More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4364 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_4364  methionine aminopeptidase, type I  100 
 
 
265 aa  539  9.999999999999999e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0760334  normal  0.344284 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5766  methionine aminopeptidase, type I  74.34 
 
 
270 aa  418  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3141  methionine aminopeptidase, type I  66.93 
 
 
259 aa  368  1e-101  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.183346  normal  0.371364 
 
 
-
 
NC_002950  PG1917  methionine aminopeptidase, type I  62.02 
 
 
261 aa  338  5e-92  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0176  methionine aminopeptidase  61.42 
 
 
257 aa  330  1e-89  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.137768 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1636  methionine aminopeptidase, type I  58.02 
 
 
266 aa  313  2.9999999999999996e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0623  methionine aminopeptidase, type I  58.14 
 
 
262 aa  308  6.999999999999999e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0863  methionine aminopeptidase, type I  55.81 
 
 
281 aa  298  8e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.236959  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0818  methionine aminopeptidase, type I  57.77 
 
 
268 aa  298  9e-80  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1762  methionine aminopeptidase, type I  56.52 
 
 
272 aa  292  3e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1503  methionine aminopeptidase, type I  54.07 
 
 
248 aa  291  8e-78  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0133  methionine aminopeptidase  52.42 
 
 
248 aa  282  5.000000000000001e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000284186  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0153  methionine aminopeptidase  51.61 
 
 
248 aa  277  2e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000019178  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12113  methionine aminopeptidase, type I  52.31 
 
 
277 aa  276  2e-73  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0855577  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0126  methionine aminopeptidase  51.61 
 
 
248 aa  275  4e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000327766  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0444  methionine aminopeptidase, type I  54.47 
 
 
248 aa  275  5e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2692  methionine aminopeptidase, type I  53.66 
 
 
249 aa  275  6e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2377  methionine aminopeptidase, type I  53.66 
 
 
249 aa  275  6e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0127  methionine aminopeptidase  51.21 
 
 
248 aa  275  7e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000038209  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0132  methionine aminopeptidase  51.21 
 
 
248 aa  274  9e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000671118  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0132  methionine aminopeptidase  51.21 
 
 
248 aa  274  9e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000101117  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0128  methionine aminopeptidase  51.21 
 
 
248 aa  274  9e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  8.69033e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0126  methionine aminopeptidase  51.21 
 
 
248 aa  274  9e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000906303  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0132  methionine aminopeptidase  51.21 
 
 
248 aa  274  9e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000383298  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0496  methionine aminopeptidase, type I  54.03 
 
 
251 aa  273  1.0000000000000001e-72  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000338054  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_438  methionine aminopeptidase  53.63 
 
 
251 aa  273  3e-72  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000000226178  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1724  methionine aminopeptidase, type I  50.41 
 
 
247 aa  271  9e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000664848  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0129  methionine aminopeptidase  51.22 
 
 
255 aa  268  8e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2438  methionine aminopeptidase, type I  53.23 
 
 
248 aa  267  2e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0473  methionine aminopeptidase, type I  52.42 
 
 
251 aa  266  4e-70  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000088934  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0216  methionine aminopeptidase, type I  50 
 
 
249 aa  265  5.999999999999999e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0163  methionine aminopeptidase  51.27 
 
 
236 aa  263  2e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000161795  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01380  methionine aminopeptidase, type I  50.4 
 
 
251 aa  263  2e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000165586  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5173  methionine aminopeptidase  51.27 
 
 
236 aa  263  2e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000101637  unclonable  1.02861e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0145  methionine aminopeptidase  51.27 
 
 
236 aa  263  2e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.25768e-61 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0246  methionine aminopeptidase, type I  50.81 
 
 
249 aa  263  3e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000972645  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2043  methionine aminopeptidase, type I  51.56 
 
 
263 aa  261  6e-69  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000664396  normal  0.306355 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1522  methionine aminopeptidase, type I  49.6 
 
 
249 aa  261  6e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1086  methionine aminopeptidase, type I  48.78 
 
 
250 aa  261  8e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0756578  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0307  methionine aminopeptidase, type I  51.63 
 
 
249 aa  261  1e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.557928  normal  0.2574 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3795  methionine aminopeptidase, type I  48.37 
 
 
250 aa  259  3e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0385328  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0888  methionine aminopeptidase, type I  50 
 
 
248 aa  259  4e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000023195  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2644  methionine aminopeptidase, type I  49.8 
 
 
249 aa  258  5.0000000000000005e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0236  methionine aminopeptidase, type I  50.4 
 
 
248 aa  258  6e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0067703  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1592  methionine aminopeptidase, type I  48.39 
 
 
248 aa  257  1e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2133  methionine aminopeptidase, type I  51.01 
 
 
259 aa  256  2e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.150484  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2124  methionine aminopeptidase, type I  52.02 
 
 
256 aa  254  7e-67  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.896424 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2311  hypothetical protein  49.21 
 
 
254 aa  253  2.0000000000000002e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000322255  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1577  methionine aminopeptidase, type I  49.8 
 
 
248 aa  253  3e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00040265  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1133  methionine aminopeptidase, type I  46.15 
 
