More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2876 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2876  peptidase M24  100 
 
 		 430 aa  895    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0874223  decreased coverage  0.00406602 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3457  peptidase M24  71.86 
 
 		 430 aa  672    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1524  hypothetical protein  59.86 
 
 		 421 aa  542  1e-153  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.518831 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04710  probable X-pro aminopeptidase  56.05 
 
 		 430 aa  524  1e-147  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0688  peptidase M24  55.48 
 
 		 430 aa  523  1e-147  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.142397  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3034  aminopeptidase P  54.08 
 
 		 428 aa  514  1e-144  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6929  peptidase M24  48.36 
 
 		 430 aa  441  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.430082  normal  0.840433 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1106  peptidase M24  48.95 
 
 		 427 aa  439  9.999999999999999e-123  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2770  xaa-pro aminopeptidase  35.93 
 
 		 436 aa  280  5e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0541  proline aminopeptidase P II  36.09 
 
 		 441 aa  269  7e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.597882  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0444  proline aminopeptidase P II  36.09 
 
 		 441 aa  268  2e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0805194  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0801  proline aminopeptidase P II  34.62 
 
 		 441 aa  265  1e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000590411  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02740  proline aminopeptidase P II  34.62 
 
 		 441 aa  264  2e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000920962  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3236  proline aminopeptidase P II  34.62 
 
 		 441 aa  264  2e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000420398  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3042  proline aminopeptidase P II  34.62 
 
 		 441 aa  264  2e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000751227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3329  proline aminopeptidase P II  34.4 
 
 		 441 aa  264  2e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000100618  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3067  proline aminopeptidase P II  34.62 
 
 		 441 aa  264  2e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000106171  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4201  proline aminopeptidase P II  34.62 
 
 		 441 aa  264  2e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000052463  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02703  hypothetical protein  34.62 
 
 		 441 aa  264  2e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000102485  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0784  peptidase M24  34.62 
 
 		 441 aa  264  3e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000264237  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0682  aminopeptidase P  34.85 
 
 		 439 aa  261  1e-68  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0390702  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00849  proline aminopeptidase P II  32.04 
 
 		 437 aa  258  2e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3327  proline aminopeptidase P II  33.33 
 
 		 437 aa  255  9e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0020606  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3475  proline aminopeptidase P II  36.6 
 
 		 441 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2008  Xaa-Pro aminopeptidase  33.57 
 
 		 427 aa  253  3e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0010826  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3217  proline aminopeptidase P II  33.1 
 
 		 438 aa  253  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00100894  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3291  proline aminopeptidase P II  33.1 
 
 		 438 aa  253  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.133072  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3229  proline aminopeptidase P II  33.1 
 
 		 438 aa  253  6e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000552442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3294  proline aminopeptidase P II  33.1 
 
 		 438 aa  253  6e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0229287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3396  proline aminopeptidase P II  32.64 
 
 		 438 aa  251  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00011206  normal  0.758857 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2854  xaa-pro aminopeptidase  33.96 
 
 		 414 aa  250  4e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2764  peptidase M24  33.41 
 
 		 454 aa  249  5e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2539  xaa-pro aminopeptidase  33.96 
 
 		 414 aa  249  6e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2579  peptidase M24  31.84 
 
 		 443 aa  249  8e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0860  proline aminopeptidase P II  33.49 
 
 		 437 aa  248  1e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000995662  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3594  proline aminopeptidase P II  35.94 
 
 		 442 aa  248  1e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0894  peptidase M24  33.79 
 
 		 449 aa  248  2e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0024  aminopeptidase P  31.67 
 
 		 445 aa  248  2e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.407188  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3827  proline aminopeptidase P II  33.49 
 
 		 437 aa  247  3e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000338921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0863  proline aminopeptidase P II  33.49 
 
 		 437 aa  247  3e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00955422  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2806  peptidase M24  35.42 
 
 		 416 aa  247  4e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.275182  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1982  xaa-pro aminopeptidase, putative  33.66 
 
 		 427 aa  245  9e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.174927  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0321  peptidase M24:peptidase M24B, X-Pro dipeptidase/aminopeptidase N-terminal  31.52 
 
 		 444 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.735607 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0091  hypothetical protein  31.17 
 
 		 436 aa  241  1e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3427  peptidase M24  32.96 
 
 		 439 aa  241  1e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5260  peptidase M24  31.08 
 
 		 444 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5967  aminopeptidase P  31.08 
 
 		 444 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1559  peptidase M24  31.28 
 
 		 443 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.287144  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5107  peptidase M24  31.01 
 
 		 444 aa  239  5e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.132845  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47330  Aminopeptidase P  31.14 
 
 		 444 aa  239  5.999999999999999e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2334  putative XAA-Pro aminopeptidase  32.58 
 
