37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0296 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0296  hypothetical protein  100 
 
 		 375 aa  759    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2571  protein of unknown function DUF450  34.88 
 
 		 268 aa  83.6  0.000000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.280266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0515  protein of unknown function DUF450  32.7 
 
 		 360 aa  73.2  0.000000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3005  hypothetical protein  31.72 
 
 		 351 aa  67  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.826636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3361  putative restriction endonuclease or methylase  31.03 
 
 		 355 aa  65.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0510  hypothetical protein  33.77 
 
 		 349 aa  62.8  0.000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1111  hypothetical protein  29.27 
 
 		 357 aa  58.9  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0242  protein of unknown function DUF450  26.85 
 
 		 370 aa  58.5  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1269  protein of unknown function DUF450  24.43 
 
 		 356 aa  58.2  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0165219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0961  hypothetical protein  31.03 
 
 		 354 aa  58.2  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0478229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4924  hypothetical protein  30.17 
 
 		 361 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4039  hypothetical protein  30.17 
 
 		 353 aa  56.2  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.400799  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03510  prophage Lp2 protein 6  29.63 
 
 		 426 aa  54.7  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1853  hypothetical protein  31.03 
 
 		 356 aa  54.3  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1839  hypothetical protein  31.03 
 
 		 356 aa  54.3  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00358423  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1887  hypothetical protein  31.03 
 
 		 356 aa  54.3  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.132794  normal  0.576975 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0709  hypothetical protein  34.07 
 
 		 382 aa  53.9  0.000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2724  hypothetical protein  30.7 
 
 		 272 aa  53.1  0.000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.380628  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1326  hypothetical protein  27.59 
 
 		 361 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3692  hypothetical protein  27.59 
 
 		 362 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.877955 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3528  protein of unknown function DUF450  26.92 
 
 		 375 aa  50.4  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0402721  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2922  protein of unknown function DUF450  26.85 
 
 		 374 aa  50.1  0.00006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0378  stress protein, tellurium resistance TerD  32.22 
 
 		 428 aa  49.7  0.00009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3617  hypothetical protein  26.15 
 
 		 363 aa  47.8  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0619  hypothetical protein  35.24 
 
 		 318 aa  47  0.0005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3124  protein of unknown function DUF450  27.5 
 
 		 363 aa  46.2  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.579922  normal  0.419432 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0657  prophage Lp2 protein 6  29.76 
 
 		 245 aa  45.4  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0250  hypothetical protein  27.47 
 
 		 380 aa  45.4  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.178621  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1227  hypothetical protein  25.83 
 
 		 356 aa  44.7  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.888396  normal  0.616229 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6984  protein of unknown function DUF450  27.78 
 
 		 362 aa  44.7  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00893267  hitchhiker  0.0000001532 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0698  hypothetical protein  36.62 
 
 		 248 aa  44.7  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1591  hypothetical protein  24.58 
 
 		 365 aa  44.7  0.003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.330641 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5317  protein of unknown function DUF450  26.83 
 
 		 364 aa  43.5  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0984182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0986  hypothetical protein  29.82 
 
 		 372 aa  43.1  0.007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.432153  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3350  protein of unknown function DUF450  28.72 
 
 		 363 aa  43.1  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2394  hypothetical protein  37.36 
 
 		 291 aa  42.7  0.01  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000000539888  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4887  hypothetical protein  25.86 
 
 		 387 aa  42.7  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.180443  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>