 
249 aa  251  6e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1933  methionine aminopeptidase, type I  51.01 
 
 
269 aa  251  1e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.663831 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08720  methionine aminopeptidase, type I  50.41 
 
 
259 aa  250  2e-65  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.337434  hitchhiker  0.0000000254038 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2925  methionine aminopeptidase, type I  48.24 
 
 
256 aa  250  2e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000142158  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2208  methionine aminopeptidase, type I  47.27 
 
 
265 aa  250  2e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000857488  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4299  methionine aminopeptidase, type I  47.81 
 
 
273 aa  249  4e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1489  methionine aminopeptidase  46.4 
 
 
252 aa  248  5e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2835  methionine aminopeptidase, type I  49.6 
 
 
248 aa  247  1e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0202  peptidase M24A  49.61 
 
 
261 aa  248  1e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000169894  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1284  methionine aminopeptidase, type I  50.2 
 
 
259 aa  247  1e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.222119  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2275  methionine aminopeptidase, type I  46.48 
 
 
258 aa  247  2e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000957791  hitchhiker  0.00333924 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0310  methionine aminopeptidase, type I  49.03 
 
 
265 aa  247  2e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0001286  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1830  peptidase M24A  48.83 
 
 
260 aa  246  4e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2061  methionine aminopeptidase, type I  47.01 
 
 
264 aa  243  3e-63  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1134  methionine aminopeptidase, type I  47.18 
 
 
250 aa  243  3e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0702  methionine aminopeptidase, type I  46.77 
 
 
249 aa  242  3.9999999999999997e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000166875  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5146  methionine aminopeptidase, type I  49.19 
 
 
274 aa  241  9e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1396  methionine aminopeptidase, type I  48.99 
 
 
249 aa  241  1e-62  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3721  methionine aminopeptidase  45.16 
 
 
248 aa  240  2e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3973  methionine aminopeptidase, type I  48.43 
 
 
257 aa  240  2e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1474  methionine aminopeptidase  46.77 
 
 
248 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.724468  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1446  methionine aminopeptidase  45.97 
 
 
248 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1447  methionine aminopeptidase  45.97 
 
 
248 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1590  methionine aminopeptidase  46.77 
 
 
248 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.895189  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1660  methionine aminopeptidase  45.97 
 
 
248 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.528417 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1139  methionine aminopeptidase, type I  48.74 
 
 
262 aa  239  4e-62  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000000863177  normal  0.0264901 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0780  methionine aminopeptidase, type I  46.27 
 
 
255 aa  238  5.999999999999999e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000341129  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2402  methionine aminopeptidase, type I  45.53 
 
 
265 aa  238  5.999999999999999e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00167537  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0351  methionine aminopeptidase, type I  43.78 
 
 
254 aa  238  6.999999999999999e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0768  methionine aminopeptidase, type I  47.6 
 
 
250 aa  238  8e-62  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1623  methionine aminopeptidase  45.56 
 
 
248 aa  238  1e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00675499  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1248  methionine aminopeptidase, type I  51.42 
 
 
250 aa  238  1e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000462112  normal  0.100012 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1368  methionine aminopeptidase, type I  47.56 
 
 
248 aa  236  3e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00612315  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0737  methionine aminopeptidase, type I  48.98 
 
 
248 aa  236  3e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2624  methionine aminopeptidase, type I  47.58 
 
 
274 aa  236  4e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0837779  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3645  methionine aminopeptidase, type I  45.93 
 
 
251 aa  235  5.0000000000000005e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000862286  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3883  methionine aminopeptidase, type I  45.38 
 
 
272 aa  235  5.0000000000000005e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0723  methionine aminopeptidase, type I  49.39 
 
 
248 aa  235  6e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.277652  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1734  methionine aminopeptidase  44.76 
 
 
248 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000881494  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1343  methionine aminopeptidase, type I  46.85 
 
 
256 aa  231  7.000000000000001e-60  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1336  methionine aminopeptidase, type I  46.46 
 
 
256 aa  230  2e-59  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1733  methionine aminopeptidase, type I  47.39 
 
 
248 aa  229  3e-59  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0778725  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6592  methionine aminopeptidase, type I  45.06 
 
 
258 aa  229  3e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.843296  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1088  methionine aminopeptidase, type I  47.44 
 
 
236 aa  229  3e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0403434  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1437  methionine aminopeptidase, type I  47.24 
 
 
262 aa  229  4e-59  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000252136  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1695  methionine aminopeptidase  43.9 
 
 
248 aa  228  5e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3306  methionine aminopeptidase, type I  54.63 
 
 
236 aa  228  7e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000948834 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1108  Methionyl aminopeptidase  44.8 
 
 
272 aa  228  8e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.2166 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1362  methionine aminopeptidase, type I  44.76 
 
 
257 aa  228  1e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0648  methionine aminopeptidase, type I  51.83 
 
 
236 aa  226  2e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0618158  hitchhiker  0.00000114545 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2236  methionine aminopeptidase, type I  48.37 
 
 
254 aa  227  2e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0460012  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>