More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1951 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1951  flavodoxin  100 
 
 		 148 aa  294  2e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0000425319  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0576  flavodoxin  48.61 
 
 		 148 aa  147  7e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3667  flavodoxin, short chain  45.83 
 
 		 148 aa  138  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1143  flavodoxin  43.92 
 
 		 148 aa  133  8e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3244  flavodoxin  41.89 
 
 		 147 aa  93.6  9e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000023193  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1095  flavodoxin  39.37 
 
 		 148 aa  93.2  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3559  flavodoxin  43.31 
 
 		 147 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000105724  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3649  flavodoxin  43.31 
 
 		 147 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000118678  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3555  flavodoxin  43.31 
 
 		 147 aa  90.5  8e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000142004  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1668  flavodoxin  42.52 
 
 		 147 aa  89.4  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000400583  hitchhiker  1.50261e-20 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3335  flavodoxin  42.52 
 
 		 147 aa  89.7  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000659666  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3300  flavodoxin  42.52 
 
 		 147 aa  89.7  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.31078e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3550  flavodoxin  42.52 
 
 		 147 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.52439e-45 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3596  flavodoxin  42.52 
 
 		 147 aa  89.7  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000203482  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1492  flavodoxin  36.22 
 
 		 148 aa  88.6  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1534  flavodoxin  36.22 
 
 		 148 aa  88.6  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3250  flavodoxin  41.73 
 
 		 154 aa  87  8e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000245665  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1290  flavodoxin  35.43 
 
 		 148 aa  85.9  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1262  flavodoxin  35.43 
 
 		 148 aa  85.9  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.384147  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1264  flavodoxin  35.43 
 
 		 148 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.126102  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1428  flavodoxin  35.43 
 
 		 148 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1298  flavodoxin  36.22 
 
 		 148 aa  85.9  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.223071  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1465  flavodoxin  35.43 
 
 		 148 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3916  flavodoxin  35.43 
 
 		 148 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1394  flavodoxin  34.48 
 
 		 138 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2878  flavodoxin FldA  33.61 
 
 		 169 aa  72.8  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0798  flavodoxin  31.55 
 
 		 168 aa  70.5  0.000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0163  flavodoxin  36.22 
 
 		 145 aa  69.7  0.00000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1456  flavodoxin  35.71 
 
 		 143 aa  68.9  0.00000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0164  flavodoxin FldA  31.97 
 
 		 170 aa  69.3  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.243866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1541  flavodoxin FldA  31.71 
 
 		 170 aa  69.3  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.325329  normal  0.0252615 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3536  flavodoxin  33.87 
 
 		 164 aa  66.6  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000193054  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0757  flavodoxin  38.02 
 
 		 168 aa  66.6  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.66509  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2419  flavodoxin  35.48 
 
 		 176 aa  63.5  0.0000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1666  flavodoxin FldA  37.4 
 
 		 171 aa  63.2  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.122613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2045  flavodoxin  35 
 
 		 168 aa  63.2  0.000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000806437  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0306  flavodoxin  42.55 
 
 		 140 aa  62  0.000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1237  flavodoxin  32.26 
 
 		 179 aa  61.6  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000241409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004124  flavodoxin 1  31.15 
 
 		 177 aa  60.8  0.000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000570149  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1207  flavodoxin FldA  32.79 
 
 		 175 aa  60.5  0.000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000563354  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1199  flavodoxin FldA  32.79 
 
 		 176 aa  60.5  0.000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000181933  hitchhiker  0.00018565 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3124  flavodoxin FldA  31.97 
 
 		 175 aa  59.7  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000347924  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0850  flavodoxin FldA  33.33 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.000000167228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0814  flavodoxin FldA  32.79 
 
 		 176 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000448874  normal  0.266215 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1929  flavodoxin FldA  33.85 
 
 		 163 aa  58.9  0.00000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.314871  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0699  flavodoxin  32.28 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1148  flavodoxin  30.72 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000105619  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0753  flavodoxin FldA  32.79 
 
 		 176 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000155637  normal  0.213814 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0741  flavodoxin FldA  33.33 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000041401  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0801  flavodoxin FldA  33.33 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000015287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0860  flavodoxin  31.15 
 
 		 169 aa  58.5  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000640171  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2335  flavodoxin  32.14 
 