 		 433 aa  239  1e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.544372 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1764  peptidase M24  34.06 
 
 		 427 aa  237  2e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5200  peptidase M24  30.56 
 
 		 444 aa  237  2e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.322511  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0079  hypothetical protein  30.27 
 
 		 436 aa  238  2e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3513  aminopeptidase P  30.02 
 
 		 439 aa  237  4e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.135159  normal  0.871047 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5223  Xaa-Pro aminopeptidase  30.84 
 
 		 444 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69000  aminopeptidase P  30.86 
 
 		 444 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1906  Xaa-Pro aminopeptidase  34.23 
 
 		 427 aa  236  7e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0128902  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2438  peptidase M24  32.18 
 
 		 446 aa  235  1.0000000000000001e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000518121  hitchhiker  0.000000118983 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2815  Xaa-Pro aminopeptidase  32.18 
 
 		 446 aa  235  1.0000000000000001e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.269049  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3919  proline aminopeptidase P II  32.27 
 
 		 437 aa  235  1.0000000000000001e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000043495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0325  peptidase M24  30.61 
 
 		 444 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1712  Xaa-Pro aminopeptidase  33.17 
 
 		 426 aa  234  3e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5025  peptidase M24  30.11 
 
 		 444 aa  234  3e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.252533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0254  putative Xaa-Pro aminopeptidase (aminopeptidase P II) protein  32.41 
 
 		 454 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.26967 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1763  xaa-pro aminopeptidase  33.25 
 
 		 427 aa  233  6e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.996986  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1901  xaa-pro aminopeptidase  33.25 
 
 		 427 aa  233  6e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.111292  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2542  aminopeptidase P  32.18 
 
 		 437 aa  233  6e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.158286  normal  0.0283016 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1740  Xaa-Pro aminopeptidase  33.17 
 
 		 427 aa  232  7.000000000000001e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5434  aminopeptidase P  29.93 
 
 		 444 aa  233  7.000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0260977 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2549  peptidase M24  30.48 
 
 		 514 aa  232  9e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3343  peptidase M24  33.83 
 
 		 414 aa  231  1e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1936  putative xaa-pro aminopeptidase  33.33 
 
 		 427 aa  232  1e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.03576e-43 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0606  peptidase M24  32.56 
 
 		 439 aa  231  1e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0134  peptidase M24  32.18 
 
 		 439 aa  230  3e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3437  Xaa-Pro aminopeptidase  33.58 
 
 		 427 aa  230  4e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.644236  hitchhiker  0.0000000000133541 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0128  peptidase M24  31.58 
 
 		 440 aa  229  6e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2777  aminopeptidase P  31.47 
 
 		 436 aa  228  1e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0131  peptidase M24  31.94 
 
 		 439 aa  229  1e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.366962  decreased coverage  0.000000108006 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3935  peptidase M24  31.65 
 
 		 436 aa  228  2e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2689  peptidase M24  30.11 
 
 		 461 aa  228  2e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3662  aminopeptidase P  32.43 
 
 		 432 aa  227  3e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3337  peptidase M24  31.9 
 
 		 499 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.106603 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0614  peptidase M24  29.65 
 
 		 464 aa  224  2e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.178264 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1485  peptidase M24  32.51 
 
 		 413 aa  223  4e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2176  aminopeptidase P  33.99 
 
 		 426 aa  223  4.9999999999999996e-57  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.408367 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0848  peptidase M24B X-Pro dipeptidase/aminopeptidase domain-containing protein  32.14 
 
 		 442 aa  223  4.9999999999999996e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.283134  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1451  peptidase M24  32.78 
 
 		 447 aa  223  7e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.582435  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2146  aminopeptidase P  31.8 
 
 		 439 aa  223  7e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4599  aminopeptidase P  31.11 
 
 		 436 aa  223  7e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0588  peptidase M24  29.44 
 
 		 464 aa  223  7e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0966  aminopeptidase P  32.14 
 
 		 442 aa  222  9e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.309482  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1185  peptidase M24  31.14 
 
 		 452 aa  221  9.999999999999999e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3757  peptidase M24  30.94 
 
 		 435 aa  220  3e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.390253 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1534  xaa-pro aminopeptidase  31.07 
 
 		 441 aa  219  5e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000615425  normal  0.874412 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3502  peptidase M24  29.91 
 
 		 443 aa  219  8.999999999999998e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1821  peptidase M24  31.35 
 
 		 454 aa  217  4e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0438992  hitchhiker  0.0000000354037 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3781  aminopeptidase P  29.01 
 
 		 461 aa  216  8e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1254  Xaa-Pro aminopeptidase  29.66 
 
 		 611 aa  216  9e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3394  xaa-pro aminopeptidase  29.89 
 
 		 469 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>