspartate aminotransferase  40.21 
 
 		 389 aa  283  3.0000000000000004e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.257184 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1308  aspartate aminotransferase  40.68 
 
 		 379 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2382  aspartate aminotransferase  39.9 
 
 		 388 aa  283  4.0000000000000003e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.814332 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2331  aspartate aminotransferase  39.64 
 
 		 388 aa  282  9e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1874  aspartate aminotransferase  40.59 
 
 		 380 aa  281  1e-74  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2717  aminotransferase  39.55 
 
 		 387 aa  281  1e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00629468 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1454  aspartate aminotransferase  38.87 
 
 		 395 aa  280  2e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1426  aspartate aminotransferase  38.87 
 
 		 395 aa  280  2e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1427  aspartate aminotransferase  38.87 
 
 		 395 aa  280  2e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1639  aspartate aminotransferase  38.87 
 
 		 395 aa  280  2e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000120157 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1712  aspartate aminotransferase  39.39 
 
 		 395 aa  281  2e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000959703  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1568  aspartate aminotransferase  38.87 
 
 		 395 aa  280  2e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0755  aspartate aminotransferase  39.59 
 
 		 395 aa  280  3e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1601  aspartate aminotransferase  38.62 
 
 		 395 aa  280  3e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1674  aspartate aminotransferase  39.13 
 
 		 395 aa  279  7e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1642  aspartate aminotransferase  41.14 
 
 		 397 aa  279  7e-74  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2545  aspartate aminotransferase  40.1 
 
 		 392 aa  278  1e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.112284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4903  aminotransferase class I and II  39.18 
 
 		 392 aa  277  2e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.234248  hitchhiker  0.00232672 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>