31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4801 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4801  helix-turn-helix domain protein  100 
 
 		 261 aa  536  1e-151  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3829  hypothetical protein  50.85 
 
 		 137 aa  75.5  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3545  hypothetical protein  50.85 
 
 		 140 aa  75.5  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2969  helix-turn-helix domain-containing protein  54.55 
 
 		 140 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000418472  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3076  helix-turn-helix domain protein  39.58 
 
 		 116 aa  68.6  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0869  helix-turn-helix domain-containing protein  45.76 
 
 		 110 aa  67  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0853  XRE family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 110 aa  67  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3075  transcriptional regulator, XRE family  39.66 
 
 		 105 aa  62.8  0.000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1099  XRE family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 115 aa  55.5  0.0000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5811  helix-turn-helix domain-containing protein  40.68 
 
 		 141 aa  55.5  0.0000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2269  XRE family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 127 aa  52.8  0.000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0652  XRE family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 115 aa  51.2  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2146  transcriptional regulator, XRE family  38.6 
 
 		 206 aa  50.1  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0483341  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1027  transcriptional regulator, XRE family  39.34 
 
 		 321 aa  49.7  0.00005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2730  putative DNA-binding protein  39.34 
 
 		 117 aa  48.9  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000010572  hitchhiker  0.0000267972 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0157  XRE family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 104 aa  48.1  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0495  XRE family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 100 aa  47.4  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00400235  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20950  putative prophage repressor  41.27 
 
 		 200 aa  45.8  0.0006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000578065  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1687  XRE family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 111 aa  45.8  0.0007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00137686  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1344  XRE family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 110 aa  45.4  0.0008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.043914  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3618  XRE family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 123 aa  45.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3135  transcriptional regulator, XRE family  37.29 
 
 		 137 aa  44.7  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.317529  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3459  transcriptional regulator  38.81 
 
 		 145 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2192  XRE family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 359 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0311386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3465  XRE family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 142 aa  44.3  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0637  XRE family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 115 aa  44.3  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000152617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0575  XRE family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 115 aa  44.3  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000142648  normal  0.969931 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2209  putative DNA-binding protein  37.7 
 
 		 117 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.706329  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0801  XRE family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 111 aa  43.5  0.003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000260527  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2431  XRE family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 143 aa  42.4  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0904  transcriptional regulator  33.87 
 
 		 111 aa  42.4  0.008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>