 		 143 aa  58.2  0.00000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0460226  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1685  flavodoxin FldA  31.15 
 
 		 175 aa  57.8  0.00000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000671882  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01341  flavodoxin FldA  30.33 
 
 		 177 aa  58.2  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0557  flavodoxin  33.33 
 
 		 168 aa  57.8  0.00000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.313474 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2990  flavodoxin FldA  31.97 
 
 		 175 aa  57.8  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000344079  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2901  flavodoxin FldA  31.97 
 
 		 175 aa  57.8  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  4.63473e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0321  flavodoxin FldA  31.97 
 
 		 175 aa  57.8  0.00000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000460147  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2938  flavodoxin  31.97 
 
 		 175 aa  57.4  0.00000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0248882  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0110  flavodoxin FldA  36.44 
 
 		 162 aa  57.4  0.00000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1917  flavodoxin FldA  32.79 
 
 		 175 aa  57.4  0.00000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000679628  unclonable  0.00000189702 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0566  flavodoxin FldA  32.48 
 
 		 215 aa  57  0.00000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  6.83272e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1118  flavodoxin  31.15 
 
 		 175 aa  57  0.00000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2890  flavodoxin  31.88 
 
 		 154 aa  57  0.00000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0712  flavodoxin FldA  32.48 
 
 		 215 aa  57  0.00000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000898248  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0731  flavodoxin FldA  32.48 
 
 		 215 aa  57  0.00000009  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.8987999999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00641  flavodoxin 1  31.97 
 
 		 176 aa  57  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000985798  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2953  flavodoxin  31.97 
 
 		 176 aa  57  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000283626  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0779  flavodoxin FldA  31.97 
 
 		 176 aa  57  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000185932  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2986  flavodoxin  28.37 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00632  hypothetical protein  31.97 
 
 		 176 aa  57  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000788161  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0706  flavodoxin FldA  31.97 
 
 		 176 aa  57  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000789352  normal  0.640878 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00955  flavodoxin FldB  31.97 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0835  flavodoxin FldA  31.97 
 
 		 175 aa  56.6  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2972  flavodoxin FldA  31.97 
 
 		 176 aa  57  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000017596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2051  flavodoxin FldA  31.97 
 
 		 175 aa  56.2  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000064376  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1858  flavodoxin FldA  33.61 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1457  flavodoxin FldA  27.27 
 
 		 186 aa  55.8  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0079  flavodoxin  30.83 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45950  flavodoxin I  34.4 
 
 		 174 aa  55.5  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1996  flavodoxin FldB  30.33 
 
 		 198 aa  55.5  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2698  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  27.66 
 
 		 626 aa  55.1  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1706  flavodoxin  31.08 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2643  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  27.66 
 
 		 629 aa  55.1  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10550  flavodoxin  33.33 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000166054  hitchhiker  0.0000000116107 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3305  flavodoxin FldB  35.79 
 
 		 172 aa  55.1  0.0000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0133036  normal  0.742864 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10970  flavodoxin, short chain  32.5 
 
 		 140 aa  54.3  0.0000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.695336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1472  flavodoxin FldB  30.15 
 
 		 176 aa  53.9  0.0000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2559  flavodoxin  35.82 
 
 		 182 aa  53.9  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2337  flavodoxin  30.33 
 
 		 176 aa  52.8  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000157919  hitchhiker  0.0000735026 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004442  flavodoxin 2  32.5 
 
 		 172 aa  53.1  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1365  flavodoxin, long chain  33.33 
 
 		 171 aa  53.5  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.180035  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0773  molybdopterin oxidoreductase  33.06 
 
 		 1407 aa  53.1  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0561  flavodoxin FldB  33.33 
 
 		 172 aa  53.1  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.81104  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4431  flavodoxin  34.92 
 
 		 175 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0376  flavodoxin FldA  33.08 
 
 		 163 aa  52  0.000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000140694  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1438  flavodoxin  27.54 
 
 		 154 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1269  flavodoxin FldA  32.2 
 
 		 162 aa  52.8  0.000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.829769  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1341  flavodoxin  30.22 
 
 		 154 aa  52.8  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3054  flavodoxin FldB  26.47 
 
 		 173 aa  52  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>